İnsanda SIRT6 geninde yaşlanmaya bağlı meydana gelen genetik ve epigenetik değişiklikler
Aging-dependent genetic and epigenetic alterations on SIRT6 gene in human
- Tez No: 352241
- Danışmanlar: PROF. DR. NERMİN GÖZÜKIRMIZI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Geriatri, Genetics, Geriatrics
- Anahtar Kelimeler: SIRT6, SSCA, SNP, yaşlanma, metilasyon, SIRT6, SSCA, SNP, aging, methylation
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 105
Özet
Bu çalışmada, metabolizma ve hayat döngüsünde önemli işlevleri olan SIRT6 genindeki genetik ve epigenetik değişiklikler ile yaşlanma arasındaki ilişki araştırılmıştır. Toplam 56 bireye (34 kadın ve 22 erkek) ait kan örneklerinden elde edilen genomik DNA'lar SIRT6 geninin 7 eksonunu çoğaltan 7 çift primer ile tarandı. Nükleotit çeşitliliği analizleri için tek iplik konformasyon polimorfizmi tekniği (SSCA) kullanıldı. 1, 2 ve 5. ekson bölgeleri için polimorfik bantlar gözlenirken; 3, 4, 6 veya 7. ekson bölgelerinde hiçbir bireyde farklılık bulunmadı. Bireylerin %17.9'u en az bir eksonik bölge için polimorfik bant profili gösterdi. Bu örneklerin dizi analizi ile intron veya ekson dizilerinde 5 delesyon, 3 insersiyon ve 7 nükleotit çeşitliliği saptandı. Ancak, gözlenen tek nükleotit polimorfizmleri ile uzun yaşam arasında anlamlı bir ilişki bulunamadı. Epigenetik değişiklik olarak SIRT6 geninin promotöründeki metilasyon oranları, genomik DNA'nın bisülfit dönüşümü sonrası real-time PCR analizi ile belirlendi. Buna göre, 0-19 yaş grubundaki bireylerde metilasyon yüzdesi %43.21 iken 20-79 yaş grupları arasında bu oranın %65.63'e çıktığı, 80-99 yaşlarında ise %52.15'e indiği saptandı.
Özet (Çeviri)
In this study, we investigated the association between longevity and genetic and epigenetic alterations in SIRT6 gene which plays important roles in metabolism and life span. Isolated genomic DNAs from blood samples of 56 individuals (34 females and 22 males) were screened using 7 pairs of primers covering 7 exons of SIRT6 gene. Single-strand conformation polymorphism (SSCP) technique was performed for nucleotide variation analyses. We observed polymorphic band patterns for exonic regions 1, 2, and 5; but not for 3, 4, 6 or 7. 17.9% of the subjects retained a polymorphic band pattern for at least one of those exonic regions. The sequencing of those samples revealed 5 deletions, 3 insertions, and 7 single nucleotide variations (SNVs) on either the intronic or exonic sequence. However, we found no significant evidence of an association between observed single nucleotide polymorphisms and longevity. For epigenetic changes, the methylation levels of SIRT6 gene promoter were detected by real-time PCR analysis following bisulfite treatment of genomic DNA. While the results indicated 43.21% methylation in 0-19 age groups, this ratio is found to be increased up to 65.63% in 20-79 age groups, and decreased to %52.15 in 80-99 age groups.
Benzer Tezler
- Foliküler lenfomalarda sirtuin gen ifade profili
Gene expression profiling of sirtuins in follicular lymphoma
LALEH MADAYEN SHISHEVAN
Doktora
Türkçe
2022
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTemel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLŞAH KAYGUSUZ
- Tip 2 diyabetli hastalarda lökosit telomer uzunluğunun; sirtuin-1 düzeyi, glisemik kontrol, diyabetik komplikasyonlar, vücut yağ dağılımı, beslenme ve egzersiz alışkanlıkları ile ilişkisi
The relationship between leukocyte telomere length and sirtuin-1 level, glycemic control, diabetic complications, body fat distribution, nutrition and exercise habits in patients with TYPE 2 diabetes
NAZMİ GÖKHAN ÜNVER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıGazi Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALEV EROĞLU ALTINOVA
PROF. DR. MÜJDE YAŞIM AKTÜRK
DOÇ. DR. CEYLA KONCA DEĞERTEKİN
- Yağ grefti sağ kalımının arttırılmasında eksozomların etkileri
Effects of exosomes for increasing fat graft survival
OZAN CAN CANBOLAT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiEge ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YİĞİT ÖZER TİFTİKCİOĞLU
- Ağrı oluşturan lazer ve elektrik uyarısıyla kaslarda oluşan refleks cevap ve kütanöz sessiz periyodun incelenmesi
An ınvestıgatıon of cutaneous sılent perıod ınduced by laser and electrıcal stımulatıon
MEHMET CEMAL KAHYA
Doktora
Türkçe
2010
BiyofizikEge ÜniversitesiBiyofizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜRBÜZ ÇELEBİ
PROF. DR. KEMAL SITKI TÜRKER
- A. Turan Oflazoğlu oyunlarından IV. Murat-Deli İbrahim-Kösem Sultan karakterlerinin birbirleri arasındaki iktidar savaşları
From the plays of A. Turan Oflazoğlu, the power struggles between the characters IV. Murat-Deli İbrahim-Kösem Sultan
GÖKHAN SEYHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Sahne ve Görüntü SanatlarıHacettepe ÜniversitesiTiyatro Ana Sanat Dalı
DOÇ.DR. FÜSUN BALKAYA