Geri Dön

Investigation of the role of a canditate effector of wheat stripe rust pathogen in plant immunity

Aday sarıpas patojen efektör proteininin bitki immünitesindeki rolünün araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 442317
  2. Yazar: BAYANTES DAGVADORJ
  3. Danışmanlar: Prof. Dr. MAHİNUR AKKAYA, Prof. Dr. ERDOĞAN EŞREF HAKKI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 181

Özet

Bu tezde, gelişmiş bitki moleküler biyoloji ve bitki biyoteknoloji teknikleri kullanarak, kısa sistin bakımından zengin Pst aday efektörü; PstSCR1'in işlevi anlaşılmaya çalışmıştır. PstSCR1 homolog proteinleri sadece Pst patojeninde ve bir de yakın akrabası olan Puccinia graminis f. sp. tritici (Pgt) patojende korunmuş olarak bulundu. PstSCR1 Nicotiana benthamiana'da signal peptit ile anlatımı yapıldığında bitki immün sistemini uyardığı halde signal peptitsiz anlatımı immün sistemini uyarmamıştır. Bu sonuç, efektötün signal peptit ile bitki hücresinin apoplastına salındığını ve apoplastda işlevsel olduğunu göstermiştir. Mikroskopik görüntüleme çalışmaları efektörün hücre içi lokalizasyonun apoplast olduğunu desteklemistir. Aynı zamanda immün sisteminin uyarılmasının Phythophtora infestans ve Peronospora tabacina N. benthamiana yapraklarında gelişmesini ve spor oluşturmasını yavaşlattığı saptanmıştır. Bununla birlikte, PstSCR1 çok fazla ekspres edildiğinde hücre ölümünü tetiklemektedir. Brassinosteroid duyarsız 1-Associated Kinase 1 (BAK1/SERK3) susturulmuş N. benthamiana'da hücre ölümünün azalmış olması bu efektörün BAK1/SERK3 reseptör tarafından tanındığı ve bu nedenle immün sistemini uyarma mekanizmasının PTI olduğunu desteklemiştir. Bir başka destek ise, protein olarak izole edilmiş efektör N. benthamiana yapraklarına enjekte edildiğinde defans genleri olan NbCYP71D20 ve NbACRE31 indüklenmiştir. Bu sonuçlar konaklarda immün tepkisi oluşturabildiği ve bu efektör PTI yoluyla 'non-host' bağışlığı sağladığı bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

The advanced plant molecular biology and plant biotechnology tools were employed in this thesis, in order to understand the role of a candidate effector, PstSCR1, of Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst) causing yellow rust disease in wheat. The homologues proteins of PstSCR1 were found to be only conserved in Pst, and in its closest relative, Puccinia graminis f. sp. tritici (Pgt). When PstSCR1 was expressed in Nicotiana benthamiana with its signal peptide (SP), it provoked the plant defense, whereas no such effect observed when it is expressed without SP, since SP facilitates crossing of proteins through cellular membranes, it is predicted that the effector is only functional (in triggering plant immune response) if secreted into plant apoplast. The subcellular localization of PstSCR1 was also investigated by microscopic analysis; the effector was indeed secreted to apoplast as the same as apoplastic marker C14 protein. It was also observed that the expression of the effector lowered the pathogenicity of Phythophtora infestans and Peronospora tabacina on N. benthamiana leaves, respectively. Moreover, when PstSCR1 was overexpressed, it triggered cell death. Brassinosteroid insensitive 1-Associated Kinase 1 (BAK1/SERK3) silenced N. benthamiana, cell death was remarkably abated, indicating BAK1 dependent function. Although SCR1-purified treatment on N. benthamiana showed a lack of cell death, it resulted in induction of defense genes NbCYP71D20 and NbACRE31, of which are induced in BAK1 dependent immune response. Based on our results, Pst-secreted protein, SCR1 can activate PAMP-triggered immunity on non-adapted hosts and contribute to non-host resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    381031

    Site directed mutations of one of the plant pathogen effector gene for functional analysis

    İşlevsel analiz için bitki pataojen efektör geninde yönlendirilmiş nokta mutasyonu

    ZEMRAN MUSTAFA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA

  2. Tez No

    267708

    Sıçan siyatik sinir rejenerasyonuna pulslu manyetik alanın makrofaj aracılı etkisinin lokal clodranate uygulamasıyla araştırılması

    The investigation of macrophage-mediated effect of pulsed magnetic field on rat sciatic nerve regeneration by local clodronate administration

    İBRAHİM KAHRAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyofizikÇukurova Üniversitesi

    Biyofizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL GÜNAY

  3. Tez No

    721974

    Hippo sinyal yolağı efektör molekülü YAP1'in inhibisyonunun in vitro beyin kanseri ve beyin kanseri kök hücrelerindeki etkisinin araştırılması

    Investigation of hippo signaling pathway effector molecule YAP1 inhibition effect in brain cancer and brain cancer stem cells in vitro

    NESLİHAN PINAR ÖZATEŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Tıbbi BiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÇIĞIR BİRAY AVCI

  4. Tez No

    541930

    Metforminin yaşlanma ve kanser üzerindeki etkisinin moleküler mekanizmalarının araştırılması

    Investigation of the molecular mechanisms of the effect of metformin on aging and cancer

    GÜVEN YENMİŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Genetikİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ NUR TURGUT ULUTİN

    PROF. DR. GÖNÜL KANIGÜR

  5. Tez No

    820012

    Nöronlarda rhoa sinyal yolağının incelenmesi

    Investigation of the rhoa signalling pathway in neurons

    ŞEVVAL ŞİMŞEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Bilim ve Teknolojiİstanbul Medipol Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜRKAN ÖZTÜRK

Geri Dön