Geri Dön

Nükleik aside dayalı elektrokimyasal biyosensörler ile hibridizasyon algılanmasına ait yöntemlerin geliştirilmesi ve uygulanması

Development and applications of hybridization detection methods with nucleic acide based electrochemical biosensors.

PDF İndir

  1. Tez No: 388650
  2. Yazar: SEDA NUR TOPKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET EMİN ŞENGÜN ÖZSÖZ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Kimya, Tıbbi Biyoloji, Pharmacy and Pharmacology, Chemistry, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 226

Özet

Tez çalışmasının ilk kısmında, prostat kanserinin spesifik bir belirteci olan GSTP1 geninin hibridizasyon üzerinden hipermetilasyon tayini için elektrokimyasal bir biyosensör tasarlanmıştır. Bu yeni biyosensör sistemi ile DPV kullanılarak, sentetik veya denatüre PCR örneklerinin hibridizasyonundan önce ve sonra elde edilen guanin yükseltgenme sinyal değişiklikleri değerlendirilmiştir. DNA hibridizasyonu ayrıca, EIS ile karakterize edilmiştir. Hibridizasyon protokolü iki farklı teknikten oluşmaktadır: (i) GSTP1 dizileri metilasyon spesifik bölgesi için seçici olan prob ve hedef sensör yüzeyine doğrudan immobilize edilmiş ve hibridizasyon elektrot yüzeyinde gerçekleştirilmiştir. (ii) prob/hedef veya prob/rastgele dizi çiftleri çözelti fazında karıştırılmış ve elektrot basit adsorbsiyonla modifiye edilmiştir. İkinci kısımda JAK2 geninin 1849. bazında Guanin bazının Timine değişmesi sonucunda valinin fenilalanine yerdeğiştirmesine (JAK2V617F) sebep olan tek nokta mutasyonu elektrokimyasal biyosensör ile algılanmıştır. Prob ile hedef arasındaki hibridizasyon ve sağlıklı dizilerden mutasyonlu dizilerin ayırt edilmesi DPV ile sentetik ve denatüre PCR örneklerde gerçekleştirilmiştir. Prob/hedef, prob/tek bazı hedeften farklı dizi ve prob/rastgele dizi çiftleri çözelti fazında karıştırılmış ve bu çözeltiler daha sonra elektrot yüzeyine pasif adsorbsiyon ile immobilize edilmiştir. Tek nokta mutasyonu içeren dizi ve rastgele diziler hibrit yapıdan, hibridizasyon sıcaklığı ve hibridizasyon tamponundaki tuz konsantrasyonunun ayarlanması ile ayırt edilebilmiştir.

Özet (Çeviri)

In the first part of thesis, an electrochemical biosensor for the detection of hypermethylation of the GSTP1) gene, a specific marker of prostate cancer, was reported. This new sensor was used in combination with DPV, with the results of sample analysis based on the guanine oxidation signals obtained at +1.0 V before and after hybridization between probe and synthetic target or denatured PCR samples. The detected DNA hybridization was also characterized by EIS. The protocol consisted of two different modes: (i) Capture probes selective for methylation-specific and unmethylated GSTP1 sequences were immobilized onto the sensor directly, and hybridization was formed on the electrode surface. (ii) Probe/target or probe/noncomplementary target couples were mixed in solution phase, and the transducer was modified through simple adsorption. In the second part, an electrochemical biosensor for the detection of a guanine (G) to thymine (T) transversion at nucleotide position 1849 of the JAK2 gene was reported. Hybridization between probe and its complementary oligonucleotide (target) and discrimination of single point mutation was investigated by monitoring guanine oxidation signals observed at +1.0 V with Differential Pulse Voltammetry (DPV) by using synthetic oligonucleotides and PCR amplicons. Probe/complementary, probe/mismatch and probe/non-complementary target couples were mixed in solution phase, and the electrode surface was modified by simple adsorption. The sensitivity of the proposed electrochemical DNA biosensor was optimized with respect to hybridization temperature and salt concentration in the hybridization buffer.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    54847

    Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR)'nun Plasmodium ve Leishmania modellerinde uygulanması üzerine deneysel araştırmalar

    Başlık çevirisi yok

    METİN ATAMBAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Parazitoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. M. ZİYA ALKAN

  2. Tez No

    327239

    Karbon nanotüp-nükleik asit konjugatlarının hazırlanması, gen aktarımında kullanım potansiyellerinin incelenmesi

    Preparation of carbon nanotube-nucleic acid conjugates, investigation its potential in gen delivery

    CANER GEYİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyokimyaEge Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AZMİ TELEFONCU

  3. Tez No

    908448

    Characterization of extracellular vesicles derived from bacteria, yeast, and fungi species based on TEM, SEM, NTA, and FAME analysis

    TEM, SEM, NTA ve FAME analizine dayalı bakteri, maya ve fungus türlerinden ızole edilen hücre dışı veziküllerin karakterizasyonu

    RÜMEYSA NUR AFŞAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyoteknolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN

  4. Tez No

    59179

    Hapatit E virüsü yapısal proteinlerinin (ORF2, ORF3) ekspresyonu, karakterizasyonu, klinik tanı ve aşı çalışmalarında kullanımı

    The Expression characterization and clinical aplications hepatitis E virus structural proteins (ORF2, ORF3)

    M. HAKAN ÖZDENER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    BiyokimyaOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEMİL ÇELİK

  5. Tez No

    352438

    A study on the localization of alternative MEFV transcripts in neutrophil-like cells

    MEFV alternatif transkriptlerinin nötrofil benzeri hücrelerde lokalizasyon çalışması

    ŞULE ERDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EDA TAHİR TURANLI

Geri Dön