Generation of novel random mutagenesis lipase libraries via directed evolution
Yönlendirilmis¸ evrim metodu ile yeni, rastgele mutasyona uğratılmış lipaz kütüphanelerinin oluşturulması
- Tez No: 389518
- Danışmanlar: PROF. DR. OSMAN UĞUR SEZERMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Bioengineering, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Lipazlar (triasilgliserol asilhidrolaz EC 3.1.1.3), biyoteknolojik uygulamalarda etkili rol oynayan biyokatalizörlerdir. Mekanizmaları, seçicilikleri ve yapıları bilindiği için, protein mühendisliği ve yönlendirilmiş evrim metodlarına uygun adaylardır. DNA karma metodu, yönlendirilmiş evrim ve rastgele mutajenez tekniklerinin bir arada kullanılabilmesi, istenilen özelliklere sahip mutant lipaz kütüphanelerinin oluşturulabilmesine imkan tanımıştır. Bu durum, lipazlarin aynı zamanda biyosensör, ilaç, tarım endüstrilerinde kullanılmasına olanak sağlamıştır. Lipazların ticari kullanımına karşı artan talep sonucu yeni ve hedefe özgün lipazların tanımlanması ve izole edilmesi kritik önem taşımaktadır. Bu tez, yönlendirilmiş evrim tekniğiyle mutant lipaz kütüphanelerinin oluşturulmasını hedef almakla beraber, aday biyokatalizörlerin analizini yapmayı amaçlamaktadır. Bunun için, fungal ve mezofilik bir lipaz olan Aspergillus niger lipazı (ANL) ile bakteriyel ve termofilik bir lipaz olan Bacillus thermocatenulatus lipazı (BTL) DNA karma metodu ile karıştırılmıştır. Rastgele mutajene olacak olan enzimlerin, termostabilite, pH stabilite ve substrat seçiciliğinde artı göstermesi ve endüstriyel ve biyokteknolojik uygulamalarda önemli bir lipaz olması öngörülmektedir. Elde edilen klonlarda, substrat seçiciliği değişikliği görülmemekle beraber, enzimlerin genel aktivitelerinde belirli değişiklikler saptanmış, ve bu özellikler yapısal boyutta tartışılmıştır.
Özet (Çeviri)
Lipases (triacylglycerol acylhydrolases, EC 3.1.1.3) function as significant biocatalysts in biotechnological applications. The fact that their mechanism, selectivity and structure is well known make lipases a suitable candidate for studies of protein engineering and directed evolution. Using the merits of DNA shuffling method, directed evolution and random mutagenesis,libraries of mutant lipases are constructed with improved features and functionality of pre-existing ones, which in turn encourages the use of industrial lipases in applications such as biosensors, pharmaceuticals, agrochemicals, bioremediation, etc. With increasing demand on lipase production for commercial use, it has thus become crucial to identify and isolate novel and target-specific lipases, as well as optimizing existing ones for acquisition of desired functionality. The aim of this study is to generate mutant lipase libraries using directed evolution and to screen for a candidate biocatalyst. There are two lipases of interest, the mesophilic Aspergillus niger lipase (ANL) and the thermophilic Bacillus thermocatenulatus lipase (BTL), which were shuffled in order to obtain a mutant library that would have the desired features such as increased thermostability, pH stability and a broader range of substrate specificity.
Benzer Tezler
- Realization of transmitter and receiver clock generation units and channel switching unit in a modified analog radio relay
Değiştirilen bir analog radyodaki verici ve alıcı saat üretimi birimleri ve kanal anahtarlama biriminin gerçekleştirilmesi
AYHAN BÜYÜKSEMERCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT AŞKAR
- New algorithms and techniques for microprocessor-controlled PWM induction drives
Başlık çevirisi yok
OSMAN KÜKRER
Doktora
İngilizce
1987
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. H. BÜLENT ERTAN
- Barajların hacim-verim ilişkisi üzerine bir araştırma
Başlık çevirisi yok
MEHMET KILIÇARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
İnşaat MühendisliğiÇukurova Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TEFARUK HAKTANIR
- Buğday mutant populasyonlarında çeşitli tarımsal özellikler arasındaki ilişkiler
Başlık çevirisi yok
M. İLHAN ÇAĞIRGAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
ZiraatEge ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN B. YILDIRIM
- Akaryakıtla çalışan endüstriyel tav fırınlarında yanma, sıcaklık ve basıncın optimum kontrolu
Optimum control of combustion temperature and pressure in industrial tempering furnaces working with fuel-oil
MEHMET EROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Makine MühendisliğiGazi ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YÜCEL ERCAN