Geri Dön

İdrar ve gaita örneklerinden izole edilen Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarının biyotiplendirilmesi ve bazı antibiyotiklere duyarlılıklarının araştırılması

Biotyping and antimicrobial susceptibilities of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolated from urine and stool samples

PDF İndir

  1. Tez No: 385249
  2. Yazar: GÜLŞAH TOLLU
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. İSMAİL HAKKI EKİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 71

Özet

Bu araştırmada, Van Bölge Eğitim ve Araştırma Hastanesinin mikrobiyoloji laboratuvarına analiz için getirilen idrar ve gaita örneklerinde Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarının varlığı, yaygınlığı, biyotiplendirilmesi ve bazı antibiyotiklere duyarlılıklarının araştırılması amaçlandı. Çalışmada, hastaların izni ve onayı ile alınan rutin 177 idrar örneğinden 119 (%67.2) adet, 90 gaita örneğinden de 68 (%75.5) adet olmak üzere toplam 187 adet Enterococcus spp. izole edildi. İzolatların multipleks PCR tekniği ile tür spesifik primerler kullanılarak yapılan identifikasyonlarında idrar orijinli enterokok suşlarının 30 (%25.2)'u ve gaita orijinli izolatların da 10 (%14.7)'u E. faecalis olarak identifiye edilirken; idrar orijinli enterokokların 8 (%6.7)'i ve gaita orijinli izolatların 32 (%47)'si de E. faecium olarak belirlendi. Araştırmada, 13 biyokimyasal test baz alınarak yapılan biyotiplendirmede E. faecalis suşlarında tespit edilen profillerden suşların %72.5'i biyotip I, %12.5'i biyotip II ve %15'i de biyotip III olarak belirlenirken, E. faecium suşlarının %10'u biyotip I, %12.5'i biyotip II, %27.5'i biyotip III ve %50'si ise biyotip IV olarak tespit edildi. Yapılan antibiyogram testinde, incelenen E. faecalis suşlarının tamamı penisillin G ve imipeneme duyarlı bulunurken, suşların %95'i klindamisine, %77.5'i tetrasiklin ve trimethoprim / sulfametoksazole, %42.5'i eritromisine, %30'u gentamisine ve %17.5'i de siprofloksasine dirençli bulundu. İncelenen E. faecium suşlarının %37.5'i klindamisine, %32.5'i penisilin G'ye, %27.5'i eritromisin ve imipeneme, %20'si siprofloksasine, %17.5'i tetrasiklin ve trimethoprim / sulfametoksazole, %15'i gentamisine ve %5'i de vankomisine dirençli bulundu. Araştırmada PCR tekniği ile identifiye edilen E. faecalis ve E. faecium suşlarında yapılan biyotiplendirme sonucuna göre enterokok türlerinin biyokimyasal testler ile identifikasyonlarında olası farklı biyotiplerin dikkate alınması gerektiği, antibiyotik duyarlılık test sonuçlarının ise epidemiyolojik ve klinik yaklaşımlara önemli katkılar sağlayacağı kanaatine varıldı.

Özet (Çeviri)

The aim of this study was to determine the prevalence, biotyping and in vitro antimicrobial susceptibility of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains isolated from a total of 267 routine urine and stool samples which were brought to the microbiology laboratory of Regional Training and Research Hospital of Van, with permission of the patients. In presented study, 119 (67.2%) Enterococcus spp. were isolated from 177 urine and 68 (75.5%) from 90 stool samples. The isolates were identified by multiplex PCR by using species-specific primers for E. faecalis and E. faecium. Out of 187 isolates, 30 (25.2%) and 10 (14.7%) were identified to be E. faecalis from urine and stool respectively, whereas 8 (6.7%) of stool and 32 (47%) of urine isolates were identified as E. faecium. Biotyping based on 13 biochemical tests showed that 72.5%, 12.5% and 15% of E. faecalis strains included biotype I, II and III respectively, whereas E. faecium strains could be divided as biotype I (10%), biotype II (12.5%), biotype III (27.5%) and biotype IV (50%). Additionally, all E. faecalis strains were found to be susceptible to penicillin G and imipenem. On the other hand, 95% of E. faecalis strains were found to be resistant to clindamycin, 77.5% to tetracycline and trimethoprim / sulfamethoxazole, 42.5% to erythromycin, 30% to gentamicin and 17.5% to ciprofloxacin. Out of E. faecium strains, 37.5% were found to be resistant to clindamycin, 32.5% to penicillin G, 27.5% to erythromycin and imipenem, 20% to ciprofloxacin, 17.5% to tetracycline and trimethoprim / sulfamethoxazole, 15% to gentamicin and 5% to vancomycin. In conclusion, identification of E. faecalis and E. faecium strains by PCR is reliable and faster than those of biochemical tests. It should also be taken in account that the possible different biotypes can be found within Enterococcus spp. by biochemical tests, which may be important for the epidemiological investigations. Additionally, the results of antimicrobial susceptibility test may provide important contributions to clinical approach.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    460340

    İdrar ve gaita örneklerinden izole edilen enterococcus faecalis ve enterococcus faecium suşlarının ısı şok proteinlerinin SDS-PAGE yöntemi ile analizi

    Sds-page analysis of heat shock proteins of enterococcus faecalis and enterococcus faecium isolates from urine and feces samples

    SEVİL ATEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSMAİL HAKKI EKİN

  2. Tez No

    70953

    Klinik materyallerden üretilen enterokokların tiplendirilmesi ve çeşitli antimikrobiklere karşı dirençleri

    Başlık çevirisi yok

    ASUMAN GÜZELANT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. E. İNCİ TUNCER

  3. Tez No

    124080

    Sağlıklı bireylerden ve kandidiazisli hastalardan izole edilen candida albicans suşlarının proteinaz enzim aktivitesinin araştırılması

    Research on proteinase enzyme activity of candida albicans isolated from healty individuals and patients with candidosis

    ÖZLEM GÜLCAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. SULHİYE YILDIZ

  4. Tez No

    422145

    Klinik örneklerden izole edilen mantarlara karşı bazı doğal ürünlerin antifungal etkileri

    Antifungal effects of some natural products against yeasts isolated from clinical samples

    MEHMET DORUM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiNevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞAHLAN ÖZTÜRK

  5. Tez No

    339548

    Antimikrobiyallerin subinhibitör konsantrasyonlarının Pseudomonas aeruginosa virülansı üzerine etkilerinin moleküler düzeyde incelenmesi

    Molecular analysis of the effect of antimicrobial subinhibitory concentrations on Pseudomonas aeruginosa virulence

    BERNA ERDAL YILDIRIM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE MELTEM YALINAY ÇIRAK

Geri Dön