Mide kanseri hastalarda XRCC2 ve XRCC3 gen polimorfizmlerinin incelenmesi
Investigation of XRCC2 and XRCC3 gen polymorphisms in patients with gastric cancer
- Tez No: 336915
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. İLHAMİ GÖK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Gastroenteroloji, Genetik, Biology, Gastroenterology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Mide Kanseri, XRCC2 ve XRCC3 genleri, Genetik Polimorfizm, PCR, RFLP, Kars İli, Gastric cancer, XRCC2, XRCC3, Genetic polymorhism, PCR, RFLP and Kars City
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kafkas Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 61
Özet
Bu çalışma Kars yöresinde yaşayan ve klinikte mide kanseri tanısı alan hastalarda XRCC2 ve XRCC3 genleri polimorfizm yaygınlığını tanımlamak amacıyla yapıldı. Araştırmamızda kliniklerde mide kanseri tanısı alan toplam 61 hasta ve 78 kişilik kontrol grubu genomik düzeyde incelendi. DNA tamirinde görev yapan XRCC2 ve XRCC3 genleri Arg188His ve Thr241Met polimorfik bölgelerindeki nükleotid değişimleri incelendi. Klinikte mide kanseri tanısı alan herbir hastadan ve kontrol amacıyla sağlıklı bireylerden DNA izolasyonu amacıyla kan örnekleri alındı. Alınan kan örneklerinden tuzla çöktürme metoduyla DNA izolasyonu yapıldı. İzole edilmiş DNA örneklerinden ilgili polimorfik bölgelerin primerleri kullanılarak polimeraz zincir reaksiyonu yardımıyla çoğaltıldı. Çoğaltılan Pcr ürünleri belirlenen restriksiyon enzimleriyle kesildi.Restriksiyon enzimiyle (HphI ve NcoI) kesilen DNA ürünleri agaroz jel elektroforezinde yürütüldü ve resimleri çekildi. Her iki polimorfik bölgedeki nükleotid değişimleri jel resimleri yardımıyla tayin edildi. Sonuç olarak 61 mide kanseri hastasında XRCC2 geni Arg188His polimorfizmindeki değişim oranı 61 hastanın 24?ünde %39 oranında ve aynı grubun sağlıklı bireylerinde 78 kişinin 12?sinde %15 oranında nükleotid değişimi gözlendi. XRCC3 geni Thr241Met polimorfizmindeki değişim oranı 61 hastanın 18?inde % 29 ve aynı grubun sağlıklı bireylerinde ise 78 kişinin 11?ininde %14 oranında nükleotid değişimi görülmüştür. Bulgularımız mide kanseri hastalar ile sağlıklı bireylerdeki polimorfizm değişikliği açısından karşılaştırıldığında hastalardaki ilgili polimorfik değişimlerinin istatistiksel olarak anlamlı olduğundan her iki polimorfizm bölgesindeki değişimlerinin kanser riskini tetikleyebileceği düşünmekteyiz.
Özet (Çeviri)
We have studied prevalence of polymorhisms in genes XRCC2, XRCC3 with the gastric cancer patients who lived in Kars region of Turkey. There were 61 cancer patients and 78 control people in this study. Single nucleotide changes were studied in XRCC2 and XRCC3 genes at locus Arg188His ve Thr241Met. Bloods samples were taken from these patients and health controls and DNA is isolated. Interest regions in genome is amplyified using Polymer Chain Reaction method. After amplification, we used restriction enzmy (HphI and NcoI) and digested these DNA. Later these DNAs were passed through gel electrophoresis. By looking at all these images, we identfied changed in nucleotide in these specific regions. We observed Arg188His polymorshim of XRCC2 genes by 39 percent as shown in 24 out of 61 cancer patients. Only 12 out of 78 control group showed this polymoprhism (15%). We also observed 18 out of 61 patients (% 29) carried Thr241Met polymorhism of XRCC3 gene. Same polymorhism were observed in 11 out of 78 healthy control group (% 14). Our results shows that there is significant difference between patient and control group?s polymorhism ratios. Most cancer patients carry Arg188His of XRCC2 and Thr241Met of XRCC3 polymorhisms, almost twice of control group. This results clearly shows that these polymorhism increases risk of cancer and would be good marker for early diagnostics for gastric cancer.
Benzer Tezler
- Variant detection in inflammatory diseases
İnflamatuvar hastalıklarda varyant belirlenmesi
GİZEM ALKURT
Doktora
İngilizce
2024
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Fanconi anemi gen ailesinin herediter kanser ilişkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of the hereditary cancer relationship of thefanconi anemia gene family
KÜBRA MÜGE ÇELİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
GenetikÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA SILAN
- Mide kanseri tanılı hastalarda preoperatif PET/BT bulguları ve histopatolojik veriler ile CRP ve diğer klasik tümör markırlarının karşılaştırılması
The comparison of preoperative PET/BTfindings and histopathologic data with CRP and other classical tumor markirs in gastric cancer patients
ADEM MAMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Radyoloji ve Nükleer TıpAtatürk ÜniversitesiDahili Tıp Bilimleri Bölümü
YRD. DOÇ. DR. ARİF KÜRŞAD AYAN
- Mide kanseri olan hastalarda fungal enfeksiyon görülme sıklığının değerlendirilmesi
Evaluation of the frequency of fungal infection in patients with stomach cancer followed in Kütahya Evliya Çelebi Hospital Oncology Service between 2017 and 2023
ÇAĞLAR EYLEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
İç HastalıklarıKütahya Sağlık Bilimleri Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ALİUSTAOĞLU
- Mide kanseri tanılı hastalarda üç boyutlu konformal radyoterapi ve yoğunluk ayarlı radyoterapi tekniklerinin hedef volüm ve kritik organ dozları açısından karşılaştırılması
Comparison of three dimensional conformal radiotherapy and intensity modulated radiotherapy techniques in terms of target volume and critical organ doses in patients with stomach cancer
DUYGU ALTIPARMAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Fizik ve Fizik MühendisliğiTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM YİĞİTOĞLU
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLHAN GÜLER AVCI