Geri Dön

Şalgam suyundan izole edilen laktik asit bakterilerinin 16S rRNA ile tanımlanması ve bazı gelişme parametrelerinin belirlenmesi

Identification of lactic acid bacteria isolated from turnip juice with 16S rRNA and determination of some of the growth parameters

PDF İndir

  1. Tez No: 386320
  2. Yazar: NURHAN SAMANTIR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KAMURAN AYHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 97

Özet

Tezde, şalgam suyundan izole edilen ve fenolik dekarboksilaz enzimine sahip olduğu saptanan 6 adet izolat (GK1, GK3, GK5, GK11, GK12, GK13) 16S rRNA gen bölgesi dizi analizi ile moleküler olarak tanımlanmıştır. Suşların farklı NaCl konsantrasyonlarındaki, farklı pH ve sıcaklıklardaki gelişmeleri incelenmiş ve optimum koşullardaki gelişme eğrileri saptanmış olup, herbirinin antimikrobiyel aktivite özellikleri araştırılmıştır. API 50CHL ve 16S rRNA gen bölgesi dizi analizi ile tanımlama sonuçlarına göre GK12 ve GK13 izolatları Lactobacillus plantarum'dur. GK1 izolatı API 50CHL ile tanımlanamazken, 16S rRNA gen bölgesi dizi analizi sonucuna göre Lactobacillus plantarum olduğu saptanmıştır. GK3 izolatının API 50CHL ile Leuconostoc mesenteroides/dextranicum 2 olduğu, buna karşın 16S rRNA gen bölgesi dizi analizinde ise Lactobacillus plantarum suşu olduğu anlaşılmıştır. Denemelerde, GK5; API 50CHL testinde Leuconostoc mesenteroides/dextranicum 2, Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü'nde yapılan moleküler tanımlama sonucunda Pediococcus acidilactici, ODTÜ Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Ar-Ge Merkezi'nde yapılan moleküler testinde ise Pediococcus pentosaceus olarak tanımlanmıştır. GK11, API 50CHL ve Biyoteknoloji Enstitüsü'nde tanımlanamazken ODTÜ'de yapılan testte, izolatın Lactobacillus plantarum olduğu sonucuna varılmıştır. Bu çalışmada moleküler tanımlama sonuçlarına göre; GK1, GK3, GK12 ve GK13 suşlarının birbiri ile tür bazında benzer olduğu anlaşılmıştır. GK12 ve GK13 30 ˚C' de, diğerleri ise 37,5˚C'de optimum gelişme göstermiştir. Suşların 2; 3; 3,5; 4; 5 pH'lardaki gelişmeleri incelendiğinde, aralarında benzerlik olduğu, pH yükseldikçe gelişmenin arttığı anlaşılmıştır. Hepsinde maksimum gelişme pH 5'de görülmüştür. Suşların, %1; 1,5; 2; 2,5 NaCl konsantrasyonlarındaki gelişmeleri farklılık göstermiştir. L. monocytogenes ATCC 7644, S. aureus ATCC 10832 ve Lb. plantarum ATCC 14917'e karşı suşların antimikrobiyel aktivite göstermediği anlaşılmıştır.

Özet (Çeviri)

In this thesis, 6 isolates (GK1, GK3, GK5, GK11, GK12, GK13) isolated from turnip juice and determined to have phenolic dicarboxylate were identified by 16S rRNA gene sequencing. Growth of the strains in different NaCl concentrations, pH and temperature values were researched and growth curves in optimum conditions were determined, antimicrobial activities of each strain were also investigated. According to the identification by API 50CHL and 16S rRNA gene sequencing analysis, GK12 and GK13 isolates are Lactobacillus plantarum. GK1 isolate was found to be Lactobacillus plantarum by 16S rRNA gene sequencing. analysis whereas it could not be identified by API 50 CHL. GK3 isolate was concluded to be Leuconostoc mesenteroides/dextranicum 2 by API 50CHL while it was identified as Lactobacillus plantarum by 16S rRNA gene sequencing analysis. GK5 was identified as Leuconostoc mesenteroides/dextranicum 2 by API 50CHL test, Pediococcus acidilactici by molecular identification performed in Ankara University Biotechnology Institute and Pediococcus pentosaceus by molecular test carried out in METU Molecular Biology and Biotechnology R&D Center. GK11 could not be identified by API 50 CHL and by tests in Biotechnology Institute whereas it was found to be Lactobacillus plantarum in METU. According to the molecular identification results in this study GK1, GK3, GK12 and GK13 strains are proved to be similar at species level. Optimum growth was observed at 30 ˚C for GK12 and GK13, and at 37 ˚C for the other isolates. When the growth of strains at 2; 3; 3,5; 4; 5 pH values are researched, it was seen that all strains resemble each other; growth increases with pH. Maximum growth was observed at pH 5 for all of them. The growth of strains in 1; 1,5; 2; 2,5 % NaCl concentrations differentiated. Strains did not show any antimicrobial activity against L. monocytogenes ATCC 7644, S. aureus ATCC 10832 and Lb. plantarum ATCC 14917.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    307709

    Şalgam suyundan izole edilen bazı laktik asit bakterilerinin moleküler karakterizasyonu ve bunların starter kültür olarak kullanılma potansiyellerinin belirlenmesi

    Molecular characterization of lactic acid bacteria isolated from shalgam and determinaiton of their potential using as a starter culture

    SEZGİ BİRCAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Gıda MühendisliğiÇukurova Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Bölümü

    PROF. DR. HÜSEYİN ERTEN

  2. Tez No

    299843

    Geleneksel olarak üretilen şalgam suyundan laktik asit bakterilerinin izolasyonu, tanımlanması ve fenolik asit dekarboksilaz enzim üreten suşların seçimi

    Identification of lactic acid bacteria isolated from traditionally produced şalgam juice and the selection of the strains producing the phenolic acid decarboxylase enzymes

    GÖZDE OKCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Gıda MühendisliğiAnkara Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAMURAN AYHAN

  3. Tez No

    213623

    Şalgam suyundaki candida inconspicua'nın sıcaklık ve sonikasyonla inaktivasyonu

    Inactivation of candida inconspicua in the turnip juice by heat and sonication

    SEYRA AVCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Gıda MühendisliğiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Bölümü

    PROF. DR. NAFİ ÇOKSÖYLER

  4. Tez No

    725415

    Şalgam suyunda bulunan mayaların izolasyonu, moleküler tanısı ve starter kültür olarak kullanım olanaklarının araştırılması

    Identification and technological characterization of endogenous yeast isolated from fermented black carrot juice, shalgam

    HALİL İBRAHİM KAHVE

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Gıda MühendisliğiSelçuk Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET AKBULUT

  5. Tez No

    695354

    Şalgam suyu üretiminde optimum șalgam turpu (brassica rapa) konsantrasyonun belirlenmesi

    Determination of the optimal concentration of turnip radish (brassica rapa) in the production of shalgam

    ZELİHA AYÇA VAROL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Gıda MühendisliğiNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HASAN TANGÜLER

Geri Dön