Geri Dön

Cloning and characterization of a gene cluster encoding toluene monooxygenase from Bradyrhizobium sp. BTAi1

Bradyrhizobium sp. BTAi1 suşundan toluen monooksijenaz genlerinin klonlanması ve karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 318633
  2. Yazar: KÜBRA CANSU YANIK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. GÖNÜL SCHARA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyomühendislik, Genetik, Bioengineering, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Fatih Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 122

Özet

Bakteri kökenli toluen monooksijenaz enzimleri, çeşitli aromatik hidrokarbonları okside etmeleri, bir çok klorlu etenleri indirgemeleri ve önemli endüstriyel bileşikleri üretmeleri yönünden bilinirler. Bu enzimler; Burkholderia cepacia G4 suşundan izole edilen toluen-orto-monooksijenaz (TOM), Ralstonia pickettii PKO1 suşundan izole edilen toluen-para-monooksijenaz (TpMO), Pseudomonas mendocina KR1 suşundan izole edilen toluene-4-monooksijenaz ve Pseudomonas sporium OX1 suşundan elde edilen toluen/oksilen monooksijenazdır. Biyoremidasyon ve yeşil kimya alanlarındaki önemlerine rağmen, oksidasyon kapasiteleri çevreyle sınırlıdır. Bradyrhizobium sp. BTAi1 suşu, fotosentetik rizosfer bakteridir ve baklagillerin köklerinde yaşarlar. Genomunda bulunan 5100 bazlık bir bölge amino asit yönünden, ToMO ile %38.5, T4MO ile %37.7, TpMO ile %40.6 ve TOM ile %17.2 benzerlik göstermektedir. Bu çalışmada, 5100 bazlık bölgeyi oluşturan yeni enzim başarıyla Escherichia coli TG1 suşuna klonlanmış olup, aromatic hidrokarbonları oxidasyonu ve klorlu etenleri indirgemeleri karakterize edilmiştir. Sonuçlar, pBS(Kan)Tmo.BTAi1 enziminin para-hidroksile enzimi olduğunu göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Bacterial toluene monooxygenases are known for their ability to oxidize a wide range of aromatics, degrade a variety of organic pollutants, and produce industrially-important compounds. These enzymes include toluene ortho-monooxygenase (TOM) of Burkholderia cepacia G4, toluene-para-monooxygenase (TpMO) of Ralstonia pickettii PKO1, toluene-4-monooxygenase (T4MO) of Pseudomonas mendocina KR1, and toluene o-xylene monooxygenase (ToMO) of Pseudomonas sp. OX1. Although they have great potential in bioremediation and green chemistry applications, their ability of oxidation is still have limitations and discovery of the new toluene monooxygenases are needed. Bradyrhizobium sp. BTAi1 is a photosynthetic rhizosphere bacterium that lives in the root of leguminous plant and the 5100 bp length region in its genome shows 38.5% amino acid similarity with ToMO, 37.7% with T4MO, 40.6% with TpMO and 17.2% with TOM. In this study, a new toluene monooxygenase from Bradyrhizobium sp. BTAi1 was successfully cloned and expressed in Escherichia coli TG1 and characterized for its ability to hydroxylate aromatic hydrocarbons such as toluene, benzene, phenol, nitrobenzene, p-nitrophenol and naphthalene and to degrade trichloroethylene.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    119477

    Cloning, characterization and heterologons expression of the aspartokinase and aspartate semialdehyde dehydrogenase genes from the cephamycin C producer streptomyces clavuligerus

    Sefamisin C üreticisi streptomyces davuligerus'un aspartokinaz ve aspartat semialdehid dehidrojenaz genlerinin klonlanması, karakterizasyonu ve heterolog ekspresyonu

    SEDEF TUNCA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ

    PROF. DR. JACQUELİNE PİRET

  2. Tez No

    374136

    Halofilik ve halotolerant aktinomisetlerin izolasyonu, karakterizasyonu, NRPS ve PKS Gen kümelerinin moleküler tanımlanması

    Isolation, characterization of halophilic and halotolerant actinomycetes and molecular identification of their NRPS and PKS Gene clusters

    DEMET TATAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEVZAT ŞAHİN

  3. Tez No

    400840

    Function of the mouse PIWI proteins and biogenesis of their piRNAs in the male germline

    Başlık çevirisi yok

    ERGİN BEYRET

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    BiyolojiDuke University

    DR. HAIFAN LIN

  4. Tez No

    153474

    Cloning and characterization of industrially important alpha-galactosidase genes from the human pathogen aspergillus fumigatus

    Alfa-galatosidaz genlerinin insan patojeni aspergillus fumigatusdan klonlaması ve karakterizasyonu

    BETÜL SÖYLER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2004

    Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK BAKIR

  5. Tez No

    450935

    Cloning of a cDNA encoding laccase from coriolopsis polyzona MUCL 38443 and expression in Pichia pastoris

    Coriolopsis polyzona MUCL 38443'ten lakkaz kodlayan bir cDNA'nın klonlanması ve Pichia pastoris'te ifade edilmesi

    ORKUN PİNAR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN KARATAŞ

Geri Dön