Geri Dön

Şanlıurfa ilindeki Salmonella enterica subsp. enterica sürveyans çalışması

Salmonella enterica subsp. enterica sürveyans study in Şanlıurfa city

PDF İndir

  1. Tez No: 353860
  2. Yazar: İLHAN ÜNER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FADİLE YILDIZ ZEYREK
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Multilocus Sequence Typing, Salmonella, Şanlıurfa, aroC, dnaN, hemD, hisD, purE, sucA ve thrA, Multilocus Sequence Typing, seven genes (aroC, dnaN, hemD, hisD, purE, sucA and thrA), Salmonella, Sanliurfa
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Harran Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 71

Özet

Bu çalışmanın amacı, Salmonella etkeninin Şanlıurfa bölgesinde genotipik ve fenotipik olarak serotiplendirilmesidir. Şanlıurfa ilinde, 3 yıl içerisinde klinik vakalardan toplanmış, 50 adet izolat serotiplendirme ve Multilocus Sequence Typing (MLST) yöntemi ile tanımlanmıştır. Konvansiyonel metodlarla Salmonella olduğu düşünülen izolatlar, Salmonella için spesifik olan invA geni hedef alınarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile doğrulanmıştır. invA geni tespit edilerekSalmonella olduğu doğrulanan izolatlar fenotipik (serotiplendirme) ve genotipik (MLST) yöntemler kullanılarak tanımlanmışlardır. Çalışmada kullanılan MLST metodu için 7 gen bölgesi (aroC, dnaN, hemD, hisD, purE, sucA ve thrA) hedeflenmiştir. Biyoinformatik araçlar, sekans sonuçlarının filogenetik analizi için kullanılmıştır. Çalışmaya dahil edilen 50 Salmonella izolatının toplam altı serotipten oluştuğu, % 61.1 ile en çok S. Paratyphi olduğu görülmüştür. Tespit edilen diğer serotipler ise srasıyla şunlardır: S. Typhimurium (% 11.1), S. Kentucky (% 9.3), S. Enteritidis (% 3.7), S. Othmarschen (% 3.7) ve S. Typhi (% 3.7). Sonuç olarak, Şanlıurfa ilinde gastroenterit ve tifo tanısı alan hastalarda etken olarak izole edilen Salmonella türlerinin serotiplendirilmesi ilk olarak yapılmıştır. Ve daha önce rapor edilmemiş yeni bir Salmonella subserotipi Şanlıurfa ilinde tespit edilememiştir. MLST yönteminin Salmonella serotiplendirilme ve subtiplendirilmesi için duyarlı ve ayırıcı bir yöntem olduğu kanısına varılmıştır.

Özet (Çeviri)

The objective of this research is to utilize genotypic and phenotypic methods to serotyping Salmonella in Sanliurfa region. A collection of 50 human clinical Salmonella isolates obtained from across Sanliurfa City over the course of 3 year was characterized using serotyping and a multilocus sequence typing (MLST). Salmonella suspected colonies from conventional methods was confirmed by using polymerase chain reaction (PCR) of Salmonella specific gene, invA. In the cases of presented of invA, isolates was assigned as Salmonella. Confirmed Salmonella isolates was characterized using phenotypic (serotyping) and genotypic (MLST) methods. For MLST, seven genes MLST (aroC, dnaN, hemD, hisD, purE, sucA and thrA) method was used. A Bioinformatics tool was used in phylogenetic analysis of sequence results. The 50 isolates were differentiated into 6 serotypes. In the present study, the most common serotype was S. Paratyphi (61.1%). The other serotypes and detection rates were S. Enteritidis (3.7%), S. Kentucky (9.3%), S. Othmarschen (3.7%), S. Typhi (3.7%) and S. Typhimurium (11.1%). Previously unreported Salmonella subtype have not been detected in Sanliurfa region, but MLST is sensitive and distinctive method for serotyping and subtyping of Salmonella.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    620681

    Androctonus crassicauda (Oliver, 1807) akrep türünün dış morfolojik özelliklerinin taramalı elektron mikroskopla belirlenmesi ve zehirinin biyokimyasal analizi

    Determination of morphological properties of Androctonus crassicauda (Oliver, 1807) scorpion species with scanning electron microscope and biochemical analysis of venom

    MEHMET ALİ DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyokimyaKastamonu Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ZAFER SANCAK

  2. Tez No

    664163

    Şanlıurfa ilindeki bankaların kurumsallaşma düzeyleri ile çalışanlarının performans düzeyleri arasındaki ilişki: Kamu ve özel banka karşılaştırılması

    The relationship between the institutionalization levels of the banks in Şanlıurfa and the performance levels of the employees: Comparison of public and private bank

    EMRE YILDIZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BankacılıkHarran Üniversitesi

    İşletme Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMET ÇAKIR

  3. Tez No

    260034

    Şanlıurfa ilindeki tarım kooperatiflerinin sorunları ve çözüm önerileri üzerine bir araştırma

    Cooperative agricultural problems and solutions of the Sanliurfa city on the proposed research

    SERAP GÜLLÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    ZiraatHarran Üniversitesi

    Tarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAHRİ KARLI

  4. Tez No

    177902

    Şanlıurfa ilindeki yüksek öğretim kurumları dersliklerinde iç hava kalitesinin incelenmesi ve modellenmesi

    Investigation and modelling of indoor air quality at the higher education classrooms in Şanliurfa

    MEHMET KUŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Makine MühendisliğiBalıkesir Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. CEMAL OKUYAN

    Y.DOÇ.DR. HÜSEYİN BULGURCU

  5. Tez No

    459696

    Suriyeli mülteci çocuklarda görülen enfeksiyon hastalıkları ve hastane yönetiminin aldığı önlemler; Şanlıurfa ili örneği

    The infectious di̇saeses have been found amang the Syrian refuge children's and precautions that have been taken by the hospitals' administrators; The Şanlıurfa city sample

    GÜLCAN ÇAPAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    HastanelerBeykent Üniversitesi

    İşletme Yönetimi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. VOLKAN ÖNGEL

Geri Dön