Levrek balığı (Dicentrarchus labrax L. 1758) vitellojen genlerinin karakterizasyonu
Characterization of vitellogenin genes in European sea bass (Dicentrarchus labrax)
- Tez No: 323214
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SADİ KOKSOY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 157
Özet
ÖZETLEVREK BALIĞI (Dicentrarchus labrax L. 1758) VİTELLOJEN GENLERİNİN KARAKTERİZAYONUÖzlem YILMAZDoktora Tezi, Su Ürünleri Mühendisliği Anabilim DalıDanışman: Doç. Dr. Sadi KÖKSOYMart 2013, 136 sayfaBu çalışmada, levrek (Dicentrarchus labrax) balığında üç ayrı vitellojeni kodlayan cDNA dizileri elde edilmiştir. Yumurta sarısı protein alt birimlerinin hepsini taşıyan iki çeşit vitellojen, günümüzde geçerli olan adlandırma kullanılarak VtgAa ve VtgAb olarak tanımlanmıştır. Fosvitinden yoksun, daha kısa bir cDNA ile kodlanan ve kesilmiş bir C-ucu bölgesine sahip olan `eksik' (incomplete) bir diğer vitellojen formu ise VtgC olarak tanımlanmıştır. Levrek vitellojen cDNA dizilerinden elde edilen tahmini peptid dizilerinin, diğer teleost türlere ait dizilerle ve birincil protein yapılarıyla yapılan kıyaslamalar sonucu, bu diziler kesin olarak levrek vitellojenleri; SbsVtgAa, SbsVtgAb ve SbsVtgC olarak tanımlanmışlardır. Her bir vitellojenin dişi ve 17ß-estradiol ile uyarılmış olan erkek kan plazmasındaki ve ovaryumdaki varlığı, kefal (Mugil cephalus) lipovitellinlerine karşı geliştirilmiş olan vitellojen formuna özgün antikorlar kullanılarak Western blot analizi ile ortaya konmuştur. Bu yöntem yardımıyla, ayrıca üç farklı vitellojenden türemiş yumurta sarısı protein alt birimlerinin büyümeyi tamamlamış (postvitellojenik) ve ovulasyona uğramış yumurtadaki varlığı da belirlenmiştir. Postvitellojenik ve ovulasyon aşamalarındaki ovaryum ekstraktlarının Western blot analiz sonuçlarının karşılaştırmaları, her üç çeşit vitellojenden türemiş lipovitellinlerin oosit olgunlaşması sırasında kısmi bir proteolize uğradığını göstermiştir. Her üç vitellojen ve bunların türevi yumurta sarısı protein ürünlerinin, oosit büyümesini tamamlamış postvitellojenik dişilere ait karaciğer, plazma ve ovaryumundaki miktarları ve birbirlerine göre oranları, işaretsiz niceliksel kütle spektrometrisi ile belirlenmiştir. Normalize edilmiş spektra sayılarına dayanarak VtgAa ve VtgAb'nin levrekte bulunan baskın vitellojen formları oldukları ve VtgAb'nin analiz edilen örnek tipine göre VtgAa'dan 2 ila 5 kat arasında daha yüksek miktarlarda bulunduğu tespit edilmiştir. Karaciğer ve plazmada genel olarak düşük seviyelerde bulunan VtgC ortalama spektra sayısının, ovaryumda diğer dokulara göre daha yüksek olduğu görülmüştür. Ayrıca ovaryumda VtgC miktarının, VtgAa ve VtgAb'den sırasıyla yalnızca 0.5 ila 3.0 kat daha düşük olduğu belirlenmiştir. Bu çalışmada, diğer acantomorph teleostlarda bilinen çoklu vitellojen sisteminin levrekte de var olduğu belirlenmiştir. Ayrıca burada, söz konusu sistemin önemli bir parçası olan vitellojenlerin her üç formunun da gelişmekte olan oosit ve yumurtalarda, yumurta sarısı protein depolarına önemli katkıları olduğu ortaya konmuştur. Levrekte bu konuda yapılan ilk çalışmanın ürünü olan bu bulgular, su ürünleri sektöründe yetiştiriciliğe uygun türlerin yumurta kalitesi ve başta vitellogenez olmak üzere, oogenez sürecinde gerçekleşen olaylar dizini üzerine yapılacak moleküler ve fonksiyonel çalışmalara temel oluşturacaktır.ANAHTAR KELİMELER: Levrek, Dicentrarchus labrax, Ovaryum, Oosit, Teleost, Oogenez, Vitellojen, Yumurta sarısı
Özet (Çeviri)
ABSTRACTCHARACTERIZATION OF VITELLOGENIN GENES in EUROPEAN SEA BASS (Dicentrarchus labrax)Özlem YILMAZPhD in Fisheries SciencesSupervisor: Assoc. Prof. Dr. Sadi KÖKSOYMarch 2013, 136 pagesComplete cDNA sequences encoding three different vitellogenin genes were obtained for European sea bass (Dicentrarchus labrax). Two cDNAs encoding vitellogenins with a full suite of yolk protein domains were identified as sea bass VtgAa and VtgAb using the current nomenclature for multiple teleost vitellogenins. A shorter cDNA encoded an ?incomplete? vitellogenin lacking a phosvitin domain and having an abbreviated C-terminus that was identified as sea bass VtgC. Alignments of the deduced vitellogenin peptide sequences with those from other teleosts, and similar comparisons of primary vitellogenin structures, allowed definitive identification of sea bass VtgAa, VtgAb and VtgC. The existence of each form of vitellogenins in the blood plasma, and of their product lipovitellin-derived yolk proteins in oocytes or eggs, was verified via Western blotting performed using vitellogenin type-specific antisera raised against grey mullet (Mugil cephalus) lipovitellins, which also detected all three forms of vitellogenins in plasma from males injected with estradiol-17ß. Comparisons of ovary extracts from postvitellogenic and ovulated females via Western blotting revealed that the lipovitellins derived from all three forms of vitellogenins undergo partial proteolysis during oocyte maturation. The peptide abundance and the proportional ratio of the three vitellogenins or their yolk protein products present in liver, plasma and ovary was evaluated in postvitellogenic females just completing oocyte growth via label free quantitative mass spectrometry. Based on normalized spectral counts, VtgAa and VtgAb are the dominant types of vitellogenin in sea bass, with VtgAb spectra being from 2- to 5-fold more abundant than VtgAa spectra depending on the sample type. The VtgC spectra were generally very limited, except in ovary, where they were only 0.5- to 3.0-fold lower in abundance than for VtgAa and VtgAb, respectively. This first report on the multiple vitellogenin system of D. labrax shows that all three forms of vitellogenin described for acanthomorph teleosts are produced by this species and that each type of vitellogenin contributes significantly to the store of yolk proteins deposited in growing oocytes and eggs. These findings set the stage for functional studies of the molecular details of vitellogenesis underlying oogenesis and egg quality in this important aquaculture species.KEYWORDS: Sea bass Dicentrarchus labrax, Ovary, Oocyte, Teleost, Oogenesis, Vitellogenin, Yolk
Benzer Tezler
- Levrek balığı (Dicentrarchus labrax l.1758)' nın pastırma olarak değerlendirilmesi
Evaluation of seabass (Dicentrarchus labrax l.1758) as pastirami
ZEHRA BABUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Su ÜrünleriMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiSu Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TAÇNUR BAYGAR
- Orta Karadeniz bölgesinde ağ kafeslerde levrek balığı (Dicentrarchus labrax L., 1758) yetiştiriciliği
Sea bass (Dicentrarchus labrax L., 1758) culture in net cages in the cental of the Black Sea
RECEP ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Su ÜrünleriSinop ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDAT KARAYÜCEL
- Levrek (dicentrarchus labrax) larva yetiştiriciliğinde ışığın larva gelişimine etkileri üzerinde bir araştırma
A Research about larvae production of seabass (dicentrarchus labrax) effects of light on larvae growing
İSA TEKŞAM
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
Su ÜrünleriSüleyman Demirel ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZNUR DİLER
- Levrek (Dicentrarchus labrax L. 1758) balıkları yemlerine kanola unu ve fitaz enzimi ilavesinin; büyüme ve yem değerlendirme parametreleri üzerine etkileri
The effect of dietary canola meal and phytase incorporation on growth and feed utilization parameters in European sea bass (Dicentrarchus labrax L. 1758)
NAZAN ÇEVİK
Doktora
Türkçe
2011
Su ÜrünleriÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ADEM TEKİNAY
- Yeme eklenen bazı tıbbi bitkilerin levrek balığında (Dicentrarchus labrax L., 1758) büyüme performansı, yem kullanımı ve kan parametrelerine etkisi
Effects of dietary medicinal herbs on growth performance, feed utilization and blood paramereters of sea bass (Dicentrarchus labrax L., 1758)
SEVDAN YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyokimyaÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEBAHATTİN ERGÜN