Increasing clavulanic acid production both in wild type and industrial streptomyces clavuligerus strains by amplification of positive regulator claR gene
Pozitif regülatör claR geninin amplifikasyonuyla yabanıl ve endüstriyel streptomyces clavuligerus suşlarında klavulanik asit üretiminin artırılması
- Tez No: 318951
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 117
Özet
Gram-pozitif, ipliksi bir bakteri olan Streptomyces clavuligerus, biyoteknolojik açıdan önemli izopenisilin N, sefamisin C ve klavulanik asit gibi birçok sekonder metaboliti sentezleme yeteneğine sahiptir. Bu bileşikler arasında bir ß-laktamaz inhibitörü olan klavulanik asit, yaygın olarak kullanılan ß-laktam antibiyotiklerine dirençli bakteriyel enfeksiyonların tedavisinde bu antibiyotikler ile bir arada kullanılmaktadır. Bu kombinasyonların arasında amoksisilin ve klavulanik asit karışımı olan Augmentin, yıllık bir milyar doları aşan pazar değeri ile kullanımı en yaygın olan ilaçlardan biridir. Klavulanik asit biyosentezinin regülasyonunda görevli iki gen bulunmaktadır: sefamisin C gen kümesinde yer alan ccaR ve klavulanik asit gen kümesinde yer alan claR. Bu çalışmanın temel amacı, entegrasyon vektörü kullanılarak claR geninin ekstra kopyalarının S. clavuligerus genomuna aktarılması ve aynı zamanda bir başka çok kopyalı plasmid vektörü vasıtasıyla hücre içerisinde bu regulatör genin normalin üzerinde ifade edilmesiyle yabanıl ve endüstriyel S. clavuligerus suşlarının klavulanik asit sentez kapasitelerinin artırılmasıdır. Daha önceki çalışmalarda, standart S. clavuligerus suşunda claR geninin çoklu ifadesinin oldukça etkin olduğu gösterilmesine ragmen bu çalışmada kullanılan endüstriyel suşda genin genoma entegrasyonu ya da çoklu ifadesi durmunda en çok 1.4-katlık volumetrik (MA28 suşu ile) ve 1.7-katlık spesifik (MA16 suşu ile) klavulanik asit üretimi sağlanabilmiştir.
Özet (Çeviri)
Streptomyces clavuligerus is a Gram-positive, filamentous bacterium which produces several important secondary metabolites, including isopenicillin N, cephamycin C and the ß-lactamase inhibitor clavulanic acid. Among these compounds, clavulanic acid is being used in combination with commonly used ß-lactam antibiotics in order to fight against bacterial infections that are resistant to such antibiotics. Among these combinations, Augmentin, composed of amoxicillin and clavulanic acid, is the most widely prescribed drug and has a market value of more than one billion dollars per year. There are two genes that act in regulation of clavulanic acid biosynthesis: ccaR located in cephamycin C gene cluster and claR located in clavulanic acid gene cluster. The goal of this study is to improve clavulanic acid production capacities of both wild type and industrial S. clavuligerus strains by integrating extra copies of claR gene into S.clavuligerus genome and its overexpression via a multicopy plasmid. Although previously has shown to be quite effective on wild type S. clavuligerus strains, claR overexpression in the industrial strain used in this study yielded only 1.4-fold increase in volumetric and 1.7-fold increase in specific CA production by the recombinant strains MA28 and MA16, respectively.
Benzer Tezler
- Streptomyces Clavuligerus'ta lysa geninin çoklu ifadesi ve sefamisin c biyosentezi üzerine etkisi
Effect on cephamycin c biosynthesis and multiple expression of lysa gene in Streptomyces Clavuligerus
ÇİĞDEM OTUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ASLIHAN KURT KIZILDOĞAN
- Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella spp. suşlarının karbapenem ve beta-laktamaz inhibitörlü kombinasyonlara karşı duyarlılıklarının araştırılması
Investigation of the susceptibility of extended spectrum beta-lactamase producing escherichia coli and klebsiella spp. to carbapenems and beta-lactamase inhibitor combinations
PINAR (YÜCE) FIRAT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıFırat ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KUTBETTİN DEMİRDAĞ
- Hastanemizde izole edilen haemophilus influenzae kökenlerinin antibiyotiklere direnç durumu
Antibiotic resistance of haemophilus influenzae origins that isolated in our hospital
MELTEM KÜÇÜKEROL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR GÖKBOĞA
- Hastane kökenli Stenotrophomonas maltophilia suşlarında prognozla ilişkili genetik karakterlerin irdelenmesi
Investigation of the prognostic genetic characteristics of the hospital-acquired Stenotrophomonas maltophilia strains
FUNDA DOĞRUMAN AL
Doktora
Türkçe
2016
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADİR SERDAR DİKER
- Karbapenem dirençli pseudomonas ve acınetobacter türlerinde metallo-betalatamaz (mbl) varlığının araştırılması ve etkileyen risk faktörlerinin incelenmesi
The detection of production metallo-betalactamase (mbl) in carbapenem resistant acinetobacter and pseudomonas species and investigation of risk factors
SUNA SEÇİL ÖZTÜRK DENİZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık BakanlığıKlinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURCAN BAYKAM