Geri Dön

Determination of genomic instability in breast and endometrium cancer sample tissues by RAPD-PCR and high resolution melting (HRM) analysis

Meme ve endometrium kanser örnek dokularında RAPD-PZR ve HRM analizi ile genomik karasızlığın tespiti

  1. Tez No: 342761
  2. Yazar: DİLEK KAPTAN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. İFFET İREM UZONUR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Fatih Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji alanındaki gelişmeler kanser tedavisinde ve moleküler hedeflerin kullanılmasında rahat bir olanak sağlar. Polimeraz Zincir Reaksiyon bazlı teknikler ile çok düşük sayıdaki hedef kopyalarından başlayarak nükleik asit dizilerinin amplifikasyonu ile belirli bir genetik bilgi elde edilmesine olanak sağlamaktadır. Ilaç ya da araştırma içeren bir çok uygulama için örnekte spesifik hedef sayısının ölçülmesi gereklidir. Rastgele Arttırılmış Polimorfik DNA Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RAPD-PZR) bir genom tarama aracı olarak genomik kararsızlığı saptanmasında kullanılabilir.Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) tabanlı testler, gen ekspresyonunu karakterize eden veya onaylayan ve aynı popülasyonun farklı mesajcı RNA düzeylerinin karşılaştırılmasında en yaygın kullanılan yöntemdir.Hücrelerde DNA'nın hasarı sonucu hücrelerin kontrolsüz veya anormal bir şekilde büyümesi ve çoğalmasıyla kanser oluşur. Kanser birden fazla genin değişik yollardan farklılaşmasıyla oluşan komplex bir hastalıktır. Vücuttaki hücrelerin kontrolsüz bir şekilde çoğalarak komşu dokuları işgal etmesi (invazyon) veya kaynağını aldığı organdan farklı bir yere, kan veya lenf yoluyla yayılması (metastaz) ile oluşur.Kanser potansiyeli olan hücrelerin en önemli özelliği onkogen içermesidir.Her bir hücrede, onkogenlerin aktivasyonunu indirgeyen tümör baskılayıcı genler bulunmaktadır. Tümör baskılayıcı genlerin kaybolması veya inaktive olması durumunda onkogen aktivitesine izin verilmiş olur. Bunu da kanserin oluşumunu sağlar ve hızlanmasına izin verir.Bu tez çalışmasında, meme ve endometrium kanserli hastalarından alınan doku ve kan örneklerinde RAPD-PZR tekniği kullanılarak genomdaki kararsızlık belirlenmiştir.Buna ek olarak, Tümörlerin monoklonal yapısını, malignant tümörlerin genetik heterojenliğini, metastatik hücrelerin değerlendirilmesini sağlayacak ve kanser hücrelerinde kanserogenez aşamalarını gösterebilecek ve takip etmek için kullanılabilecek bir yöntem olan RAPD-PCR, real-time PCR'ın HRM analiz boyutu ile de daha hassas değerlendirmeler yapabilmemizi sağlamıştır.

Özet (Çeviri)

Advances in the molecular biology and biotechnology enable the convenient use of molecular targets for diagnosing and treating cancer. Polymerase chain reaction (PCR)-based techniques allow us to obtain genetic information through the specific amplification of nucleic acid sequences starting with a very low number of target copies. Many applications in medicine or research require quantification of the number of specific targets in the specimen. Rapid PCR assays can be used in detection of genomic instabilities as a genome wide screening tool.Cancer is a complex disease, with multiple genes in diverse pathways involved in its initiation, progression, invasion and metastasis. In fact, it is widely accepted that the sequential accumulation of mutations that activate oncogenes and disrupt tumour suppressor genes, combined with multiple cycles of clonal selection and evolution facilitate the process of carcinogenesis.In this thesis work, RAPD-PCR is used to determine the genome wide genomic instability in blood, epithelial and paraffin embedded tissues of breast and endometrium cancer patients. In addition to RAPD-PCR further confirmation of the results is done using HRM analysis of real-time PCR. The results can aid the research for monoclonal nature of tumours, nature of malignant tumours, genetic heterogeneity of tumors, and the evaluation of metastatic cancer cells that can show the stages of cancinogenesis.

Benzer Tezler

  1. Triple negatif meme kanserinde elimusertib ATR inhibitörünün anti-kanser etkisinin belirlenmesi

    Determination of anti-cancer effect of elimusertib ATR inhibitor on triple-negative breast cancer

    AYTEN HACIEFENDİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Tıbbi BiyolojiSakarya Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GAMZE GÜNEY ESKİLER

  2. Genomik instabiliteden sorumlu apobec3b ekspresyonu ve dna yanlış eşleşme tamir (MMR) gen durumunun kolorektal kanserlerde saptanması ve tümörü infiltre eden lenfosit skoru üzerine etkilerinin değerlendirilmesi

    Determination of apobec3b expression and dna mismatch repair (MMr) gene status responsible for genomic instability in colorectal cancers and evaluation of their effects on tumor-infiltrating lymphocyte score

    MERVE DOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    PatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HATİCE KARAMAN

  3. Hodgkin Lenfoma hastalarında genomik insitabilitenin sitogenetik biyomarkerlerle araştırılması

    Assesment of genetic instability with cytogenetic biomarkers in patients with Non-Hodgkin Lymphoma

    OKTAY PERDECİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞÜKRÜ ÖZTÜRK

  4. Cloning, characterization and heterologons expression of the aspartokinase and aspartate semialdehyde dehydrogenase genes from the cephamycin C producer streptomyces clavuligerus

    Sefamisin C üreticisi streptomyces davuligerus'un aspartokinaz ve aspartat semialdehid dehidrojenaz genlerinin klonlanması, karakterizasyonu ve heterolog ekspresyonu

    SEDEF TUNCA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ

    PROF. DR. JACQUELİNE PİRET

  5. Fasulyede GPAT gen ailesinin karakterizasyonu ve kuraklık stresi altında PvGPAT1 geninin transgenik yaklaşımla fonksiyonunun belirlenmesi

    Characterization of the GPAT gene family in bean and determination of the function of the PvGPAT1 gene under drought stress with a transgenic approach

    AYŞE GÜL KASAPOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiErzurum Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMRE İLHAN