Geri Dön

Hastane enfeksiyonu etkeni pseudomonas aeruginosa suşları arasındaki klonal ilişkinin araştırılması

Investigation of clonal relatedness among the nosocomial pseudomonas aeruginosa isolates

  1. Tez No: 339602
  2. Yazar: AYŞE BİLGE SİPAHİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KAYHAN ÇAĞLAR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Microbiology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 102

Özet

Bu çalışmada Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Yoğun Bakım Ünitelerinde yatan hastalardan izole edilen hastane kökenli ve çevresel Pseudomonas aeruginosa suşları arasındaki klonal ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Ocak 2010 - Ağustos 2011 tarihleri arasında Çocuk Hastalıkları, Genel Cerrahi, Anestezi ve Reanimasyon, İç Hastalıkları, Beyin Cerrahisi, Nöroloji ve Göğüs Hastalıkları Yoğun Bakım ünitelerinde hastane kökenli enfeksiyon tanısı alan hastaların çeşitli klinik örneklerinden izole edilen 50 ve çevresel örneklerden izole edilen dört adet, toplamda 54 Pseudomonas aeruginosa suşu çalışmaya dahil edilmiştir. Çalışmaya dahil edilen 54 suş otomatik tanımlama cihazı (MicroScan autoSCAN-4, Almanya) ile tür düzeyinde tiplendirilmiş ve antibiyotik duyarlılık testleri yapılmıştır. Rep-PZR yöntemi ile çalışmaya dahil edilen klinik ve çevresel suşlar arasındaki klonal ilişki araştırılmıştır. Çalışmaya alınan suşlara karşı en az direncin amikasin (%12); en fazla direncin ise seftriakson (%100), seftazidim (%100), sefotaksim (%100) ve tazobaktam-piperasiline (%100) karşı olduğu saptanmıştır. Test edilen antibiyotiklerden gentamisin ve tobramisine %26, siprofloksasin ve levofloksasine %30, imipenem ve meropeneme %34, aztreonam ve sefepime %98 oranında direnç saptanmıştır. Rep-PZR ile tiplendirilen 52 suştan 14 tanesinin incelenen diğer suşlarla klonal ilişkisinin olmadığı saptanmıştır. İncelenen suşların 13 küme oluşturduğu saptanmıştır. Kümeleşmede suş aralığı 2-6 arasında değişmektedir. Tiplendirilen suşların %73?ünün klonal ilişkili olduğu saptanmıştır. Çalışmaya alınan Pseudomonas aeruginosa suşlarının Rep-PZR tiplendirmesi sonucunda 27 ayrı DNA bant profili saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

In this study,our aim was to investigate of clonal relatedness among the nosocomial and enviromental Pseudomonas aeruginosa strains isolated from patients treated in intensive care units of Gazi University Medical School Hospital. A total of 54 Pseudomonas aeruginosa consisting of 50 clinical strains isolated from patients diagnosed with nosocomial infections and four strains from environmental samples between January 2010 - August 2011 from general surgery, anesthesiology and reanimation, pediatric, internal medicine, neurology, chest disease and neurosurgery intensive care units were included in the study. Antibiotic susceptibility tests and identification of Pseudomonas aeruginosa strains (n:54) included in the study were performed with an automated identification system (MicroScan autoSCAN-4, Germany). Clonal relatedness among environmental and nosocomial strains were investigated with Rep-PCR method. Minimal resistance among performed strains were detected in amikacin (12%), where as maximum resistance were at ceftriaxone (100%), cefotaxime (100%) and tazobactam-piperacilline (100%). Resistance rates for other tested antibiotics were; 26% for gentamycine and tobramycin, 30% for ciprofloxacin and levofloxacin, 34% for imipenem and meropenem and 98% for aztreonam and cefepime. Rep-PCR typing of the 52 strains showed that 14 strains were not clonally related to any other strains included in the study. Clonally related strains (n:38) were grouped in 13 clusters. The number of strains that generated these clusters were between 2-6. The strains genotyped were determined as clonally related with a high rate of 73%. It had been determined that there were 27 spesific Rep-PCR patterns among 52 Pseudomonas aeruginosa strains.

Benzer Tezler

  1. Klinik pseudomonas aerugınosa izolatlarının antibiyotiklere duyarlılık durumu ve serotiplendirilmesi

    Antibiotic susceptibilities and serotyping of clinical pseudomonas aeruginosa isolates

    PINAR EKİNCİOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DUYGU PERÇİN

  2. Yoğun bakım hastalarından izole edilen pseudomonas aerugınosa suşlarının moleküler epidemiyolojisi ve antibiyotik duyarlılığı

    Investigation of antibiotic susceptibility and molecular epidemiology of pseudomonas aeruginosa strains isolated from intensive care unit patients

    DEMET TİMUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ESMA KAYA

  3. İntraabdominal enfeksiyonlarda sekonder ve tersiyer peritonit etkeni olan gram negatif bakterilerin moleküler sürveyansı

    Moleculer surveillance of gram negative bacteria causung seconder and tertiary peritonitis in intraabdominal infections

    TÜLAY KANDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. TOĞRUL NAĞIYEV

  4. Ceftazidime dirençli pseudumonas aeruginosa izolatlarında per-1 ve oxa-10 benzeri beta-laktamazların moleküler yöntemlerle belirlenmesi

    Determination of per-1 and oxa-10-like beta-lactamases in ceftazidime-resistant pseudomonas aeruginosa isolates by molecular methods

    MEHTAP ÜNLÜ SÖĞÜT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    DOÇ. DR. ASUMAN BİRİNCİ

    YRD. DOÇ. DR. TUBA YILDIRIM

  5. Hastane enfeksiyonu etkeni pseudomonas aeruginosa suşlarının metallo-ß-laktamaz aktivitesinin fenotipik ve genotipik yöntemler ile saptanması

    Phenotypic and genotypic identification of the metallo-ß-lactamase activity in nosocomial Pseudomonas aeruginosa strains

    ELİF BOZÇAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ATAÇ UZEL