Multiscale tumor modeling
Çok boyutlu tümör modelleme
- Tez No: 360583
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. AYBAR CAN ACAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Matematik, Onkoloji, Computer Engineering and Computer Science and Control, Mathematics, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Enformatik Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Sağlık Bilişimi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Kanserin karmaşık yapısı tedavilerin başarı oranını düşürmektedir. Klasik tedavi kanserin tipinin ve hangi fazda oldugunun belirlenmesinin ardından tıbbi klavuzlara göre tedavi edilmesi ile devam eden bir süreçtir ve kişiselleştirilmiş tedaviler bu süreçte yer almamaktadır. Hastaya özel tibbi veriyi ve güncel bilimsel kanitlari iş kuralları olarak kullanan simülasyon sistemleri hekimlere kişiselleştirilmiş kanıta dayalı tedavi uygulama şansı tanımaktadir. Bu çalismadaki hedefimiz, basit bir tümör modeli oluşturarak, tümör modelleme konusunda çalışmaya istekli araştırmacılar için bir baslangıç noktası oluşturmaktı. Geliştirilen model adenokarsinomanın benzetimini gerçekleştirmeyi amaçlamaktadır. Modelde kullanılan parametreler genellikle A549'a aittir. Simülasyonlar ile oksijen konsantrasyonunun ve mutasyon oranının etkileri incelenmiştir. Oksijen konantrasyonu düşüşü ile orantılı olarak tümördeki hücre sayısının azaldığı ve apoptoz oranının arttığı gözlemlenmiştir. Mutasyon oranı düşürüldüğünde ise, tümör zayıflamakta ve apoptoz oranı artmaktadır. Bütün bu sonuçlar geliştirilen tümör modelinin tümör biyolojisinin kuralları ile uyumlu biçimde çalıştığını göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Cancer's complex behavior decreases success rates of the cancer therapies. The usual steps cancer therapy are, deciding phase of the cancer and planing the therapy according to medical guidelines and there is no room or chance for personalized medicine. Simulation systems that use patient specific data as input and up-to-date scientific evidence as business rules has chance to help clinicians for evidence based personalized medicine practice.In this study our aim is creating a basic model to guide researchers who are eager to start tumor modeling. Developed model tries to simulate adenocarcinoma which is a subtype of non-small cell lung carcinoma. Parameters of model gathered from literature is based on A549. In simulations effects of oxygen concentration and mutation rate are examined. Tumor cell number decreases and apoptosis frequency increases proportionally with oxygen concentration's decrease. When mutation rate decreases tumors become more vulnerable and apoptosis rate increases. All these results proves that model is consistent with tumor biology rules.
Benzer Tezler
- Modeling and characterization of fluid, macromolecule, and nanoparticle transport in fibrous collagen hydrogels
Lifli kolajen hidrojellerde sıvı, makromolekül ve nanoparçacık taşınmasının modellenmesi ve karakterizasyonu
ALİ AYKUT AKALIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Makine MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALTUĞ ÖZÇELİKKALE
- Multi-scale analysis and prediction of protein-protein interactions
Protein-protein etkileşimlerinin çoklu ölçekte analizi ve tahmini
NURCAN TUNÇBAĞ
Doktora
İngilizce
2010
BiyolojiKoç ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM KESKİN
PROF. DR. ATTİLA GÜRSOY
- Derin öğrenme yöntemi ile diferansiyel mahremiyetli medikal görüntü sınıflandırma
Differential privacy medical image classification with deep learning method
ŞÜKRİYE AKKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolGazi ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞEREF SAĞIROĞLU
- Glutaminoliz ve glikolizin inhibisyonlarının meme kanseri hücre modelinde antikanser etkilerinin araştırılması
Investigation of anticancer effects of inhibitions of glutaminolysis and glycolysis in A breast cancer cell model
ZEYNEP ÖZİLERİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CUMHUR GÜNDÜZ
DR. ÖĞR. ÜYESİ BESRA ÖZMEN YELKEN
- Comparison of open source tumor growth simulation software and multiscale tumor modelling
Açık kaynaklı tümör büyüme simulasyonlarının kıyaslanması ve çok katmanlı tümör modellemesi
AHMET FIRAT ÇAKMAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiBiyomedikal Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALBERT GÜVENİŞ
YRD. DOÇ. DR. DANIELA DR SCHULZ
YRD. DOÇ. DR. MEHMET KOCATÜRK