Functional study of common bean isoliquiritigenin 2'-O- methyltransferase gene under salt stress
Fasulye bitkisi 'isoliquiritigenin 2'-o- methyltransferase' geninin tuz stresi altında fonksiyonel analizi
- Tez No: 387427
- Danışmanlar: PROF. DR. MÜGE TÜRET
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Botanik, Biology, Biotechnology, Botany
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
Ekilebilir alanlarda tuz oranlarının artışı yıllardır tarımın gelişmesinin önündeki en büyük sorunlardan biri olmuştur. Dünyadaki tarım alanlarının yüzde 20'si tuz stresi altındadır ve bu miktarın gelecekte artması üretim miktarlarında daha fazla düşüşe neden olacaktır. Baklagiller familyasının bir üyesi olan fasulye bitkisi dünyada besinsel ve tarımsal değerleriyle öne çıkmaktadır ve tuza karşı duyarlılık göstermektedir. Bu yüzden fasulye bitkisinin tuz koşullarında verdiği tepki mekanizmalarının anlaşılması, dayanıklı çeşitlerin geliştirilmesi için bir gereklilik olmuştur. Fasulye bitkisinin tuz stresi altındaki transkriptom analizi strese dayanıklılıkta ikincil bitki metabolizmasının önemini göstermiştir. Transkriptom verisinin biyoinformatik analizi tuzlulukta etkin olan bir çok geni ortaya çıkarmıştır. Tuza dayanıklı bir fasulye çeşidi olan İspir'in transkriptomundaki tuz tarafından indüklenen genlerin in siliko analizi, bitki ikincil metabolizmasının bir parçası olan, isoliquiritigenin 2'-O-methyltransferase (ChOMT) adlı genin tuza dayanıklılık tepkilerinde önemli bir yeri olabileceğini göstermiştir. Bu genin Arabidopsis bitkisinde anlatımının arttırılması transgenik bitkilerde muhtemel olarak (i) organik çözünen miktarının artması ve kök yapısının değişmesine neden olarak ozmotik stressin etkilerini kompanse etmiş ve bitkinin suya ulaşımı kolaylaştırarak biyokütle korunumunu sağlamış ve de (ii) tohum bütünlüğünü koruyarak çimlenme oranını arttırmıştır. Sonuçlar ChOMT geninin tuza dayanıklı tahıllar geliştirilebilmek için önemli bir aday gen olabileceğini ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
Soil salinity has been one of the major problems in agriculture for many years. Nearly 20% of all cultivated land and half of irrigated land of world soil are saline and these levels are expected to rise in the future which will result in further crop yield reduction. Phaseolus vulgaris L. (common bean) is a legume crop with great value in the world with its nutritional and agricultural features, yet it is fairly susceptible to salt stress. Thus to understand the underlying mechanism of salt stress tolerance in plants become a necessity to eventually develop salt tolerant varieties. Our previous studies on transcriptome analysis of common bean under salt stress has revealed a major differential expression in transcripts of secondary metabolism which undoubtedly plays role in both biotic and abiotic stress responses. Further bioinformatics analysis on the transcriptome data has pointed out many salt responsive genes. A secondary metabolism gene, Isoliquiritigenin 2'-O-methyltransferase (ChOMT) has emerged as a prominent gene in salt-tolerance responses from the in silico analysis of salt induced transcripts in a salt-tolerant common bean variety. Overexpression of common bean ChOMT gene in Arabidopsis thaliana model enhanced salt tolerance of transgenic plants possibly by creating an impact on (i) accumulation of organic solute content and architectural change in root tissues to compensate adverse effect of osmotic stress and increase in the chance to absorb and conduct water to ensure biomass, and (ii) protection of seed integrity via increase in the viability and vigor of seeds.
Benzer Tezler
- Kısmi türevli diferansiyel denklemlerin yeni Jakobi eliptik fonksiyon çözümleri
New Jacobi elliptic function solutions of partial differential equations
NAİL TURHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MatematikBozok ÜniversitesiMatematik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YUSUF PANDIR
- Gestasyonel diyabetli kadınlarda yaşam kalitesi ve depresyon durumlarının incelenmesi
The examination of life quality and the event of depression in the period of pregnancy of diabetic women
REYHAN AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
HemşirelikHaliç ÜniversitesiHemşirelik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEZİHE KIZILKAYA BEJİ
- The verbal functional domain in the Denizli dialect of Turkish
Türkçe'nin Denizli ağzı'ndaki işlevsel eylem bölgesi
YAĞMUR SAĞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
DilbilimBoğaziçi ÜniversitesiDilbilim Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE HAMİDE ASLI GÖKSEL
- Kardiyopulmoner bypass ile açık kalp cerrahisi uygulanan hastalarda orta ve hafif hipotermik bypass yöntemlerinin neutrophıl gelatınase assocıated lıpocalın (NGAL), cystatın c ve near ınfrared spectroscopy (NIRS) yöntemi ile ölçülen renal perfüzyon üzerine etkilerinin karşılaştırılması
Comparing the effects of mild and moderate hypothermia on renal perfusion evaluated with neutrophil gelatinase associated lipocalin, cystatin c and near-infrared spectroscopy in patients undergoing cardiopulmonary bypass graft surgery
SERKAN YILDIRIM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Göğüs Kalp ve Damar CerrahisiSelçuk ÜniversitesiKalp ve Damar Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET ALKILIÇ HORASANI ÖÇ
- Serebral palsi'li çocuklarda su içi egzersizlerin spastisite ve motor fonksiyonlar üzerine etkisi
EFFECTİVENESS OF AQUATİC EXERCİSES ON SPASTİCİTY AND MOTOR FUNCTİONS OF CHİLDREN WİTH CEREBRAL PALSY
SEVDA ADAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonAfyon Kocatepe ÜniversitesiFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÜMİT DÜNDAR