Geri Dön

Tavuk dışkılarından izole edilen Escherichia coli suşlarında ağır metal dirençliliğinin belirlenmesi

Detection of heavy metal resistance of Escherichia coli strains isolated from chicken?s feces

PDF İndir

  1. Tez No: 324052
  2. Yazar: OYA TEKİN BALIK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MÜJGAN İZGÜR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Ağır Metal Direnci, Escherichia coli, PCR, Tavuk dışkısı, Chicken feces, Escherichia coli, Heavy Metal Resistance, PCR
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Tavuk Dışkılarından İzole Edilen Escherichia coli suşlarında Ağır Metal Dirençliliğinin BelirlenmesiBu çalışmada tavuk dışkılarından izole edilen Escherichia coli suşlarının, ağır metallere direncinin fenotipik ve genotipik olarak araştırılması amaçlandı.Çalışmada, identifiye edilen 105 adet E. coli suşunda antibiyotik duyarlılık testleri Kirby-Bauer ve ağır metal dirençlilik testleri MIC (Minimal İnhibisyon Konsantrasyon) ile fenotipik yöntemleriyle araştırıldı. Antibiyogram testi sonucunda izolatların; 15 (%14,2)'i Siprofloksasin'e, 52 (%49,5)'i Gentamisin'e, 97 (%92,3)'i Seftazidim'e, 24 (%22,8)'ü Kanamisin'e, 1 (%0,9)'i Sülfametoksazol'e duyarlı; 21 (%20)'i Siprofloksasin'e, 5 (%4,7)'i Gentamisin'e, 1 (%0,9)'i Seftazidim'e, 2 (%1,9)'i Kanamisin'e orta derecede duyarlı; 69 (%65,7)'u Siprofloksasin'e, 48 (%45,7)'i Gentamisin'e, 8 (%7,6)'i Seftazidim'e, 105 (%100)'i Vankomisin'e, 79 (%75,2)'u Kanamisin'e, 104 (%99,0)'ü Sülfametoksazol'e dirençli olarak bulundu. 105 E. coli suşu MIC değerleri izolatların; Kadmiyum-klorür dihidrat (CdCl2.2H2O) için, 15 (%14,3)'inde; kurşun-nitrat (Pb(NO3)2 için, 85 (%80,9)'inde; bakır-sülfat pentahidrat (CuSO4.5H2O) için, 8 (%7,6)'inde; civa-klorür (HgCl2) için, 3 (%2,8)'ünde ve mangan-klorür dihidrat (MnCl2.2H2O) için, 87 (%82,8)'sinde tespit edildi.Direnç genlerini içeren Sınıf I İntegron varlığının genotipik olarak saptanması için intI1 geni PCR tekniği kullanılarak; Kadmiyum-klorür dihidrat (CdCl2.2H2O), kurşun-nitrat (Pb(NO3)2, bakır-sülfat pentahidrat (CuSO4.5H2O), civa-klorür (HgCl2) ve mangan-klorür dihidrat (MnCl2.2H2O) ağır metal dirençliliğinin genotipik olarak araştırılması için sırası ile zntA, pcoR, merA ve mntR genlerinin varlığı DNA'da ve izolasyonu yapılarak varlığı tespit edilen plazmid DNA'sında PCR tekniği kullanılarak araştırıldı.105 E. coli suşunda PCR ile DNA'da araştırılan intI1 geni 77 (%73,3) suşta tespit edilirken, ağır metal dirençlilik sonuçları ise, zntA geni 103 (% 98,0), pcoR geni 7 (%6,6), merA geni 5 (% 4,7) ve mntR geni 101 (%96,1) olarak saptandı. Plazmid izolasyonu ile E. coli suşlarında plazmid varlığı araştırıldı ve DNA'larının ölçülebilen 103 adedinde 10 kb'den daha yüksek (%98,0) olduğu bulundu. 2 adet suşta ise plazmid varlığı tespit edilemedi. Ağır metallerde MIC değerleri dirençli tespit edilen suşların, plazmid DNA'larında varlığı PCR ile araştırıldı; zntA geni 12 (%80,0) suşta tespit edilirken, 3 (%20,0) suşta tespit edilemedi; pcoR geni 3 (%37,5) suşta tespit edilirken, 5 (%62,5) suşta tespit edilemedi; merA geni 2 (%66,6) suşta tespit edilirken, 1 (%33,3) suşta tespit edilemedi; mntR geni 85 (%97,7) suşta tespit edilirken, 3 (%3,4) suşta tespit edilemedi.Sonuç olarak incelenen çeşitli ağır metallerin direncinin saptanmasında fenotipik yöntemler ile PCR tekniği uyumluluk göstermesine karşın, fenotipik olarak direncin saptanamadığı bazı suşlarda PCR tekniğini ile direncin saptanması, moleküler çalışmaların daha ayrıntılı olarak sonuç almada yarar sağladığını ve her iki yöntemin bir arada kullanılmasının daha güvenilir bir sonuç elde etmek için önemli olduğunu ortaya koydu. Ayrıca fenotipik olarak var olan direncin her zaman DNA'dan ve plazmid DNA'sından eksprese edilemediği belirlendi.

Özet (Çeviri)

Deterination of heavy metal resistance in Escherichia coli strains isolated from chicken fecesThe aim of this study was to investigate phenotypic and genotypic resistance to heavy metals in Escherichia coli isolated from chicken feces.In the study, identified 105 E. coli strains antibiotic susceptibility test with Kirby-Bauer and heavy metal resistant test with MIC (Minimum Inhibition Concentration) were phenotypically investigated. As a result of antibiogram test; susceptible rate was,15 (%14,2) to Ciprofloxacin, 52 (%49,5) to Gentamicin, 97 (%92,3) to Ceftazidime, 24 (%22,8) to Kanamycin, 1 (%0,9) to Sulphametoxazol; intermediate rate was, 21 (%20) to Ciprofloxacin, 5 (%4,7) to Gentamicin, 1 (%0,9) to Ceftazidime, 2 (%1,9) to Kanamycin; resistance rate was, 69 (%65,7) to Ciprofloxacin, 48 (%45,7) to Gentamicin, 8 (%7,6) to Ceftazidime, 105 (%100) to Vancomycin, 79 (%75,2) to Kanamycin, 104 (%99,0) to Sulphametoxazol. 105 E. coli strain MIC values were detected; for Cadmium-chloride dihydrate (CdCl2.2H2O) 15 (%14,3), lead-nitrate (Pb(NO3)2) 85 (%80,9), copper-sulphate pentahydrate (CuSO4.5H2O) 8 (%7,6), mercury-chloride (HgCl2) 3 (%2,8) and manganese-chloride dihydrate (MnCl2.2H2O) 87 (%82,8).Class I Integron, which includes resistance genes, investigated with intI1 gene used PCR techniques; Cadmium-chloride dihydrate (CdCl2.2H2O), lead-nitrate (Pb(NO3)2), copper-sulphate pentahydrate (CuSO4.5H2O), mercury-chloride (HgCl2) and manganese-chloride dihydrate (MnCl2.2H2O) heavy metals genotypic resistance in order to zntA, pcoR, merA, and mntR genes presence of in the DNA and plasmid DNA, which was detected from making use of isolation, were investigated by PCR. 77 (%73.3) strains were detected from 105 E. coli strains intI1 gene in the DNA investigated by PCR; the results of heavy metal resistance from zntA gene 103 (% 98,0), pcoR gene 7 (%6,6), merA gene 5 (% 4,7) and mntR gene 101 (%96,1) was detected. By isolation of plasmid from E. coli strain investigated in the presence of plasmid and higher than 10 kb DNA can be measured in number of 103 (98.0%) were found to be. 2 pieces in the strain could not be determined in the presence of plasmid. MIC values of strains resistant to heavy metals, in the presence of plasmid DNA was investigated by PCR; zntA gene 12 (%80,0) strains were detected, 3 (%20,0) isolates could not be determined; pcoR gene 3 (%37,5) strains were detected, 5 (%62,5) isolates could not be determined; merA gene 2 (%66,6) strains were detected, 1 (%33,3) isolates could not be determined; mntR gene 85 (%97,7) strains were detected, 3 (%3,4) isolates could not be determined.As a result, the detection of phenotypic resistance to heavy metals investigated a variety of methods to show compliance with the PCR technique, but phenotypic resistance was detected by PCR determination of drug resistance in some strains, making the result more beneficial for molecular studies and the use of a combination of the two methods is important in order to obtain more reliable results revealed. In addition, existing phenotypic expression of resistance cannot be always identified DNA and plasmid DNA.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    578031

    Tavuk dışkılarından izole edilen escherichia coli'lerde plazmit aracılı kolistin direnci sağlayan MCR--1 geninin araştırılması

    Investigation of the plasmid mediated colistin resistance gene MCR-1 in escherichia coli isolates from chicken feces

    NİLÜFER ERZAİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERKAN İKİZ

  2. Tez No

    851727

    Sağlıklı tavuk dışkılarından ve çevresel materyallerden izole edilen Escherichia coli suşlarının kolistin ve çoklu antibiyotik dirençliliklerinin araştırılması ve genotiplendirilmesi

    Investigation of colistin and multiple antibiotic resistances of Escherichia coli strains isolated from healthy chicken stools and environmental samples and geneotyping these strains

    ALİ SERDAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARZU FINDIK

  3. Tez No

    138310

    Sağlıklı görünen hayvanların dışkılarından izole edilen escherichia coli suşlarının biyokimyasal, enterotoksijenik ve verotoksijenik özelliklerinin belirlenmesi

    Determination of biochemical, enterotoxigenic and verotoxigenic properties of escherichia coli strains isolated from faeces of healty animals

    TİMUR GÜLHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BANUR BOYNUKARA

  4. Tez No

    870080

    Tavuk dışkılarından izole edilen Salmonella serovarlarının antibiyotik direnç profillerinin araştırılması

    Investigetion of antibiotic resistance profiles of Salmonella serovars isolated from chicken feces

    NUR SELCEN AKKAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEYYAL AK

    DOÇ. DR. MEHMET CEMAL ADIGÜZEL

  5. Tez No

    138320

    Bazı kanatlıların dışkılarında salmonella türlerinin varlığı ve yaygınlığı ile antibiyotiklere duyarlılığı

    The occurance and prevalence salmonella species in faeces of certain fowls and their susceptibility to antibiotics

    ABDULBAKİ AKSAKAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BANUR BOYNUKARA

Geri Dön