Geri Dön

Puccinia striiformis f. sp. tritici aday patojen efektör geninin polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılması ve klonlanması

Başlık çevirisi mevcut değil.

  1. Tez No: 324812
  2. Yazar: NASİBE TEKİNER
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HATİCE ÖĞÜTÇÜ, PROF. DR. MAHİNUR SEZENER AKKAYA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Buğday, Puccinia striiformis f. sp. tritici, bitki immün sistemi, klonlama, protoplast, Wheat, Puccinia striiformis f. sp. tritici, plant immune system, cloning, protoplas
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ahi Evran Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 64

Özet

Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst), buğdayda sarı pas hastalığına sebep olan obligat, biotrofik bir mantardır ve dünya çapında buğdaya en fazla zarar veren patojendir. Başta Türkiye olmak üzere dünya buğday üretimi için en büyük problemlerden birini oluşturmaktadır.Bu tez çalışmasında, direnç mekanizmasında rolü olduğu düşünülen Pst?ye ait aday efektör gen PstHa12j12?nin 342 baz uzunluğunda olan kısmı sentezlettirilmiştir.Sentezletirilen gen fragmanının 180 baz uzunluğundaki bölüme özgün primerler dizayn edildi. Polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile çoğaltıldı ve susturma vektörü olan pSL039B-1 vektörüne klonlanması amaçlandı. Daha ileriki aşamada Avocet Yr10 buğday çeşidinden enzimatik yolla protoplast hücrelerinin izolasyonu amaçlandı. PZR ile PstHa12j12 gen fragmanı çoğaltımı başarıyla gerçekleşti ve transformasyon sonucu klonlar elde edildi. Sekansa gönderilen klonların analiz sonuçlarına göre klonlama işleminin başarısız oldu, Avocet Yr10?den protoplast izolasyonu gerçekleşti fakat büyümeleri için konuldukları ortamda oluşan kontaminasyondan dolayı tek bir hücreden yeni bir bitki oluşumu gerçekleştirilemedi.

Özet (Çeviri)

Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst) is an obligate, biotrophic fungus which causes yellow rust disease and it is the major patogen that gives destruction to the wheat around the world. Especially Turkey, one of the biggest problems for world wheat production.In this thesis, the 342 base pair of PstHa12j12 gene, which has an important role on resistance mechanism in Pst, was synthesized. The primers specific to the 180bp of the synthesized gene fragment were designed. After amplified by PCR reaction, the gene fragment was aimed to inserted into the silence vector pSL039B-1. further studies, wheat cultivar Avocet Yr10 cells protoplast isolation with enzyme aimed. PstHa12j12 gene fragment was amplified by PCR succesfully and the clones were obtained after transformation. According to the results of clones sequence analysis the clonning process failed, protoplast isolation from Avocet Yr-10 was perfomed successfully but there was no plant growing observed since the culture medium was contaminated.

Benzer Tezler

  1. Investigation of subcellular localization of a yellow rust pathogen effector candidate

    Sarı pas patojeni efektör adayının hücre içi lokalizasyonunun incelenmesi

    AYŞE ANDAÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA

  2. Investigation of the role of a canditate effector of wheat stripe rust pathogen in plant immunity

    Aday sarıpas patojen efektör proteininin bitki immünitesindeki rolünün araştırılması

    BAYANTES DAGVADORJ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    Prof. Dr. MAHİNUR AKKAYA

    Prof. Dr. ERDOĞAN EŞREF HAKKI

  3. Site directed mutations of one of the plant pathogen effector gene for functional analysis

    İşlevsel analiz için bitki pataojen efektör geninde yönlendirilmiş nokta mutasyonu

    ZEMRAN MUSTAFA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA

  4. Buğday sarı pas (Puccinia striiformis f. sp. tritici) efektör adaylarına ait RNAi parçalarının BSMV vektörüne klonlanması

    Cloning of RNAi fragments of wheat yellow rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici) effector candidates into BSMV vector

    ALPEREN DİLEKLİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiTrakya Üniversitesi

    Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA HASANÇEBİ

  5. Bacterial expression of an effector protein of yellow rust pathogen and a resistance protein of wheat and characterization of the effector protein

    Sarı pas patojenine ait bir efektör proteinin ve buğdaya ait bir direnç proteininin bakteri içinde ifadesi ve efektör proteinin karakterizasyonu

    SAYIT MAHMUT ERDOĞAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİNUR S. AKKAYA

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİH ÖZÇUBUKÇU