Investigation of the role of a canditate effector of wheat stripe rust pathogen in plant immunity
Aday sarıpas patojen efektör proteininin bitki immünitesindeki rolünün araştırılması
- Tez No: 442317
- Danışmanlar: Prof. Dr. MAHİNUR AKKAYA, Prof. Dr. ERDOĞAN EŞREF HAKKI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tezde, gelişmiş bitki moleküler biyoloji ve bitki biyoteknoloji teknikleri kullanarak, kısa sistin bakımından zengin Pst aday efektörü; PstSCR1'in işlevi anlaşılmaya çalışmıştır. PstSCR1 homolog proteinleri sadece Pst patojeninde ve bir de yakın akrabası olan Puccinia graminis f. sp. tritici (Pgt) patojende korunmuş olarak bulundu. PstSCR1 Nicotiana benthamiana'da signal peptit ile anlatımı yapıldığında bitki immün sistemini uyardığı halde signal peptitsiz anlatımı immün sistemini uyarmamıştır. Bu sonuç, efektötün signal peptit ile bitki hücresinin apoplastına salındığını ve apoplastda işlevsel olduğunu göstermiştir. Mikroskopik görüntüleme çalışmaları efektörün hücre içi lokalizasyonun apoplast olduğunu desteklemistir. Aynı zamanda immün sisteminin uyarılmasının Phythophtora infestans ve Peronospora tabacina N. benthamiana yapraklarında gelişmesini ve spor oluşturmasını yavaşlattığı saptanmıştır. Bununla birlikte, PstSCR1 çok fazla ekspres edildiğinde hücre ölümünü tetiklemektedir. Brassinosteroid duyarsız 1-Associated Kinase 1 (BAK1/SERK3) susturulmuş N. benthamiana'da hücre ölümünün azalmış olması bu efektörün BAK1/SERK3 reseptör tarafından tanındığı ve bu nedenle immün sistemini uyarma mekanizmasının PTI olduğunu desteklemiştir. Bir başka destek ise, protein olarak izole edilmiş efektör N. benthamiana yapraklarına enjekte edildiğinde defans genleri olan NbCYP71D20 ve NbACRE31 indüklenmiştir. Bu sonuçlar konaklarda immün tepkisi oluşturabildiği ve bu efektör PTI yoluyla 'non-host' bağışlığı sağladığı bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
The advanced plant molecular biology and plant biotechnology tools were employed in this thesis, in order to understand the role of a candidate effector, PstSCR1, of Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst) causing yellow rust disease in wheat. The homologues proteins of PstSCR1 were found to be only conserved in Pst, and in its closest relative, Puccinia graminis f. sp. tritici (Pgt). When PstSCR1 was expressed in Nicotiana benthamiana with its signal peptide (SP), it provoked the plant defense, whereas no such effect observed when it is expressed without SP, since SP facilitates crossing of proteins through cellular membranes, it is predicted that the effector is only functional (in triggering plant immune response) if secreted into plant apoplast. The subcellular localization of PstSCR1 was also investigated by microscopic analysis; the effector was indeed secreted to apoplast as the same as apoplastic marker C14 protein. It was also observed that the expression of the effector lowered the pathogenicity of Phythophtora infestans and Peronospora tabacina on N. benthamiana leaves, respectively. Moreover, when PstSCR1 was overexpressed, it triggered cell death. Brassinosteroid insensitive 1-Associated Kinase 1 (BAK1/SERK3) silenced N. benthamiana, cell death was remarkably abated, indicating BAK1 dependent function. Although SCR1-purified treatment on N. benthamiana showed a lack of cell death, it resulted in induction of defense genes NbCYP71D20 and NbACRE31, of which are induced in BAK1 dependent immune response. Based on our results, Pst-secreted protein, SCR1 can activate PAMP-triggered immunity on non-adapted hosts and contribute to non-host resistance.
Benzer Tezler
- Site directed mutations of one of the plant pathogen effector gene for functional analysis
İşlevsel analiz için bitki pataojen efektör geninde yönlendirilmiş nokta mutasyonu
ZEMRAN MUSTAFA
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA
- 6063 aluminyum alaşımlarının korozyon direnci üzerine anodizasyon öncesi yüzey işlemlerinin ve AA anodizasyonla üretilmiş ince oksit filmlerinin etkisi
The Effect of pretreatment and thin layer sulfuric acid a C anodization of 6063 aluminum alloys on its corrosion resistance
FERİHA SERTÇELİK
- Molecular and functional investigation of disease-associated cytoskeletal proteins protrudin and MYO1H
Hastalık ilişkili sitoskeletal proteinler protrudin ve MYO1H'nin moleküler ve fonksiyonel araştırılması
ECE SELÇUK ŞAHİN
Doktora
İngilizce
2024
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ
- Ters yüz sınıf modeli çerçevesinde gerçekleştirilen 3D modellemenin fen bilgisi öğretmen adaylarının uzamsal yetenekleri ve akademik başarıları üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of 3D modeling performed in the context of the flipped classroom on pre-service science teachers' spatial abilities and academic achievements
FATMA KARAİSMAİLOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Eğitim ve ÖğretimMarmara ÜniversitesiMatematik ve Fen Bilimleri Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHTAP YILDIRIM
- Karşılaştırma
Bencmarking
BURÇAK ERENMEMİŞOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMühendislik Yönetimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT DİNÇMEN