Analysis of the in-vitro nanoparticle-cell interactions via support vector regression model
Destek vektör regresyon modeli ile in-vitro nanopartikül-hücre etkileşimlerinin modellenmesi
- Tez No: 335598
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SAVAŞ DAYANIK, PROF. DR. İHSAN SABUNCUOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Endüstri ve Endüstri Mühendisliği, İstatistik, Industrial and Industrial Engineering, Statistics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Endüstri Mühendisliği Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu araştırmada, Destek Vektör Regresyon (DVR) yöntemi ile nanopartikül-hücre etkileşimini inceleyen ve hücreye tutunan yani hücre yüzeyine yapışan veya hücre içine alınan nanopartikül (NP) oranını tahmin eden bir model geliştirilmiştir. Güdümlü ilaç dağıtımı sistemleri ve hücre seviyesinde hastalıkların tanı ve tedavileri için NP-hücre etkileşimini analiz etmek önemli bir araştırma konusudur. Nanopartiküllerin hücreye bağlanma oranları NP tipi, boyutu, şekli, yüzey yükü, yoğunluğu ve zaman değişkenlerine bağlı olarak farklılık göstermektedir. NP-hücre ilişkisini açıklamak için bu değişkenlerin binlerce varyasyonunu deneylerle test etmek pratik değildir. Bu yüzden, farklı varyasyonlar için nanopartiküllerin hücreye tutunma oranlarını matematiksel bir model yardımı ile tahmin etmek önemli bir çalışmadır. Çalışma için kullanılan veri seti Türkiye'de bir Nano-Tıp Araştırma Merkezi tarafından yapılan in-vitro NP-hücre etkileşimi deneyleri sonucunda elde edilmiştir. Geliştirilen DVR modeli, nanopartiküllerin verilen büyüklük, yoğunluk, yüzey yükü özelliklerini girdi olarak alarak; nanopartiküllerin hücreye tutunma oranlarını zamana bağlı olarak tahmin etmektedir.
Özet (Çeviri)
In this research a Support Vector Regression model is developed to understand the nanoparticle (NP)-cell interactions and to predict the cellular uptake rate of the nanoparticles, which is the rate of NPs adhered to the cell surface or entered into the cell. Examination of nanoparticle-cell interaction is important for developing targeted drug delivery systems and cell-level detection and treatment of diseases. Cellular uptake rate of NPs depends on NP type, size, shape, surface charge, concentration and incubation time. Conducting numerous experiments on the combinations of those variables to understand NP-cell interaction is impractical. Hence, a mathematical model of the cellular uptake rate will therefore be useful. The data for this study are obtained from in-vitro NP-healthy cell experiments conducted by a Nano-Medicine Research Center in Turkey. The proposed support vector regression model predicts the cellular uptake rate of nanoparticles with respect to incubation time given the size, charge and concentration properties of NPs.
Benzer Tezler
- Alfa-13-karboksikromanolün nanopartikül aracılı makrofaja iletiminin ın vıtro değerlendirilmesi
Assessing the in vitro potential of nanoparticle-mediated delivery of alpha-13'carboxychromanol to macrophages
EDA İLAYDA TALAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyokimyaMarmara ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET ERDİ SÖZEN
- Farklı mof esaslı ilaç taşıyıcı sistemlerin sentezi, karakterizasyonu ve anti kanser etkinliğinin incelenmesi
Synthesis, characterization, and investigation of the anticancer activity of different mof-based drug delivery systems
MAHSA HEIDARNEJAD
- Impact of 3D scaffolds that can co-deliver oxygen and pH-sensitive biomolecules on the viability of cancer and healthy cells
Oksijen ve pH'a duyarlı biyomolekül eş dağıtımı yapabilen 3B iskelelerin kanser ve sağlıklı hücrelerin canlılığı üzerine etkisi
YAĞMUR DAMLA DEMİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Kimyaİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NERMİN SEDA KEHR
PROF. DR. GÜLŞAH ŞANLI MOHAMED
- Gen tedavisi amaçlı nanotaşıyıcı platformların geliştirilmesi
Development of nanocarrier platforms for gene therapy
HAZAL PEKASIL
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASUMAN BOZKIR
- Analysis of the in-vitro nanoparticle-cell interactions via smoothing splines mixed effects model
Düzleme çizgileri karma etkiler modeli ile in-vitro nanopartikül-hücre etkileşiminin analizi
ELİFNUR DOĞRUÖZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SAVAŞ DAYANIK
PROF. DR. İHSAN SABUNCUOĞLU