Geri Dön

X kromozomunda yer alan 5 farklı lokustaki tek nükleotid polimorfizmlerinin minisekanslama yöntemi ile araştırılması

Single nucleotide polymorphisms investigation 5 different locus on the X chromosome with minisekans method

  1. Tez No: 344069
  2. Yazar: SELİN YEŞİL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MELEK ÖZTÜRK SEZGİN, DOÇ. DR. ZUHAL EROĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Adli Tıp, Biyoloji, Genetik, Forensic Medicine, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Adli Tıp Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 113

Özet

Adli genetik DNA analizi ile karşılaştırma yaparak, babalık testleri, olay yerinde bulunan biyolojik kanıtların kimlik tespitini yapmak, insan kalıntılarından kayıp kişileri kimliklendirme gibi hukuki problemleri çözümlemeye yardımcı olmaktadır. Her kişide tek olan DNA dizileri karşılaştırılarak örnekler analiz edilir. Adli bilimlerde kimlik ve nesep tayininde genellikle STR lokusları kullanılmaktadır. Ancak son yıllarda kimliklendirmede ve babalık testlerinde STR analizlerine alternatif olarak SNP analizleri kullanılmaktadır. Bu çalışmada 5 adet X-SNP ( X018, X036, X047, X131, X142) lokusunun SNaPshot minisekanslama tekniği kullanılarak optimizasyon, validasyon ve analizinin yapılması, ayrıca bu lokusların adli bilimlerde olgu aydınlatmadaki faydası ve ülkemizdeki alel sıklıklarının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada 54 erkek 46 kadın bireyin genotipleri belirlenmiştir. Araştırılan 5 X-SNP lokusunun Türkiye populasyonunda da polimorfik olduğu tespit edilmiştir ve en düşük allel frekansı 0,230 olarak bulunmuştur. Avrupa, Asya ve Afrika toplumundaki populasyonlar ile Fst değeri kullanılarak karşılaştırılmıştır. Optimizasyon ve validasyon çalışmaları tamamlanmış 5 X-SNP lokusunun son uzunluk ortalamaları ve standart sapmaları hesaplanarak çalışmanın ve kullanılan yöntemin tekrarlanabilirliği ispatlanmıştır. Bu lokuslardan özellikle X131 lokusunun, Türk toplumuna özgün bir polimorfizm gösterdiği düşünülmektedir. Çalışılan X-SNP?lerin adli bilimler alanında kimliklendirme çalışmaları için uygun lokuslar olduğu, ancak çalışmanın daha fazla sayıdaki örnek ve X?e bağlı SNP belirteci eklenerek yapılmasının ayırt etme gücünü arttırmaya yardımcı olacağı sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Forensic genetics is the branch of genetics that, through DNA analysis and comparison, helps to resolve legal problems such as paternity tests, establishing identity in criminal cases where biological evidence is found at crime scenes, inheritance matters and identification of missing persons from human remains. In forensic genetics, DNA samples are analyzed by comparing DNA sequences that are unique to each individual. Forensic scientists often use STR loci for identification. In the last few years genetic identification and paternity testing are used SNP (Single Nucleotide Polymorphism) typing as an alternative to STR analysis. In this study, using the technique of SNaPshot 5 X-SNP (X018, X036, X047, X131, X142) locus optimization, validation and analysis, as well as lighting have the benefit of our country and the allele frequencies of loci in forensic science to investigate the case. 54 male 46 female individual genotypes were determined. 5 X-SNP locus researched were found to be polymorphic in the Turkey population and the lowest allele frequency was found to be 0,230. European, Asian and African society populations were compared using the Fst value. 5 X-SNP locus optimization and validation studies have been completed to by calculating last length averages and standard deviations of repeatability is proven of study and the method. Especially X131 loci, a polymorphism in Turkish society thought to the original. Worked X-SNPs locus are suitable for the identification in forensic science, but more work is done by adding numerous examples and X-linked SNP markers will help to increase the discriminative power is concluded.

Benzer Tezler

  1. Türk hemofili A hastalarında faktör VIII geninin I. intronundaki inversiyonun araştırılması

    Recurrent inversion breaking intron I of the factor VIII gene in Turkish hemophilia A patients

    MUSTAFA PEHLİVAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    HematolojiEge Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİLİZ BÜYÜKKEÇECİ

  2. The study of colorimetric pH probe and optical detection of heme attachment to cyt C by using genetically encoded indicators in living cells

    Kolorimetrik pH ölçer çalışması ve genetikle kodlanan floresan indikatörlerle sitokrom C konformasyonlarının belirlenmesi

    MEHMET YUNUS GENCEROĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HALİL BAYRAKTAR

  3. The effect of HLA DPB1 alleles on the immune response in chronic Hepatitis B

    Kronik Hepatit B hastalığında HLA DPB1 allelerin hastalığın immun yanıta etkisi

    NİLAY GURBET KARATAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Tıbbi Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Erciyes universitesi tıbbi genetik ana bilim dalına yönlendirilen frajil X sendromu tanısı almış hastaların normal, grey zone, premutasyon ve full mutasyon oranlarının değerlendirilmesi

    Assessment of normal, grey zone, premutation and full mutation rates of patients diagnosed with fragile x syndrome, which is directed to the main branch of genetic science of erciyes university medicine

    GİZEM GÖKGÖZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÇETİN SAATÇİ

  5. In vitro generation and characterization of the Wu syndrome model that causes mental retardation in neural cell lines

    Nöral hücre hatlarında zeka geriliğine neden olan Wu sendromu modelinin in vitro oluşturulması ve karakterizasyonu

    SÜMEYYE SEHER KARAMAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    GenetikÜsküdar Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN TAŞTAN