Endoplazmik retikulum stresinde rol oynayan CHOP geninin (DDIT3) CRISPR/Cas9 sistemi aracılığıyla diyabet ile ilişkisinin belirlenmesi
Determination of the relationship between diabetes and the CHOP (DDIT3) gene involved in endoplasmic reticulum stress using the CRISPR/Cas9 system
- Tez No: 993959
- Danışmanlar: PROF. DR. ELVAN BAKAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Diyabet patogenezinde ER stresi önemli bir rol oynamaktadır. Bu tez kapsamında, MIN6 pankreatik β hücre hattında ER stresinin tunikamisin ile indüklenme koşulları MTT ve RT-PCR analizleri ile belirlenmiştir. ER stresinin artması, UPR yolağını aktive ederek bir transkripsiyon faktörü olan CHOP protein ekspresyonunun güçlü bir şekilde indüklenmesine ve bu sayede hücrede stres–apoptoz dengesinin bozulmasına neden olmaktadır. CHOP proteinini kodlayan CHOP geninin CRISPR/Cas9 sistemleri aracılığıyla silinmesinin ER stresi etkilerini gidereceği hipotezine dayanarak yapılan çalışmalarda, CHOP geni başarılı bir şekilde silinmiş ve ER stresinin indüklendiği ve indüklenmediği koşullarda, ek olarak stres oluşturulmadan önce ve oluşturulduktan sonra yapılan bu gen düzenlemenin pankreatik β hücrelerinde, RT-PCR analizleri ile diyabet ile ilişki gen ifadelerinin değişimi incelenmiştir. Buna ek olarak diyabet patogenezinde merkezi bir rol oynayan ER stresinin, glukoz uyarılı insülin sekresyonu üzerinde etkileri ELİSA analizleri ile incelenmiştir. Bu bulgular ile CHOP proteinini hedef alan gen düzenleme yaklaşımlarının diyabet patojenezindeki etkileri üzerinde literatüre katkı sağlanması hedeflenmiştir. Tunikamisin ile oluşturulan ER stresinin MIN6 hücre hattında diyabetle ilişkili incelenen birçok genin ekspresyonunu artırdığı gösterilmiştir. Elde edilen bulgular, CHOP silinmesinin hücrelerdeki stres yükünü azalttığını, stresle ilişkili genlerin (IGF2BP2, CDKAL1, HNF1A, TCF7L2) ekspresyon profillerini dengelediğini ve özellikle insülin sekresyonunun korunmasına katkı sağladığını göstermektedir.
Özet (Çeviri)
ER stress plays a critical role in the pathogenesis of diabetes. In this thesis, the induction conditions of ER stress in the MIN6 pancreatic β-cell line were determined using MTT and RT-PCR analyses following tunicamycin treatment. Increased ER stress activates the UPR pathway, leading to a strong induction of CHOP protein expression—a transcription factor—and consequently disrupting the cellular stress–apoptosis balance. Based on the hypothesis that CRISPR/Cas9-mediated deletion of the CHOP gene, which encodes the CHOP protein, may alleviate the effects of ER stress, CHOP was successfully knocked out, and changes in the expression of diabetes-related genes were examined under conditions with and without ER stress, as well as before and after stress induction, using RT-PCR analyses. Additionally, the effects of ER stress—which plays a central role in diabetes pathogenesis—on glucose-stimulated insulin secretion were evaluated using ELISA analyses. Through these findings, it was aimed to contribute to the literature regarding the impact of gene-editing approaches targeting CHOP on diabetes pathogenesis. The results demonstrated that tunicamycin-induced ER stress increased the expression of several diabetes-related genes in the MIN6 cell line. Moreover, the findings indicate that CHOP deletion reduces cellular stress burden, stabilizes the expression profiles of stress-associated genes (IGF2BP2, CDKAL1, HNF1A, TCF7L2), and particularly contributes to the preservation of insulin secretion.
Benzer Tezler
- Mutant proteinlere bağlı endoplazmik retikulum strese cevapta rol oynayan genlerin in vitro analizi
In vitro analysis of genes that involved in response to endoplasmic reticulum stress associated with mutant proteins
MUHAMMED ABDULVAHİD KALKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Kardiyolojiİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BURÇAK VURAL
DOÇ. DR. AYŞE EVRİM BAYRAK
- Tunikamisin ile uyarılmış endoplazmik retikulum stresine bağlı gelişen apoptozis üzerine shilajit'in etkileri
The effects of shilajit on tunicamycin induced endoplasmic reticulum stress caused by apoptosis
NURTEN TAŞCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Histoloji ve EmbriyolojiZonguldak Bülent Ecevit ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEHRA SAFİ ÖZ
DOÇ. DR. MERYEM AKPOLAT FERAH
- JNK inhibisyonunun diyabetik testis dokularındaki endoplazmik retikulum stresine etkisi
Effect of JNK inhibition on endoplasmic reticulum stress in diabetic testicular tissues
ŞİNASİ BAYRAM
Doktora
Türkçe
2020
Histoloji ve EmbriyolojiTrakya ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLNUR KIZILAY ÖZFİDAN
PROF. DR. ENGİN DEVECİ
- Prostat kanseri hücrelerinde bor bileşiklerinin endoplazmik retikulum (ER) stresine olan etkisinin araştırılması
Investigating the effect of boron compounds on endoplasmic reticulum stress (ER) in the prostate cancer lncap cell line
İREM ÇOKSEVER
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiBursa Uludağ ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BURCU ERBAYKENT TEPEDELEN
- PhTAD türevli dihidropirol bileşiklerinin anti-kanser aktivitelerinin araştırılması
Investigation of anti-cancer activities of PhTAD-substituted dihydropyrrole derivatives compounds
MAŞUK AKŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAmasya ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARİF AYAR