Nannospalax Nehringi ve Nannospalax ehrenbergi (Rodentia, spalacidae) türlerinde PCR-RFLP ile mitokondriyal DNA D-loop ve sitokrom B bölgelerinin haplotip çeşitliliği
Haplotip diversity of the mitochondrial DNA D-loop and cytochrome B regions in Nannospalax nehringi and Nannospalax ehrenbergi (Rodentia, Spalacidae) detected by PCR-RFLP
- Tez No: 329329
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. TEOMAN KANKILIÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Nannospalax xanthodon, Nannospalax ehrenbergi, sitotip, RFLP, Nannospalax xanthodon, Nannospalax ehrenbergi, Cytotype, RFLP
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Niğde Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
RFLP metodu kullanılarak mt-DNA D-loop ve sitokrom b bölgelerindeki genetik farklılıklar Nannospalax xanthodon ve Nannospalax ehrenbergi türleri arasında belirlendi. Anadolu'da yaşayan iki tür için Nannospalax xanthodon (62 populasyon) ve Nannospalax ehrenbergi (2 populasyon) toplam 94 örnek çalışıldı.Mitokondriyal DNA'da genetik farklılıkları belirlemek için, mt-DNA'nın iki bölgesi (790 bp uzunluğunda D-loop ve 500 bp uzunluğunda Cyt-b) izole edildi ve BamH-I, Taq-I, Alu-I and Msp-I restriksiyon endonükleaz enzimleri ile kesildi. BamH-I D-loop bölgesini kesmezken, Alu-I, Msp-I and Taq-I enzimleri bu bölgeyi pek çok örnekte sırasıyla 100-240-450 bp, 280-510bp, 170-620bp uzunluğunda bölgelerden kesti. Sitokrom b bölgesinde ise Bamh-I, Msp-I and Taq-I enzimleri bu bölgeyi pek çok örnekte sırasıyla 110-130-260bp, 200-300bp, 200-230-270-300bp uzunluğunda bölgelerden kesti. Filogenetik yapı Batı Anadolu'nun kromozomal formlarının Anadolu'daki diğer kromozomal formlardan farklı olduğunu gösterdi. Batı Anadolu formları ve diğer bölgelerdeki kromozomal formlar arasında genetik mesafe yüksek bulundu.
Özet (Çeviri)
Genetic difference between the mt DNA D-loop and Cyt-b region was determined in the two species Nannospalax xanthodon and Nannospalax ehrenbergi using Pcr-RFLP method. 94 mole rat samples belonging to two species S. xanthodon (62 populations) and S. ehrenbergi (2 populations) distributed in Anatolia were studiedIn order to detect genetic differences in mtDNA, DNA was isolated two parts of 790 bp of D-loop and 500 bp of Cyt-b in mt DNA was amplified and cut with BamH-I, Taq-I, Alu-I and Msp-I restriction enzymes. BamH-I enzyme didn?t cut the D-loop region while Alu-I, Msp-I and Taq-I enzymes cut a lot of samples in 100-240-450 bp, 280-510bp, 170-620bp-length bands, respectively. In the amplified region for cyt-b region: Bamh-I, Msp-I and Taq-I enzymes cut a lot of samples in 110-130-260bp, 200-300bp, 200-230-270-300bp lenght bands, respectively.In our phylogenetic reconsruction show that the chromosome forms of Western Anatolia is different from all other chromosome forms of Anatolia. Genetic distance is found high between western forms and other chromosome forms.
Benzer Tezler
- Nannospalax xanthodon (Rrodentıa:Spalacidae)'un farklı kromozom soylarında mitokondriyal DNA'nın 16S rRNA geni kullanılarak genetik varyasyon düzeylerinin belirlenmesi
Determining the levels of genetic variation using 16S rRNA of mtDNA in different chromosome races of Nannospalax xanthodon (Rodentia: Spalacidae)
HABİBE DİDEM ÇELİKBİLEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
ZoolojiNiğde ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TEOMAN KANKILIÇ
- Anadolu körfare populasyonlarının (Rodentia:Spalacidae) nükleer gen beta- fibrinojen (BFIBR) ve mitokondriyal DNA gen sitokrom B ile genetik varyasyon düzeylerinin belirlenmesi
Determining the levels of genetic variation inferred from nuclear gene beta- fibrinogen (BFIBR) and mitochondrial DNA gene cytochrome B in Anatolian subterranean mole rats (Rodentia:Spalacidae)
ARZU REŞADİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyolojiNiğde ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TEOMAN KANKILIÇ
- Güneydoğu Anadolu bölgesi Nannospalax ehrenbergi (Nehring 1898) 2n=52 ve 2n=56 kromozomal formlarının morfometrik yönden analizi
The morphometric analysis of 2n=52 and 2n=56 chromosomal forms of Nannospalax ehrenbergi (Nehring 1898) in South Eastern Anatolian region
GÖKHAN YÜRÜMEZ
- Adıyaman ili kör fareleri Nannospalax ehrenbergi (Nehrıng, 1898) (rodentıa: spalacıdae)'nin baş iskeleti morfolojik özellikleri
Skull morhpological of Adiyaman province mole rats Nannospalax ehrenbergi (Nehring, 1898) (rodentia: spalacidae)
CAVİDE YEŞİL AYDIN
- Mardin yöresi Spalax'larının (Mammalia:Rodentia) morfolojik ve karyolojik özellikleri
Morphological and karyological pecularities Spalax's (Mammalia:Rodentia) from Mardin province
GÖKHAN YÜRÜMEZ