Quantitative analysis of different hsp genes expression on tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) plant under boron toxicity
Bor toksisitesine maruz bırakılmış domates (Lycopersicon esculentum Mill.) bitkisinde eksprese olan farklı hsp geninin kantitatif analizi
- Tez No: 342796
- Danışmanlar: DOÇ. DR. M. SERDAL SAKÇALI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Bor Toksisitesi, HSPs (Isı Şok Proteinleri), RT-PZR, Real-Time PZR, B toxicity, HSPs(Heat-shock Proteins), RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction), Real-Time PCR
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
Bor (B) elementi, bitkilerde bulunan temel bir mikroelementtir. Bu elementin azlığı ya da fazlılığı bitki metabolizmasında bulunan genlerin ekspresyon seviyelerinde birtakım değişikliklere yol açmaktadır. Bu metabolik değişimler, çalışmamızda kullandığımız domates (Lycopersicon esculentum Mill.)bitkisi üzerinde değerlendirilmiştir. Yetiştirdiğimiz domates fidelerinin farklı miktarlarda bor uygulanmış ortamlara yerleştirilmiştir ve yirmi dört saat sonrasında toplanan kök ve gövdelerin hem fizyolojik hem de moleküler düzeyde incelemeleri yapılmıştır.HSP (Isı Şok Proteini) adı verilen farklı HSP genleri kullanılacaktır. Seçtiğimiz bu genler, bitkide normal şartlar altında bulunan genlerdir, fakat değişik stres koşulları altında ekspresyon seviyelerinde değişim (yükselme) gösterdiği diğer yapılan çalışmalarla da kanıtlanmıştır.Amacımız, topraklardaki bor fazlalığı ve buna bağlı oluşan bor toksisitesinin HSP genlerinin ekspresyon seviyelerindeki artışın ve değişimin RT-PZR ve Real-Time PZR teknikleri kullanılarak elde etmektir.
Özet (Çeviri)
Boron (B) is an essential microelement in plants. Expression levels of genes in plants can differ at excess level of boron or deficiency of it. Metabolic changes are evaluated on tomato (lycpoersicon esculentum Mill.) plant. Breeded seedlings are put on the mediums which have different concentrated boric acid in them, after twenty-four hours plants are harvested that separated according to roots and shoot parts of plant. These samples are used in physiological and molecular tests.Different types of HSPs (Heat-Shock Protein) are found at normal conditions in the plant cells as proteins which are over-expressed under stress conditions on plants such as salinity, drought, biotic and abiotic stresses; that is proved many studies. Thus, the importances of HSPs are introduced. In this study, Real-Time PCR technique is used to analyze expressions of different HSPs quantitatively. Real-Time PCR is different the classical PCR which is measured amplified PCR products at each cycle throughout the PCR reaction.Aim of this study is obtain the data about excess amount of boron on soil therefore meaningful changing HSP genes expression levels by using PCR techniques as well as RT-PCR and Real-Time PCR. According to other molecular studies, real-time PCR technique is used for obtain quantitative analysis data. The results of the study will lead us to work on future studies.
Benzer Tezler
- Farklı mevsimlerde, saanen keçilerinde HSP 60 ve HSP 70 gen ekspresyon profili ve bazı fizyolojik stres parametreleri ile ilişkisi
HSP 60 and HSP 70 gene expression profile in different seasons and relationship with some physiological stress parameters in saanne goat
MERVE KAYKI
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
ZiraatAdnan Menderes ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT YILMAZ
- Saanen keçilerinde ısı şok proteini 60 (HSP 60) ve ısı şok proteini 70 (HSP 70) genlerinin kantitatif analizi
Quantitative analysis of heat shock protein 60 (HSP 60) and heat shock protein 70 (HSP 70) genes in saanen goats
SELÇUK ERTÜRK ADIYAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyokimyaAdnan Menderes ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FUNDA KIRAL
- Viscum album ekstresinin C6 sıçan glioma hücrelerinde stres proteinlerinin anlatımı üzerine etkisi
Effect of viscum album extract on the expression of stress proteins in C6 rat glioma cells
EVREN ÖNAY UÇAR
Doktora
Türkçe
2009
Genetikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAZLI ARDA
- Yaya caddelerinde mikro hareketin nicel analizi: İstiklal caddesi örneği
Quantitative analysis of micro movement on pedestrian streets: The case of İstiklal street
ALİ YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Şehircilik ve Bölge Planlamaİstanbul Teknik ÜniversitesiKentsel Tasarım Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL EREN KÜRKÇÜOĞLU
- Derin öğrenme yönteminin yüzün fotoğrafik incelenmesindeki etkinliğinin değerlendirilmesi
Determination of the effectiveness of deep learning method in facial photographic evaluation
MEHMET RIDVAN DEMİR