Mesane ve böbrek kanserlerinde bikunin geninin ifade düzeyinin araştırılması ve mutasyonel taraması
Mutational screening and investigation of gene expression status of bikunin gene among bladder and kidney cancer patients
- Tez No: 339454
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHRİ İĞCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
Alfa-1-mikroglobulin/bikunin öncül (AMBP) geni 10 ekzon, 9 intron içermekte olup 20 kb uzunluğundadır. AMBP geninin ilk 6 ekzon Alfa-1-mikroglobulini şifrelerken, ekzon 8 ve 9 Bikuninin Kunitz bölgelerini, ekzon 7 ve 10 da bikuninin N ve C sonlarını şifrelemektedir. AMBP ile Bikunin arasında aynı gen üzerinden sentezlenmeleri haricinde işlevsel olarak bir bağlantı yoktur. Son yıllarda yapılan deneysel ve klinik çalışmalar bikuninin birçok olayda yer aldığını göstermektedir. Bikuninin hücre büyümesinde ve tümör hücrelerinin yayılmasında proteaz önleyici etkisinin olduğu bilinmektedir. Bikunin uPA ve uPAR gen ifadesini önemli ölçüde düşürerek kanser hücresi yayılımını azaltmaktadır. Bu zamana kadar mesane ve böbrek kanserinde bikuninin protein seviyesine dayalı deneyler bulunmaktadır. Ancak moleküler düzeyde mesane ve böbrek kanserli hastalarla yapılmış bir çalışma bulunmamaktadır. Mesane ve böbrek kanserinde bikuninin moleküler düzeyde işlevi henüz aydınlatılamamıştır. Bu çalışmada 19 mesane ve 50 böbrek kanserli hastanın normal ve tümörlü dokularından RNA ve DNA elde edildi. Bu örneklerde kısmi miktarlara dayalı RT-PCR yöntemi kullanılarak bikunin mRNA seviyeleri tespit edildi. Ayrıca bikunin geninin ekzonik bölgelerinde gen çokyapılılık (polymorphism) taraması yapıldı. Bu değişimler SSCP yöntemi ve dizileme cihazı ile gösterildi. Çalışma sonucunda bikunin mRNA seviyesinin mesane kanserli dokularda, normal dokulara göre azaldığı görüldü. Ancak mesane kanserli hastalarda anlamlı bir fark bulunamamıştır (p>0,05). Böbrek kanserli hastaların tümörlü dokularında, normal dokularına oranla bikunin mRNA seviyesinde anlamlı bir şekilde azalma tespit edildi (p0,05). Sonuç olarak; bikuninin böbrek kanserinin moleküler mekanizmasında önemli bir rolü olabileceği, tanı ve tedavide bir belirteç ve ilaç olarak fayda sağlayabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Alpha-1-mikroglobulin/bikunin precursor gene comprises 10 exons and 9 introns, 20 kb in length. First six exons encode Alpha-1-mikroglobulin, 8th and 9th exons encode Kunitz domains, 7th and 10th exons encode C and N terminal regions of bikunin. Experimental and clinical results show that bikunin functions in many processes. Bikunin acts as protease inhibitor in cell growth and spread of tumor cells. Bikunin provides significant reduction in expression of uPA and uPAR, thus the invasion and metastasis of tumor cells. There are some experiments based on bikunin protein level in bladder and kidney cancers. However, there is no such a detailed study at molecular level performed with bladder and kidney tumors. Bikunin molecular function in these cancers remains unclear. Herein, total RNA and DNA were obtained from normal and tumor tissues of 19 bladder and 50 kidney cancer patients. Using RNA samples, bikunin mRNA levels were detected using semi-quantitative RT-PCR. Mutational screening was performed at the exons of bikunin gene via SSCP. SNPs were shown using automatic sequencing device. mRNA levels of bikunin in tumor tissues decreased compared with normal tissues in bladder cancer. However, there is no significant difference between tumor and normal samples of bladder (p>0,05). In kidney cancer, bikunin mRNA levels decreased significantly in tumor tissues compared with normal tissues (p0,05). In conclusion, bikunin might contribute to kidney cancer pathogenesis and may be used as a potential marker and drug for diagnosis and treatment.
Benzer Tezler
- Sitokeratin 7 ve sitokeratin 20 immünboyanmasının kolorektal kanserlerin sito-histomorfolojik ayırıcı tanısına katkısı
Contribution of cytokeratin 7 and cytokeratin 20 immunostaining to the cyto-histomorphologic diferential diagnosis of colorectal carcinomas
TURGUT AYDIN
- Arseniğe maruz işçilerde, oksidatif stres ilişkili genlerdeki polimorfizmlerin (MnSOD ve p22phox) ve kan arsenik düzeylerinin, DNA hasarına etkisi
Effect on DNA damage of gene polymorphisms (MnSOD and p22phox) related to oxidative stress and blood arsenic levels in arsenic exposed workers
ESRA BALCIOĞLU
Doktora
Türkçe
2019
Adli TıpAnkara ÜniversitesiDisiplinlerarası Adli Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİT SİNAN SÜZEN
- Sulardan arsenik gideriminin incelenmesi
Removal of arsenic from waters
EREL EDİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Çevre MühendisliğiAksaray ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. LEVENT ALTAŞ
- Iğdır kayısısındaki ağır metal element düzeylerinin ICP-MS ile tespitine mikrodalga fırında çözündürmenin etkisi
Effect of microwave digestion on the determination of heavy metal element levels in apricot of Iğdir with ICP-MS
HALİM YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyomühendislikIğdır ÜniversitesiBiyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERVET AŞKIN
- Berrak hücreli renal karsinoma hastalarında e-kaderin (ECAD) ve ölüm aracılı protein kinaz (DAPK) genlerinde metilasyon araştırması
DNA methylation study of e-cadherin (ECAD) and death-associated protein kinase (DAPK)gene at clear cell renal carsinoma
AYTÜL KİTAPCI