Geri Dön

TCF7L2 geni ve 8Q24 bölgesi varyantlarının C-MYC gen anlatımı ve kolorektal kanser riski üzerindeki olası etkilerinin incelenmesi

Investigation of the possible effects of TCF7L2 gene and 8Q24 region variants on C-MYC gene expression and colorecral cancer risk

PDF İndir

  1. Tez No: 360075
  2. Yazar: NAZLI EZGİ ÖZKAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İLHAN YAYLIM
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 103

Özet

C-myc normalde hücredeki pek çok geni kontrol eden bir transkripsiyon faktörü kodlar ve kolorektal kanserde artmış c-myc aktivitesi yaygındır. 8q24 bölgesindeki rs6983267 değişimi, KRK riski ile ilişkilendirilmiştir ve ortak bir TCF bağlanma dizisi aralığında yer almaktadır. Wnt/ß-katenin sinyal yolağının üyelerinde olan TCF7L2 c-myc ekspresyonunu düzenler. Çalışmamızda, rs6983267 varyantları ve TCF7L2 varyantlarının KRK riski ve klinik parametrelerle birlikte incelenmesi ve c-myc ekspresyon seviyelerinin karşılaştırılması amaçlanmıştır. 127 kontrol ve 117 KRK hastasında rs6983267 ve rs7903146 polimorfizimlerinin KRK riski ve hastalığın prognozu ile olan ilişkileri incelenmiştir. 36 KRK hastasının tümör ve çevre dokularındaki c-myc ekspreyon seviyeleri karşılaştırılmıştır. Rs6983267 T alleli (TT+GT) hastalarda yüksek bulunmuştur (p=0,042). Rs6983267 G alleli (GG+GT) ileri evre tümör (T3+T4)(p=0,054) ve nod metastazı varlığında (p=0,060) yüksek bulunmuştur. rs7903146 C alleli(CC+CT) erken evre tümörlerde (T1+T2) yüksek bulunmuştur(p= 0,037). Rs7903146 CT genotipinin KRK hastaları içerisinde kadınlarda daha fazla gözlenmiştir(p=0,011). rs6983267TT ve rs7903146CT(TT-CT) kombine genotipi düşük tümör evreli(T1+T2)(p=0,001) ve nod metastazı olmayan hastalarda(p=0,008) yüksek bulunmuştur. rs6983267 için GG genotipi referans alındığında, T alleli taşıyanlarda artmış c-myc ekspresyonu gözlenmiştir(p>0,05). rs7903146 için CC genotipi referans alındığında, T alleli taşıyanlarda artmış c-myc ekspresyonu gözlenmiştir(p>0,05). Çalışmamız rs6983267 ve rs7903146 polimorfizimlerinin KRK prognozunda etkili olabileceğini belirtmektedir. Her iki polimorfizmin c-myc ekspresyonuna potansiyel etkileri üzerine ortaya koyduğumuz sonuçların özellikle ileri dönemde yapılacak çalışmalara farklı bir bakış açısı kazandırabileceğini düşünüyoruz.

Özet (Çeviri)

C-myc proto-oncogene encodes a transcription factor that is normally responsible from regulation of a variety of cellular processes and altered c-myc activity is a common feature in colorectal cancers (CRC). 8q24 region is a gene desert with 1.2 Mb length and contains a number of SNPs that have been related to cancer. rs6983267 is known to be related with CRC and located within a TCF sequence. TCF7L2 is a transcription factor of Wnt/ ß-catenin signaling pathway which is activated in colorectal cancers and known to regulate c-myc gene expression. The aim of the present study is to evaluate the effects of rs6983267 and TCF7L2 gene variants on c-myc expression and possible relation with colorectal cancer risk and progression. 117 CRC patients and 127 healthy controls were analyzed for rs6983267 and rs7903146 polymorphisms. Tumor and surrounding tissues of 36 KRK patients were analyzed for c-myc expression. For Rs6983267 polymorphism T allele (TT+GT) frequency was found to be increased in CRC patients (p=0.042). rs6983267 G alelle (GG+GT) were higher in advanced stage(T3+T4) tumors(p=0.054) and in the presence of nod metastasis (p=0.060). rs7903146 C allele (CC+CT) was higher in early stage (T1+T2) tumors(p= 0.037). rs7903146 CT genotype was more frequent in the female CRC patients(p=0.011). rs6983267 TT and rs7903146 CT (TT-CT) combined genotype was high in early tumor stage (T1+T2)(p=0.001) and in the absence of nod metastasis(p=0.008). For rs6983267 polymorphism, increased c-myc expression was observed in the individuals with T allele when GG genotype was considered as the reference (p>0.05). For rs7903146 polymorphism, increased c-myc expression was observed in the individuals with T allele when CC genotype was considered as reference (p>0.05). Our results indicate a possible relation between rs6983267 and rs7903146 polymorphisms and CRC progression. In addition, we represent the possible effects of both polymorphisms on c-myc expression and represent a different point of view for further studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    478950

    PANC-1 ve BXPC-3 pankreas kanseri hücre hatlarında juglon uygulamasının wnt sinyal yolu aktivesi ile metastaz ve anjiyogenez üzerine etkilerinin moleküler yöntemler ile analizi

    Molecular analysis of the effects of juglone application on metastasis and angiogenesis in PANC-1 and BXPC-3 pancreatic cancer cell lines via activation of wnt signaling pathways

    FATMA GÖKTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Tıbbi BiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. DUDU ERKOÇ KAYA

  2. Tez No

    290355

    Transkripsiyon faktörü-7 benzeri 2 geni rs7903146 varyasyonunun insülin ilişkili göstergeler ve kan yağları ile ilişkisi

    The relationship of transcription factor 7 like -2 gene rs7903146 variation with insulin related parameters and lipids

    ÇİĞDEM KAHVECİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiMarmara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BELGİN SÜSLEYİCİ DUMAN

  3. Tez No

    316843

    Konya bölgesinde tip 2 diabetes mellitus hastalarında TCF7l2 (Transcription factor 7 like-2) gen polimorfizmlerinin taranması ve hastalık ile ilişkilerinin ortaya konulması

    Screening of TCF7l2 (transcription factor 7 like-2) gene polymorphisms and its association with disease among type 2 diabetes mellitus patients in konya region

    DUDU ERKOÇ KAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Moleküler TıpSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HİLAL ARIKOĞLU

  4. Tez No

    728320

    Sporun temel moleküler mekanizmaların düzenlenmesi sürecindeki epigenetik etkilerinin araştırılması

    Investigation of the epigenetic effects of sport in the process of regulation of basic molecular mechanisms

    ZELİHA BAŞTÜRK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    SporSelçuk Üniversitesi

    Beden Eğitimi ve Spor Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET KILIÇ

  5. Tez No

    791586

    Кыргыз популяциясында семирүүгө жакындуулукту аныктоочу генетикалык маркерлерди издөө

    Kırgız nüfusundaki obeziteye yatkınlıgı belirleyen genetik markörlerin araştırılması

    ADİNAY KARIPOVA

    Yüksek Lisans

    Kırgızca

    Kırgızca

    2022

    BiyoteknolojiKırgızistan-Türkiye Manas Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KADIRBAY ÇEKİROV

    PROF. DR. CAYNAGÜL İSAKOVA

Geri Dön