Geri Dön

Eritropoetin'in SHSY-5Y hücrelerinde sinyalleme mekanizmasının proteomik yöntemi ile incelenmesi

The investigation of the effect of erythropoietin on the signaling mechanism of SHSY-5Y cell line by proteomic method

  1. Tez No: 386502
  2. Yazar: ZÜBEYDE ERBAYRAKTAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ŞERMİN GENÇ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Nöroloji, Neurology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 75

Özet

Eritropoetin (EPO), eritropoezi uyaran hematopoetik büyüme faktörü ve sitokindir. Son 20 yılda EPO'nun hematopoetik etkileri dışında farklı organ ve sistemler üzerine etkileri olduğu ortaya konmuştur. Örneğin beyindeki nöronal ve glial hücrelerde kendisinin ve reseptörünün varlığı ortaya konmuş, sinir sisteminin gelişiminde, nöronal canlılığın devamında nöronal hasarın tamirinde kritik roller üstlendiği gösterilmiştir. EPO'nun nöroprotektif etkisinin olası bir mekanizması hücre içi pek çok proteinin ekspresyonunu etkilemesidir. Bu çalışmanın amacı, EPO'nun SHSY-5Y nöroblastoma hücre hattında protein ekspresyonuna etkisinin incelenmesidir. Bu sayede EPO'nun etkilediği hücre içi yolakların bulunmasıdır. Projemizde proteomik yaklaşım ile EPO'in protein düzeyinde yaptığı degişiklikler incelenmiştir. Bu amaçla nöronal bir hücre hattı olan SHSY-5Y hücre hattına EPO indüksiyonu uygulanıp bunun sonucunda ekspresyonu değişen proteinler 2D jel elektroforez ile ayrımlamış, ardından ekspresyon farkı bulunan proteinlerin analizi kütle spektroskopi yöntemi ile yapılmıştır. Araştırmanın sonuçlarına göre toplam 74 proteinin ekspresyonu EPO uygulaması ile değiştiği saptanmıştır. Ekspresyon değişimi 40 protein ekspresyonunda artış, 34 protein için azalma şeklindedir. Ekspresyon değişimi gösteren proteinlerin 35'i sadece 24 saat EPO uygulaması ile değişim gösterirken, 17'si sadece 48 saat EPO uygulaması ile ekspresyon değişimi göstermiştir. 22 proteinin ekspresyonu ise hem 24 saat hem 48 saat EPO uygulaması ile değişim göstermiştir. Ekspresyon değişimi gösteren proteinler için“reactome programı”kullanılarak yolak analizi yapılmıştır. Bu analiz sonrası EPO'nun hücre metabolizmasını, protein metabolizmasını, gen ekspresyonunu, RNA metabolizmasını ve mRNA işlenmesi ile ilgili yolakları etkilediği gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

Erythropoietin (EPO) is a hematopoietic growth factor and cytokine which stimulates erythropoiesis. In recent 20 years it's been shown that EPO affects other systems. For instance, its receptor is expressed in the brain, neurons and the glial cells. EPO has a critical role in the development, maintenance, protection and repairment of the nervous system. A possible mechanism of EPO is alternation of protein expression. In this study, our aim is to investigate effect of EPO on protein expression in SHSY-5Y neuroblastoma cell line for finding intracellular pathways affected by EPO. For this purpose neuronal cell line SHSY-5Y has been induced by EPO and protein expression changes has been detected by 2D Gel electrophoresis and mass spectroscopy. According to results, EPO alters 74 protein expression (40 were increased, 34 were decreased). The levels of 35 proteins were changed by 24 EPO incubation, whereas 17 protein expressions were altered by 48 hours EPO incubation. Twenty two protein expressions were altered by both of incubation periods (24 and 48 hours). Altered proteins pathways analysed with“reactome software”. This analysis showed that EPO affects metabolism, protein metabolism, gene expression, RNA metabolism and mRNA processing pathways.

Benzer Tezler

  1. Eritropoetin'in SHSY-5Y hücrelerinde genomik düzeyde gen espresyonuna etkisinin incelenmesi

    The effect of erythropoietin on MRMA level in shsy-5y cell line by microarray

    ZEYNEP FİLİZ ÖNKAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    GenetikDokuz Eylül Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞERMİN GENÇ

  2. Eritropoetinin SHSY5Y hücre hattında mikroRNA ekspresyonu üzerine etkisi

    Effect of erythropoietin on the microRNA expression levels of SH-SY5Y cell line

    DOĞAN TUNALI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Moleküler TıpDokuz Eylül Üniversitesi

    Temel Nörolojik Bilimler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞERMİN GENÇ

  3. Hipoksik ve normoksik koşullarda nöron hücrelerinde Darbepoetin alfa'nın TRMP2 kanalı ve mitokondriyal disfonksiyon üzerine etkileri

    Effects of Darbepoetin alpha on TRPM2 channel and mythocondrial dysfunction in neuron cells under hypocoxic and normoxic conditions

    GÖKHAN AĞTÜRK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Fizyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAKKI OKTAY SEYMEN

  4. Eritropoetin'in kırık iyileşmesi üzerine etkileri (deneysel çalışma)

    Başlık çevirisi yok

    ERDİNÇ TÜRKELİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Ortopedi ve TravmatolojiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Ortopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. ALİ DOĞAN

  5. Deneysel septik şok modeli oluşturulan ratlarda eritropoetin

    Effect of erythropoietin in experimental septik shock model in rats

    SERDAR ÖTER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Genel CerrahiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADNAN ŞAHİN