Geri Dön

Bakteriyel selüloz nanofiberler ile protein uzaklaştırılması

Protein depletion with bacterial cellulose nanofibers

  1. Tez No: 444637
  2. Yazar: ILGIM GÖKTÜRK BAŞAL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ADİL DENİZLİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Kimya, Biochemistry, Bioengineering, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Nanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 103

Özet

İnsan serum albumin (HSA) baskılanmış bakteriyel selüloz (MIP BS) kompozit nanofiberler, proteomik çalışmalarda albumin gibi yüksek yoğunlukta bulunan proteinlerin plazmadan uzaklaştırılması amacıyla hazırlanmıştır. N-metakriloil L-histidin metil ester (MAH) monomeri spesifik tanıma bölgeleri oluşturmak için sentezlenmiştir. MAH monomeri ile Cu+2 iyonu arasında kompleks oluşumundan sonra metal iyon koordinasyon etkileşimleri kullanılarak MAH-Cu+2 monomeri ve HSA hedef molekülleri ile önkompleks hazırlanmıştır. MIP BS kompozit nanofiberler farklı toplam % monomer oranlarında ve farklı monomer/hedef molekül mol oranlarında hazırlanmıştır. Karakterizasyon çalışmaları için FTIR-ATR, SEM, BET ve temas açısı ölçümleri yapılmıştır. Adsorplanan protein molekülleri polimerik yapıdan 1.0 M NaCl çözeltisi kullanılarak desorbe edilmiştir. Adsorpsiyon çalışmaları farklı pH, sıcaklık ve iyonik şiddette gerçekleştirilmiş ve adsorpsiyon kapasitesi spektrofotometrik olarak analiz edilmiştir. Uygun denge izoterm modeli Langmuir izotermi olarak belirlenmiştir. Bu sistem için hız sınırlayıcı basamağın kimyasal reaksiyon olmasından dolayı yalancı-ikinci derece kinetik modelin bu sisteme daha uygun olduğu belirlenmiştir. MIP BS kompozit nanofiberlerin seçiciliğinin değerlendirilmesi için hedef moleküle benzer yapıda olan insan miyoglobin (Myo) ve insan transferrin (HTr) proteinleri kullanılmıştır. MIP BS kompozit nanofiberlerin bağıl seçicilik katsayısı HSA/HTr ve HSA/Myo molekül çifti için sırasıyla 4.73 ve 3.02 olarak hesaplanmıştır. Sonuç olarak, moleküler baskılanmış polimerler hazırlanırken metal iyon koordinasyonu etkileşimlerinin spesifik bağlanma bölgeleri oluşturmada katkısının olduğu tespit edilmiş, protein baskılama işleminin yüksek adsorpsiyon kapasitesi ile başarılı bir şekilde gerçekleştiği gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

Human serum albumin (HSA) imprinted bacterial cellulose (MIP BC) composite nanofibers were synthesized to deplete high abundance proteins such as albumin for proteomics studies. N-methacryloyl-L-histidine methyl ester (MAH) was synthesized to create specific binding sites. After the complexation between MAH and chelating metal ion, Cu+2, the preorganized complex was prepared by MAH-Cu+2 monomer and HSA template molecules via metal ion coordination interactions. HSA imprinted bacterial cellulose composite nanofibers were prepared in the presence of different amounts of total monomer weight (%) and monomer/template ratio. FTIR-ATR, SEM, BET and contact angle measurements were carried out for characterization of bacterial cellulose composite nanofibers. 1.0 M NaCl solution was used for desorption of adsorbed proteins from the polymer network. Adsorption studies were performed with respect to pH, temperature and ionic strength and the adsorption capacity was evaluated spectrophotometrically. The suitable equilibrium isotherm model was determined as Langmuir isotherm. It was determined that pseudo-second order kinetic model was more convenient to this system referring chemical reaction as a rate limiting step. To evaluate the selectivity of the MIP BC composite nanofibers, similar proteins were utilized as competitor proteins, which were human myoglobin (Myo) and human transferrin (HTr). The relative selectivity coefficients of MIP BC composite nanofibers for HSA/HTr and HSA/Myo pairs were calculated as 4.73 and 3.02, respectively. Consequently, while preparing molecularly imprinted polymers, metal ion coordination interactions were found to contribute for the fabrication of specific recognition binding sites with imprinting of the template protein successfully with high adsorption capacity.

Benzer Tezler

  1. Albumin uzaklaştırılması için selüloz nanofiberler

    Affinity depletion of albumin with cellulose nanofibers

    EMEL TAMAHKAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyomühendislikHacettepe Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADİL DENİZLİ

    PROF. DR. TÜLİN KUTSAL

  2. Atık sulardan estradiol uzaklaştırılması için E2 baskılanmış nanopartikül bakteriyel selüloz kompozit sistemin hazırlanması

    Preparation of E2 imprinted nano-particle-bacterial cellulose composite systems for the depletion of estradiol from waste waters

    İLKER KOÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    KimyaHacettepe Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADİL DENİZLİ

  3. Cytochrome C purification with surface imprinted bacterial cellulose nanofibers

    Yüzey baskılanmış bakteriyel selüloz nanofiberler ile Sitokrom C saflaştırılması

    EMEL TAMAHKAR IRMAK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyomühendislikHacettepe Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADİL DENİZLİ

    PROF. DR. TÜLİN KUTSAL

  4. Yüzey baskılanmış bakteriyel selüloz nanofiberler ile fenol uzaklaştırılması

    Phenol removal with surface imprinted bacterial celulose nanofibers

    RECEP YEŞİLÖZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    KimyaHacettepe Üniversitesi

    Nanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NECDET SAĞLAM

  5. Enerji uygulamaları için metal organik kafes ve bakteriyel selüloz hibrit yapılardan türetilmiş malzemelerin geliştirilmesi

    Investigation of metal organic frameworks and bacterial cellulose derived hybrid materials for energy applications

    MERT BALKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Metalurji MühendisliğiEskişehir Teknik Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜNAL ŞEN