Geri Dön

Farklı ekolojilerdeki yem bitkilerinden laktik asit bakterisi izolasyonu ve tanılanması

Isolation and diognosis of lactic acid bacteria from forage crops in different ecologycal areas

  1. Tez No: 352074
  2. Yazar: EDA SARIKEÇİLİ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA KÜSEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Moleküler Tanılama, Lactobacillus, Silaj, BIOLOG GEN III, Polimerase Change Reaction, Molecular Identification, Lactobacillus, Silage, BIOLOG GEN III
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 53

Özet

Yem bitkilerinden izole edilen 70 adet LAB (Laktik Asit Bakterisi) izolatlarının biyokimyasal ve moleküler tanılaması yapılmıştır. LAB izolatlarının tamamı Gram pozitif, oksidaz negatif, katalaz negatif olduğu belirlenmiştir. Moleküler tanılama çalışmalarından BIOLOG GEN III tanılama sistemi ile 70 LAB izolatının: 21 tanesi Lactobacillus plantarum, 6 tanesi L. brevis, 3 tanesi L. bifermentas, 2 tanesi L. gasseri, 2 tanesi L. fructivorans, 1 tanesi L. aviarius ss araffinosus, 1 tanesi L. buchneri, 3 tanesi Enterococcus faecium, 3 tanesi E. gallinarum, 1 tanesi E. durans, 1 tanesi E. mundtii, 5 tanesi Pediococcus pentosaceus, 2 tanesi P. parvalus, 5 tanesi Leuconostoc citreum, 3 tanesi Brochotrix campestris, 2 tanesi Corynebacterium phocae, 2 tanesi Cornobacterium gallinarum, 1 tanesi Cornobacterium inhibens, 2 tanesi Weisella halotolerans, 1 tanesi Streptococcus suis serogroup, 1 tanesi S. salivarus, , 1 tanesi S. anginosus, 1 tanesi S. galolyticus ss galloyticus türleri olduğu tanımlanmıştır. BİOLOG GEN III Tanılama sistemi ile tanılanan LAB bakterilerden laktik asit üretme yeteneklerine göre 10 adet seçilmiş ve bu izolatların tamamında planF-pREV primeri 318 bç büyüklüğünde DNA parçasını çoğaltmıştır. WeiF-WeiR 5 izolatta 725 bç büyüklüğünde, 800R-27F primeri ise 7 izolatta 800 bç büyüklüğünde, FB-1492r primeri ise 3 izolatta 1200 bç büyüklüğünde bant oluşturduğu gözlenmiştir. Bakterilerin tanılamasında çalışmada kullanılan primerlerin, türlerin ayırımı için uygun olmadığı belirlenmiştir. Bundan dolayı çalışmada kullanılan izolatların ayrımı için farklı primerlerin ve tekniklerin geliştirilmesi gerektiği öngörülmektedir.

Özet (Çeviri)

Seventy LAB (lactic acit bacteria) strains isolated from forage crops were dignosed by biochemical and molecular methods. All LAB isolates were determined as Gram-positive, oxidase negative, catalase-negative. Molecular diagnostic studies by BIOLOG GEN III diagnostic system with the 70 LAB isolates showed that: of which 21 Lactobacillus plantarum, 6 Lactobacillus brevis, 5 Pediococcus pentosaceus, 5 Leuconostoc citreum, 3 Lactobacillus bifermentas, 3 Enterococcus faecium, 3 Brochotrix campestris, 3 Enterococcus gallinarum, 2 Lactobacillus gasseri, 2 Lactobacillus fructivorans, 2 Pediococcus parvalus, 2 Corynebacterium phocaea, 2 Carnobacterium gallinarum, 2 Weisella halotolerans and one for each of Enterococcus durans, Streptococcus suis serogroup, Lactobacillus aviarius ss araffinosus, Enterococcus mundtii, Streptococcus salivarius, Carnobacterium inhibens, Lactobacillus buchneri, Streptococcus anginosus and Streptococcus galolyticus ss galloyticus. Of isolates diagnosed by BIOLOG GEN III LAB diagnostic system, randomly selected 10 isolates were found to produce primers planF - pREV 318 bp sized DNA fragment. Also, five of these 10 isolates consisted 725 bp in size bans with WeiF-WEiR prirmers. Additionally, seven isolates of these ten isolates 800 bp sized band with 27F - 800R Primers and three of them produced 1200 bp size band wıth FB- 1492 primers. The primers used in diagnostics of bacterial species was determined to be unsuitable for the separation of species. Therefore, different techniques and primers need to be developed for the separation of isolates used in this study.

Benzer Tezler

  1. Farklı ekolojilerdeki mera bitkilerinin laktik asit bakteri izolasyonu ve silaj fermentasyon yeteneklerinin belirlenmesi

    The isolation and silage fermentation capabilities of lactic acid bacteria from diverse ecological pastures

    TUĞBA GÜNAYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA KIZILŞİMŞEK

  2. Sorgum x sudanotu çeşitlerinde farklı anız yüksekliklerinden biçimin ot verimi ve kalitesine etkileri

    Effects of stubble harvesting heights on hay yield and quality in sorghum x sudangrass varieties

    NURİ ERECEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET GÖKKUŞ

  3. Hindiba (Cichorium intybus L.)' nın Orta Karadeniz Bölgesinde yem üretim amaçlı kullanım olanaklarının belirlenmesi

    Determination of forage production possibilities of chicory (Cichorium intybus L.) in central Black Sea Region

    MEHMET CAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLKNUR AYAN

  4. Bazı şeker sorgum çeşitlerinde farklı biçim uygulamalarının ot verimi ve kalite özellikleri üzerine etkileri

    The effects of different cutting applications on grass yield and quality traits in some sweet sorghum varieties

    ELİF NUR SEZGİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FIRAT ALATÜRK

  5. Farklı kaba yem üretim sistemlerinde organik gübre uygulamalarının verim ve kalite üzerine etkileri

    Effects of organic fertilizer applications on yield and quality in different forage crop production systems

    EMRE KARA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA SÜRMEN