Proteomik çalışmalarda albümin uzaklaştırılmasında karayosunlarının kullanılabilirliğinin araştırılması
A research on usage possibility of mosses for albumin removal in proteomic studies
- Tez No: 355517
- Danışmanlar: PROF. DR. ADNAN ERDAĞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyoloji, Botanik, Biochemistry, Biology, Botany
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 109
Özet
Çalışmalarda kullanılmak üzere Antitrichia californica Sull., Pterogonium gracile (Hedw.) Sm., Hypnum cupressiforme Hedw. ve Homalothecium sericeum (Hedw.) Bruch, Schimp. & W.Gümbel türlerine ait karayosunları, 2012 yılı Ekim ayında Aydın/Koçarlı mevkiinden toplandı. Deney materyalinin karakterizasyonu için SEM görüntüleme, FTIR spektrumları ve Elementer Analiz gibi tekniklerden faydalanıldı. Karakterizasyonu gerçekleştirilen bitki partikülleri, proteinlere karşı pseudo-spesifik afinite gösteren bir ligand olan IMEO ile silanlandı. Bu çalışmada protein yapıdaki BSA'nın, karayosunu partikülleri tarafından tutulması hedeflenerek, bu amaç doğrultusunda silanlanmış ve silanlanmamış bitki partikülleri ile adsorpsiyon denemeleri gerçekleştirildi. Adsorpsiyonun maksimum olduğu, sıcaklık, inkübasyon süresi, ortam pH'ı, BSA başlangıç derişimi ve iyonik şiddet gibi deney şartlarının tespit edilmesini amaçlayan denemeler sırasında deney ortamına protein salımı gerçekleştiği gözlendi. Bitkisel partiküllerin yıkanması ile bu durumun üstesinden gelinmeye çalışılsa da yıkanan bitkiler ile gerçekleştirilen deneylerde tekrar ortama protein salımı gerçekleştiği tespit edildi. Bu nedenle ortama protein salan bitkisel materyalin proteomik çalışmalarda albümin uzaklaştırma için kullanılmasının uygunsuz olduğuna karar verildi.
Özet (Çeviri)
Antitrichia californica Sull., Pterogonium gracile (Hedw.) Sm., Hypnum cupressiforme Hedw. and Homalothecium sericeum (Hedw.) Bruch, Schimp. & W.Gümbel moss materials were collected from Aydın/Koçarlı location in October, 2012. Characterization of the plant materials were carried out by using technics such as SEM imaging, FTIR spectrums and Elemental Analysis. Characterized plant materials were silanized by IMEO, which is a pseudo-specific ligand for protein affinity. In this study, the BSA protein adsorption capability of both silanized and non-silanized plant materials were tried. During the experiments for revealing the maximum adsorption of BSA to the plant material by testing certain parameters such as temperature, incubation time, pH, BSA initial concentration and ionic strength, it was found out that there have been a protein release to the test medium. This release was tried to be prevented or removed by washing the plant material. The washed plant material still released protein to the medium. Thus it was concluded that the plant material releasing protein to the medium is improper for its use in albumin removal for proteomic studies.
Benzer Tezler
- Yüksek ve düşük döngülü üremik kemik hastalığı olan kronik böbrek yetersizlikli hastaların serum proteomiks analizi
Proteomics analysis of serum samples from chronic renal failure patients with high and low bone turnovers
MEHMET TUNCAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
NefrolojiKocaeli Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ITIR YEĞENAĞA
- Bakteriyel selüloz nanofiberler ile protein uzaklaştırılması
Protein depletion with bacterial cellulose nanofibers
ILGIM GÖKTÜRK BAŞAL
Doktora
Türkçe
2016
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiNanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADİL DENİZLİ
- Dye incorporated nanopolymers for albumin depletion
Albumin uzaklaştırması için boya bağlı nanopolimerler
ŞULE YEŞİM YILDIZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyokimyaGediz ÜniversitesiNanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SİNAN AKGÖL
- CACO2 kolon kanseri hücrelerinde ultra performanslı sıvı kromatografisi-kütle spektroskopisi bazlı proteomik çalışmalar
Ultra performance liquid chromatography-mass spectroscopy based proteomics studies on CACO2 colon cancer cells
ENGİN KOÇAK
Doktora
Türkçe
2017
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiAnalitik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SACİDE ALTINÖZ
- Sağlıklı ve meme kanseri hastası kadınların (tedavi almamış, tedavi alan ve tedavi olmuş) serum proteinleri değişiminin 2-d (iki boyutlu) elektroforez ile tespiti
Detection with two dimensional gel electrophoresis the change of serum proteins in breast cancer patients (the untreated group, the treated group and the cured group) and healthy women
CEVAHİR ALTINKAYNAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyokimyaErciyes ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. DUYGU ÖZEL DEMİRALP
YRD. DOÇ. DR. NALAN ÖZDEMİR