Geri Dön

Identification of complexes that interact with tRNA-derived small RNAs by gene expression methods.

tRNA kökenli küçük RNA'larla etkileşen komplekslerin gen ekspresyonu yöntemleriyle belirlenmesi.

  1. Tez No: 387156
  2. Yazar: SANİYE ELVAN ÖZTÜRK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 36

Özet

tRNA, hayatın yaşamsal bir molekülü ve bir süredir biyokimyasal araştırmaların hedefi olmuştur. Son zamanlarda tRNA biyolojisinin yeni yönleri açığa çıkarılmaktadır. Biriken datalar, tRNA'nın amino asit kodlamak gibi bilinen rolünün yanında farklı biyolojik fonksiyonlarda da rolleri olduğunu göstermektedir. tRNA yarıları, tRNA molekülünün antikodon bölgesinin angiogenin tarafından kesilmesiyle üretilirler ve olgun tRNA'nın 5' ve 3' uçlarından üretilen daha küçük olan RNA fragmentleri (tRFs) de protein sentezinin inhibisyonu gibi en belli başlı biyolojik fonksiyonları da göstermektedirler. Çalışmamızda, tRF'ler ve RNA'ya bağlanan proteinler arasındaki etkileşimin gösterilmesi amaçlandı. Bu sebeple, insanlardaki TIA-1 ve LA proteinlerinin Drosophila homologu olan iki proteine (Rox8 ve La) karar verildi. Çalışmanın başında bu proteinlerin FLAG-işaretli versiyonları S2 hücrelerinde aşırı-ifade edildi. Sonrasında bu işaretli proteinler sayesinde immunopresipitasyon deneylerini gerçekleştirildi. Çalışmamızın sonunda tRF'ler ve tRF'lerle ilişkili proteinler arasındaki potansiyel ilişki meydana çıkarıldı.

Özet (Çeviri)

tRNA is a vital molecule of life and has been a focus of biochemical research since long. New aspects of tRNA biology have been drawn to light recently. Accumulating data indicates that tRNA has many diverse biological functions other than its canonical role in coding for amino acids. tRNA halves are produced by cutting the tRNA molecule from its anti-codon loop by angiognenin and even smaller RNA fragments (tRFs) produced from 5' or 3' ends of mature tRNA have been shown to have biological functions, most notable of which is the inhibition of the initiation of protein synthesis. In our study, the aim was to show the interaction between tRFs and RNA binding proteins. For this reason, two proteins were determined: Rox8 and D-La which are Drosophila homologs of human TIA-1 and La. In the beginning of study, we overexpressed FLAG-tagged versions of these proteins in S2 cells. Then immunoprecipitation experiments were performed with the tagged proteins. At the end of our research the potential interaction between tRFs and tRF related proteins are demonstrated.

Benzer Tezler

  1. Investigation of tRNA-derived small RNAs in Drosophila melenogaster

    Drosophila melanogaster' de tRNA kaynaklı küçük RNA'ların araştırılması

    ÇAĞDAŞ GÖKTAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    Genetikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL

  2. Sanal tarama ve çok boyutlu moleküler modelleme yöntemleri ile p53-MDM2 potansiyel inhibitörlerinin belirlenmesi

    Identification of p53-MDM2 potential inhibitors with virtual screening and multidimensional molecular modeling methods

    GÜLŞAH AYDIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MİNE YURTSEVER

    PROF. DR. SERDAR DURDAĞI

  3. CCDC84'ün RNA kırpılması (Splicing) sürecindeki rolünün araştırılması

    Investigation of the role of CCDC84 in splicing process

    İDRİS ER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Tıbbi BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERSAN KALAY

  4. The role of CD3 delta interacting proteins in T cell receptor assembly and signaling

    CD3 delta ile etkileşimde bulunan proteinlerin T hücresi reseptörü oluşumu ve sinyallemesindeki rolü

    ŞAFAK IŞIL ÇEVİK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    BiyomühendislikSabancı Üniversitesi

    Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BATU ERMAN

  5. Synthesis, characterization, electronic structure and DNA binding abilities of platinum(II) complexes containing 2,3-di(2-thienyl)-quinoxaline ligand

    2,3-di(2-tiyenil)-kuinoksalin ligantı içeren platin(II) komplekslerininsentezi, karakterizasyonu, elektronik yapıları ve DNA'ya bağlanma kabiliyetleri

    WADAD S. S. FADEL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    KimyaAtılım Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞENİZ ÖZALP YAMAN