İstanbul ili sınırları içinde satışa sunulan sebze örneklerinde Escherichia coli'nin real-time PCR yöntemi ile Shiga benzeri toksin genleri varlığı bakımından incelenmesi
Screening of Escherichia coli in vegetable samples marketed in different districts of Istanbul in consideration of occurence of Shiga-like toxin genes by real-time PCR assay
- Tez No: 329411
- Danışmanlar: PROF. HAYDAR ÖZPINAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Aydın Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 87
Özet
Bu çalışmada, İstanbul ilindeki çeşitli semt pazarlarında satışa sunulan havuç, salatalık, domates, marul, maydanoz ve ıspanak örneklerinin her birinden 30' ar tane olmak üzere satın alınarak patojen Esherichia (E.) coli taraması yapıldı. Araştırmada toplam 180 sebze örneği kullanıldı. Tüm örneklerde ilk önce E. coli varlığı kültürel mikrobiyolojik metotlarla incelendi. E. coli üreyen sebze örneklerinde, iki farklı yöntem ile stx1, stx2 ve eae genleri varlığı incelendi. DNA izolasyonları; Eurofins GeneSpin DNA İzolasyon Kit prosedürüne göre ve kolonilerin sulandırılması yöntemi ile yapıldı. Kültür bazlı mikrobiyolojik yöntemle E. coli üremesi; ıspanakta % 93.3, marulda % 93.3, maydanozda % 86.6, havuçta % 43.3, salatalıkta % 33.3 ve domateste % 13.3 oranında saptandı. Real-Time PCR taraması sonunda stx1, stx2 ve eae genlerinin varlığı ve bu alanda yapılan literatür bilgileri dikkate alınarak STEC O157:H7 havuç ve marulda; STEC O26:H11 ve STEC O111:NM havuçta; STEC O119:H16 havuç, marul, salatalık ve maydanozda; STEC O157:NM marulda ve EPEC O119, EPEC O111:H2, EPEC O26:NM havuç, salatalık, domates, marul, maydanoz ve ıspanak örneklerinde olduğu tespit edilmiştir.Sonuç olarak; İstanbul ili sınırları içinde satışa sunulan sebze örneklerinde yapılan incelemede, kültür bazlı yöntem ve Real Time PCR ile doğrulama sonucunda; E. coli' nin varlığı ve bu E. coli' lerin patojen stx1, stx2 ve eae genlerini taşıdığı tespit edilerek, halk sağlığını tehdit ettiği sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study the presence of Escherichia (E.) coli in some selected vegetable samples such as carrot, cucumber, tomato, lettuce, parsley and spinach were studied in consideration of occurence of Shiga-like toxin genes by Real-Time PCR. 30 samples from each of the vegetables, totally making 180 were collected in different districts of İstanbul. The samples were initially investigated for E. coli by culture-based microbiology. Those with a positive E. coli occurence were also examined for stx1, stx2 and eae genes according to two different methods by Real-Time PCR assay. DNA isolations were made by following up the instructions in Eurofins GeneSpin DNA Isolation Kit and by diluting the colonies. The obtained results by culture-based microbiology showed that occurrence of E. coli in the samples was found as 93.3% in spinach; 93.3% in lettuce; 86.6% in parsley; 43.3% in carrot; 33.3% in cucumber and 13.3% in tomato. On the other hand, screening by Real-Time PCR was also performed for these positively contaminated samples in order to understand serotype of E. coli by stx1, stx2 and eae genes. The Real-Time PCR study resulted in STEC O157:H7 in carrot and lettuce; STEC O26:H11 and STEC O111:NM in carrot; STEC O119:H16 in carrot, lettuce, cucumber and parsley; STEC O157:NM in lettuce and EPEC O119, EPEC O111:H2, EPEC O26:NM in carrot, cucumber, tomato, lettuce, parsley and spinach, respectively.In conclusion, it was shown that vegetable samples marketed in different districts of İstanbul were positively contaminated by E. coli according to the culture based microbiology. The results were also validated by Real Time PCR and pathogen stx1, stx2 and eae genes significantly harmful to the public health were detected by Real-Time PCR assay
Benzer Tezler
- İstanbul ili su ürünleri işleme tesislerinin genel yapısı ve işleyişi
General structure and functioning of aquatic products processing plants in Istanbul province
FATMA TURGAY SAĞLAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
ZiraatNamık Kemal ÜniversitesiTarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN ORAMAN
- Lojistik performansın ve reklamların satın alma öncesi ve sonrası tüketici davranışlarına etkisi
The effect of logistics performance and advertisements on consumer behavior before and after purchasing
ALP ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
İşletmeBeykent Üniversitesiİşletme Yönetimi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÖZDE YANGINLAR
- Raylı ulaşım sistemlerinin gayrimenkul fiyat seviyesi üzerine etkisi (Küçükçekmece ilçesi örneği)
Effect of rail transportation systems on real estate price level (Küçükçekmece district example)
İLKER KAPLAN
- Ankara ili doğal gaz tüketiminin yapay sinir ağları ile öngörüsü
Prediction of natural gas consumption in Ankara region using artifical neural networks
BURAK TAŞKINER
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Enerjiİstanbul Teknik ÜniversitesiEnerji Bilim ve Teknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BURAK BARUTÇU
- Eğitim örgütlerinde toplam kalite felsefe ve uygulamalarının yerleştirilmesinde yöneticilerin rolü ve etkililiği
The study of the role and effectiveness of managers at settling the philosopy and practice of total quality management in education organisations
MEHMET UĞUR TANTÜRK