Bakteriyorodopsin üretme potansiyeline sahip halofilik arke Halobacterium salinarum'un izolasyonu ve nanobiyomolekül olarak kullanılabilecek bakteriyorodopsin'in saflaştırılması ve karakterizasyonu
Isolation of br producing halofilic archeae Halobacterium salinarum of bacteriorhodopsin that can be used as nanobioengine
- Tez No: 380482
- Danışmanlar: PROF. DR. MEDİNE GÜLLÜCE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 82
Özet
Halobacterium salinarum doğada yüksek tuz yoğunluğunun olduğu ekstrem şartlarda yaşayan halofilik arkelerin bir üyesidir. Normal şartlarda aerobik olan bu canlı oksidatif şartlar bittiğinde, anaerobik olarak yaşam sürer. Bu noktada Bakteriyorodopsin (BR) H. salinarum tarafından gereken enerjiyi sağlamak için sentezlenir. BR yapısında 7 alfa sarmalı içinde düzenlenmiş 248 aminoasiti olan, G sarmalına protonlu Schiff bazıyla bağlı lys216 bulunan bir proton pompasıdır. Işık enerjisini sensör rodopsinler yardımıyla kimyasal enerjiye dönüştürür. Çalışmamızda BR'nin izolasyonu ve karakterizasyonu amacıyla; Konya, Tuz Gölü'nden alınan, N olarak adlandırılan örneklerin katı ve sıvı besiyerlerine ekimleri yapılmış, 37°C, 150 rpm'de, 40 W aydınlatma altında, çalkamalı olarak 9-15 gün inkübasyona bırakılmıştır. Pembe-kırmızı renkte halofilik arke gelişimi gözlemlenen N1 ve N2 sıvı kültürlerinden sulu iki fazlı sistem ve CHAPS kullanılarak BR izolasyonu ve saflaştırılması gerçekleştirilmiştir. BR'nin moleküler ağırlığı SDS-Page analizi ile absorbans spektrumu UV-visible spektrofotometre ile yüzey ve boyut analizi AFM (atomic force microscopy) ile belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Halobacterium salinarum is a member of Halophilic archaeaes that lives under extreme conditions, especially high-salt density. This normal aerobic microorganism, might convert themselves into anaerobic, when oxydative sources come to an end, or highly decreased. At this point Bacteriorhodopsin (BR) synthesized by H.salinarum to provide the energy for living. BR is a proton pump that has 248 amino acides arranged in 7 alfa helices protonated Schiff base linked lys216 to G helix in its structure, and works with energy of light within the cooperation with SR (sensor rhodopsins). We have studied to isolate and delipidate the BR protein from the samples taken from Tuz Gölü, Konya, and labeled as N with numbers. The samples at 37 °C, 150 rpm shaking was allowed to 9-15 days of incubation under 40 W illumination. We observed growing at N1,N2 samples with their pink-red color. By using aqueous two phase system (ATPS), CHAPS delipidation process, those purified and isolated the BR. Molecular weight of BR identified by SDS-Page method. The absorbance spectrum observed by using UV-Visible. And at last; surface and size analysis performed with Atomic Force Microscopy (AFM).
Benzer Tezler
- Hydrogen gas production by halobacterium halobium coupled to escherichia coli in a photobioreactor
Halobacterium halobium ve escherichia coli içeren fotobiyoreaktörde hidrojen gaz üretimi
BANU KAYA
- Photoelectrochemical hydrogen production by using bacteriorhodopsin immobilized in polyacrylamide gel
Poliakrilamit jele tutuklanan bakteriorhodopsin kullanarak foto elektro kimyasal yöntemle hidrojen gazı üretimi
EL-BASTİHİ TAREK
Yüksek Lisans
İngilizce
1998
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL YÜCEL
- Studies on the long term memory of bacteriorhodopsin
Bakteriyorodopsin'in uzun vadeli hafızası üzerine araştırmalar
BEKLAN GÜRKAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1997
Bilim ve TeknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEMİ TÜRKER
- Bakteriyorodopsin üretimi, saflaştırılması ve biyo optoelektronik cihazlarda kullanım potansiyelinin araştırılması
Investigation of the production, purification and application potential of bacteriorhodopsin for bio optoelectronic device
KÜBRA ERKAN TÜRKMEN
- Biochemical and genetic characterization of Halobacterium salinarium strain isolated from Tuz Lake in Central Anatolia
Tuz Gölünden izole edilmiş Halobacterium salinarium suşunun biyokimyasal ve genetik karakterizasyonu
ÖZGÜR ÇAKICI
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL YÜCEL
YRD. DOÇ. DR. FÜSUN İNCİ EYİDOĞAN
