Geri Dön

Viral pnömoni tanısı alan hastalarda etkenlerin multipleks PZR yöntemiyle gösterilmesi

Viral pnömoni tanisi alan hastalarda etkenlerin multipleks PZR yöntemiyle gösterilmesi

  1. Tez No: 325366
  2. Yazar: OYA AKKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BÜLENT BAYSAL
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Solunum yolu infeksiyonları, multipleks PZR, nazofarengeal sürüntü
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Selçuk Üniversitesi
  10. Enstitü: Meram Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 65

Özet

Amaç: Çalışmanın amacı Selçuk Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi Hastanesi'ne pnömoni nedeniyle başvuran çocuk ve yetişkin hastalarda, viral etkenlerin multiplex polimeraz zincir reaksiyonuyla tespit edilmesidir.Gereç ve Yöntem: Ekim 2010 ? Nisan 2011 tarihleri arasında hastaneye başvuran150 çocuk ve 150 yetişkin pnömonili hastadan nazofarengeal sürüntü örneği toplandı. Bu örnekler çalışılıncaya kadar -20°C'de saklandı. Viral DNA/RNA ekstraksiyonu ve amplifikasyonu Seeplex®RV12 multiplex PZR kiti kullanılarak yapıldı. Viral DNA/ RNA çoğaltıldıktan sonra etidyum bromid ile boyanıp %2 agaroz jelde yürütüldü ve büyüklüklerine göre viruslar identifiye edildi.Bulgular: Hastaların 150(%50)'si çocuk kliniğinden, 150(%50)'si ise Göğüs Hastalıkları Kliniği'nden gönderildi. Tüm hastaların %46.2'sinde, en az 1 virus tespit edildi. Pozitif hastaların %45'i RSV olarak tespit edildi. Bunu %19.4 ile rinovirüs, %13.6 ile influenza A, %6.5 ile parainfluenza, %4.3 ile influenza B, %3.6 ile adenovirüs, %2.9 ile koronavirüs ve %1.4 ile metapnömovirus izledi. Toplam 139 olan pozitifin 107'si çocuk ve 32'si yetişkindi. 5 (%1.6) hastada ko-infeksiyon izlendi. 0-4 yaş grubunun %71'inde ve 5-9 yaş grubunun %75'inde etken virus bulundu. Erişkinde virus bulunma oranı düşüktü. Bu farklılık istatistiksel olarak anlamlı bulundu(p> 0.537).Sonuç: Bizim çalışmamızda %44.6 RSV, %19.4 rinovirus, %17.9 influenza virus, %6.5 parainfluenza virus, %3.6 adenovirus, %2.9 koronavirus, %1.4 metapnömovirus tespit edildi.Multipleks PZR testleri, solunum yolu infeksiyonları için kolay, hızlı ve güvenli testlerdir. Bu testlerin, klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında rutin tanı testleri arasında yer alması gereklidir. Viral hastalıklarda etkenin tespit edilmesi, gereksiz antibiyotik reçetelenmesinin önlenmesi ve gerektiğinde uygun antiviralin verilmesini sağlar.

Özet (Çeviri)

Objective: The aims of this study was to determine the viral etiology of pneumonia among children and adults at Selcuk University Meram Medical Faculty Hospital using multiplex Polymerase Chain Reaction (PCR) assay.Materials And Methods: Between October 2010-April 2011, nasopharyngeal swab samples were collected from 150 children and 150 adults with pneumonia. All the samples were stored in a freezer at -20°C until PCR was carried out. Viral DNA/RNA was extracted using Viral Gene Spin? kit according to the manufacturer?s instructions and was amplified by Seeplex®RV12 multiplex PCR kit. The amplified products were visualized by electrophoresis an ethidium bromide-stained 2% agarose jel and analyzed by identifying bands.Results: 150 patients were from pediatric clinics and 150 patients were from pulmonary diseases clinics. At least one viral agent was detected in 46.2% of all patients. RSV was the most common agents encountered among virus DNA positive patients (45%), and followed by rhinovirus (19.4%), influenza A (13.6%), parainfluenza (6.5%), influenza B(4.3%), adenovirus (3.6%), koronavirus (2.9%) and human metapneumovirus (1.4%) viruses. Positive in 107 (35.6%) of the 139 patients were children and 32 (10.6%) were adults. Co-infection was detected in 5 (1.6%) of all patients. The rate of virus positive was found to be 71% in age group of 0-4 and was found to be 75% in age group of 5-9. The rate of virus positive in adults was lower. This difference was found statistically significant (p> 0.537).Conclusion: In this study, the rate of RSV was found to be 45%, rinovirus was found to be 19.4%, influenza virus was found to be 18%, parainfluenza was found to be 6.5%, adenovirüs was found to be 3.6%, koronavirüs was found to be 2.9 % and metapnömovirus was found to be 1.4%.Multiplex PCR assays are rapid, easy and reliable methods and used in the diagnosis of respiratory diseases. These tests are requared to take place among the routine diagnostic procedurs at clinical microbiology laboratories. Viral detection may reduce unnecessary prescription of antibiotics and may prompt antiviral treatment such as oseltamivir (against influenza) to the patient or exposed family members.

Benzer Tezler

  1. Yoğun bakım ihtiyacı olan pnömonili hastalarda atipik pnömoni ve viral pnömoni etkenlerinin araştırılması

    Investigation of atypical and viral pneumonia in patients admitted tointensive care units

    AHMET DOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİnönü Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YASEMİN ERSOY

  2. Yoğun bakımda takip edilen pnömoni hastalarının endotrakeal aspirasyon örneklerinde atipik etkenlerin multipleks-pcr yöntemi ile araştırılması

    Investigation of atypical pathogens by multiplex-pcr method in endotraceal aspiration samples of pneumonia patients followed in intensive care units

    TALİHA KARAKÖK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SALİH CESUR

  3. Çocuk yoğun bakım ünitesinde ciddi alt solunum yolu enfeksiyonu ile yatan hastaların klinik özellikleri, etiyolojisi ve prognozunun değerlendirilmesi: 5 yıllık tek merkez deneyimi

    Evaluation of clinical characteristics, etiology and prognosis of patients hospitalised with severe lower respiratory tract infection in paediatric intensive care unit: a 5-year single centre experience

    EMİRHAN UZAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TAMAY GÜRBÜZ

    DOÇ. DR. MUHTEREM DUYU

  4. Çocukluk çağında toplum kökenli pnömoni tanısı ile hastaneye yatırılan hastalarda bakteriyel ve viral etkenlerin insidansı ve klinik özellikleri

    Clinical characteristics and incidence of bacterial and viral pathogens in patients hospitalized with community acquired pneumonia in childhood

    SADİYE SERT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSelçuk Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RAHMİ ÖRS

  5. Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı kliniklerinde ocak 2019- ocak 2020 tarihleri arasında pnömoni tanısı ve komplikasyonları ile takip ve tedavi edilen hastaların irdelenmesi

    Investigation of patients followed and treated by pneumonia diagnosis and complications between january 2019 - january 2020 in Necmettin Erbakan University Meram Faculty of Medicine Child Health and Diseases Department clinics

    AYŞENUR YEĞNİDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VESİLE MELTEM ENERGİN