Çanakkale ilinde karnabahar mozaik virüsü (Cauliflower mosaic virus; CaMV) izolatlarının tanılanması ve karakterizasyonu
Identification and characterization of Cauliflower mosaic virus (CaMV) isolates in Çanakkale province
- Tez No: 326606
- Danışmanlar: PROF. DR. SAVAŞ KORKMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
Bu çalışmada Çanakkale ili ve ilçelerinde 2010-2011 üretim yılları içinde bir sörvey çalışması yürütülerek Karnabahar mozaik virüsü (Cauliflower mosaic virus; CaMV)'ne benzer simptom gösteren karnabahar ve lahana bitkilerinden 84 örnek toplanmıştır. Toplanan örnekler CaMV'nin varlığını belirlemek amacıyla DAS-ELISA ve/veya PCR yöntemiyle test edilmiştir. DAS-ELISA ve/veya PCR testleri sonucunda 84 örnekten 63 tanesi CaMV ile infekteli bulunmuştur. İnfekteli bulunan örnekler içerisinden elde edilen bazı izolatların moleküler özelliklerini belirlemek amacıyla kılıf protein (CP) genleri klonlanarak nükleik asit dizilimleri belirlenmiştir. Klonlama ve sekans analizi yapılan CaMV izolatlarına özgü nükleotid dizilimleri gen bankasında bulunan ve dünyanın farklı üretim bölgelerinden CaMV izolatlarının kılıf protein genleriyle karşılaştırılmıştır. Bu karşılaştırmalar sonucunda ülkemiz CaMV izolatlarının CP genlerinin nükleotid düzeyinde % 93-100, dünya izolatları ile % 92-97 oranında bir benzerliğe sahip olduğu bulunmuştur. Yapılan filogenetik analizler sonucunda Çanakkale izolatlarının dünyanın farklı bölgelerindeki izolatlarla farklı düzeylerde ilişki gösterdiği saptanmıştır. Bazı izolatlara yapılan Western blot analizi sonucunda 44 kDa, 39 kDa ve 37 kDa ağırlığında proteinler elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, a survey was conducted in Canakkale Province and sub province on cauliflower and cabbage plants that show Cauliflower mosaic virus-like symptoms between the years 2010-2011. A total of 84 samples were collected from these areas and tested by DAS-ELISA and/or PCR for the presence of CaMV. As a result of the DAS-ELISA and/or PCR analysis 63 out of 84 samples were found infected with CaMV. The coat protein genes of some isolates were cloned and sequenced. Isolates were further characterized and the sequences obtained from CaMV isolates of Canakkale were compared with known sequences from other part of the world to determine the genetic differences and evolutionary relationships among CaMV isolates from Canakkale and the other parts of the world. Comparison of CP genes revealed that CP gene of CaMV isolates from Canakkale Province and sub provinces showed 93-100 % and isolates with the world 92-97 % identity in their nucleotide sequence, respectively. Phylogenetic analysis of the CP gene sequences showed that CaMV isolates from Canakkale provinces and sub provinces displayed different level of genetic relationship with CaMV isolates from those of the world. In this case the method isolates proteins were analyzed by western blot analysis. As a result of western blot analysis of some isolates with 44 kDa, 39 kDa and 37 kDa weight proteins were obtained.
Benzer Tezler
- Çanakkale yöresinde bazı sebze türlerinin organik tarım yöntemiyle yetiştirilmesi
Growing some vegetable species with organic farming systems in Çanakkale
SEÇKİN KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KENAN KAYNAŞ
- Çanakkale ili lahana ekim alanlarındaki kist nematodu türlerinin (Heterodera spp.)tespit edilmesi
Determination of cyst nematodes in cabbage areas in Çanakkale
SEDA MUŞDAĞI
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UĞUR GÖZEL
- Çanakkale ilinde arı yetiştiriciliğinde temel petek kullanan ve kullanmayan işletmeler arasındaki teknik ve ekonomik farklılıkların belirlenmesi
Determination of technical and economic differences between businesses that use and do not use basic combi in beekeping in Çanakkale province
AYŞE GÜL KOBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
EkonomiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiTarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DUYGU AKTÜRK
- Çanakkale ilinde doğu meyvegüvesi (Cydia molesta Lep.: Tortricidae)'nin yayılış alanı ve bazı biyolojik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of dispersal area and some biological properties of oriental fruit moth (Cydia molesta Lep.: Tortricidae) in Çanakkale province
İLKE ÖZBEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ ÖZPINAR
- Çanakkale ilinde farklı üretim yöntemleri kullanan çiftçilerin pestisit bilinç düzeyinin araştırılması
Investigation of pesticide awareness levels of farmers using different production methods in çanakkale province
BARIŞ CİĞER
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURAK POLAT