Bakteriyolojik identifikasyonda konvansiyonel yöntemler ile otomatize sistemlerin karşılaştırılması.
Comparison of the conventional methods and automated systems for identification of bacteria.
- Tez No: 33420
- Danışmanlar: PROF. DR. HÜSEYİN GÜN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Bakteri grup belirleme teknikleri, Bakteriler, Enterobacteriaceae, Gram negatif bakteriler, Bacterial typing techniques, Bacteria, Enterobacteriaceae, Gram negative bacteria
- Yıl: 1995
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gata
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET Bakteri identifikasyonunda konvansiyonel yöntem hala çok yaygın olarak kullanılmakla beraber, bu yöntemlerin modifiye edilmesiyle geliştirilen otomatize identifîkasyon sistemleri sayesinde laboratuvarlar daha kısa sürede sonuç verme şansım yakalamışlardır. Çalışmamızda, ATB İD 32 GN ve ATB rapid ED 32 E stripleri kullanılarak API sistemi, konvansiyonel yöntem identifîkasyon yöntemi ve bakterilerin biyokimyasal reaksiyon tabloları kullanılarak ardışık Bayesiyan olasılık hesaplama yöntemi ile hazırlanmış ENTERIC.EXE bilgisayar programı ile 271'i Enterobacteriaceae familyasına ait, 75'i non-fermantatif gram negatif bakteri olmak üzere toplam 346 bakteri değerlendirilmiştir. Enterobacteriaceae'lann üç sistemle identifîkasyon sonuçlarına göre uyum yüzdesi cins düzeyinde % 87.0, tür düzeyinde % 84.5 olarak bulunmuştur. Sistemlerin arasındaki tanımlama yüzdeleri birbirleriyle karşılaştırıldığında, konvansiyonel yöntem ile API sistemi arasındaki uyum cins düzeyinde % 93.0, tür düzeyinde % 91.1, konvansiyonel yöntem ile bilgisayar programı arasındaki uyum cins düzeyinde % 90.0, tür düzeyinde % 87.8 ve bilgisayar programı ile API sistemi arasındaki uyum cins düzeyinde % 88.9, tür düzeyinde % 85.0 olarak saptanmıştır. Non-fermantatif gram negatif bakteriler, değişken özellikleri nedeniyle uygun bir bilgisayar programı oluşturulamadığından sadece API sistemi ve konvansiyonel yöntem ile değerlendirilmiş ve ikisi arasındaki uyum cins düzeyinde % 84.0, tür düzeyinde % 74.7 olarak bulunmuştur. Enterobacteriaceae'lann bilgisayar programı %1.8'i, konvansiyonel yöntemle ve API sistemi ile % 1.1'i, non-fermantatif bakterilerin ise konvansiyonel yöntemle % 4.0'ü, API sistemiyle % 2.7'si tanımlanamamıştır. 76
Özet (Çeviri)
SUMMARY At present, in addition to the widespread use of conventional method for bacteriological identification, the laboratories also have the chance of relatively more rapid reporting by using automatized identification system which had been developed by modifying conventional method. In our study, using ATB ID 32 GN and ATB rapid ID 32 E strips (API System), conventional identification method and a computer program (ENTERIC.EXE) prepared by sequence Bayesiyan probability calculation method for evaluating biochemical reactions, 271 gram negative bacteria belonging to Enterobacteriaceae family and 75 non- fermentative gram negative bacteria (totally 346) were evaluated. According to the identification results of enteric bacteria using all three system, compatibility was found to be 87.1 % for genus and % 84.5 for species level. When the identification percentages of system were compared with each other, the compatibility of conventional method and API system was 93.0 % (genus) and 91.1 % (species); of conventional method and computer program it was 90.0 % (genus) and 87.8 % (species); and of computer program and API system the compatibility was 88.9 % (genus) and 85.0 % (species). Because of the variability of the features of non-fermentative gram negative bacteria, a suitable computer program could not be employed. For this reason, only the conventional method and API system was evaluated. The compability was found to be 84.0 % and 74.7 %, for genus and species level, respectively. 1.8% of enteric bacteria could not be identified by computer program; and 1.1 % remained unidentified using API system and the conventional method. For the non-fermentative bacteria the unidentification rate was 4 % for the conventional method and 2.7 % for the API system. 77
Benzer Tezler
- Diabetes mellitus hastalarına ait dışkı kültürlerinde üreyen bakteri türlerinin normal dışkı kültürleri ile karşılaştırılması
Comparison of bacterial species reproduced in foot cultures from diabetes mellitus patients with normal feet cultures
ARİF İRFAN TURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Sağlık EğitimiAdıyaman ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SADIK AKGÜN
- In house hızlı bakteri tanımlama ve hızlı antimikrobiyal duyarlılık testlerinin prognoza ve maliyete etkisinin araştırması
Investigation of the impact of in house rapid bacterial identification and rapid antimicrobial susceptibility testing on prognosis and cost
TUĞÇE EYÜPOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Mikrobiyolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUBA MÜDERRİS
- Kültür levrek balıklarında (Dicentrarchus labrax L.) tenacibaculum maritimum'un identifikasyonunda diyagnostik tekniklerinin karşılaştırılması
Comparision of diagnostic techniques for identification of tenacibaculum maritimum in cultured sea bass (Dicentrarchus labrax L.)
REMZİYE EDA YARDIMCI
Doktora
Türkçe
2011
Su Ürünleriİstanbul ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLŞEN TİMUR
- Ruminant atıklarında brusella türlerinin multipleks PCR ve konvansiyonel yöntemler ile tanısı, yöntemlerin birbirleri ile karşılaştırılması
Diagnosis of Brucella species in ruminant fetuses by multiplex PCR and conventional methods and compare these methods with each other
AHMET MURAT SAYTEKİN
- Tatlısu balıklarında hemorajik septisemiye neden olan Aeromonas hydrophila'nın 16S rDNA RFLP ve RAPD analizleri ile identifikasyonu
The identification of Aeromonas hydrophila associated with hemorraghic septicemia in freshwater fish by 16S rDNA RFLP and RAPD analysis
ESRA FATMA DENİZCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
Su Ürünleriİstanbul ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. GÜLŞEN TİMUR