Generation of novel random mutagenesis lipase libraries via directed evolution
Yönlendirilmis¸ evrim metodu ile yeni, rastgele mutasyona uğratılmış lipaz kütüphanelerinin oluşturulması
- Tez No: 389518
- Danışmanlar: PROF. DR. OSMAN UĞUR SEZERMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Bioengineering, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 122
Özet
Lipazlar (triasilgliserol asilhidrolaz EC 3.1.1.3), biyoteknolojik uygulamalarda etkili rol oynayan biyokatalizörlerdir. Mekanizmaları, seçicilikleri ve yapıları bilindiği için, protein mühendisliği ve yönlendirilmiş evrim metodlarına uygun adaylardır. DNA karma metodu, yönlendirilmiş evrim ve rastgele mutajenez tekniklerinin bir arada kullanılabilmesi, istenilen özelliklere sahip mutant lipaz kütüphanelerinin oluşturulabilmesine imkan tanımıştır. Bu durum, lipazlarin aynı zamanda biyosensör, ilaç, tarım endüstrilerinde kullanılmasına olanak sağlamıştır. Lipazların ticari kullanımına karşı artan talep sonucu yeni ve hedefe özgün lipazların tanımlanması ve izole edilmesi kritik önem taşımaktadır. Bu tez, yönlendirilmiş evrim tekniğiyle mutant lipaz kütüphanelerinin oluşturulmasını hedef almakla beraber, aday biyokatalizörlerin analizini yapmayı amaçlamaktadır. Bunun için, fungal ve mezofilik bir lipaz olan Aspergillus niger lipazı (ANL) ile bakteriyel ve termofilik bir lipaz olan Bacillus thermocatenulatus lipazı (BTL) DNA karma metodu ile karıştırılmıştır. Rastgele mutajene olacak olan enzimlerin, termostabilite, pH stabilite ve substrat seçiciliğinde artı göstermesi ve endüstriyel ve biyokteknolojik uygulamalarda önemli bir lipaz olması öngörülmektedir. Elde edilen klonlarda, substrat seçiciliği değişikliği görülmemekle beraber, enzimlerin genel aktivitelerinde belirli değişiklikler saptanmış, ve bu özellikler yapısal boyutta tartışılmıştır.
Özet (Çeviri)
Lipases (triacylglycerol acylhydrolases, EC 3.1.1.3) function as significant biocatalysts in biotechnological applications. The fact that their mechanism, selectivity and structure is well known make lipases a suitable candidate for studies of protein engineering and directed evolution. Using the merits of DNA shuffling method, directed evolution and random mutagenesis,libraries of mutant lipases are constructed with improved features and functionality of pre-existing ones, which in turn encourages the use of industrial lipases in applications such as biosensors, pharmaceuticals, agrochemicals, bioremediation, etc. With increasing demand on lipase production for commercial use, it has thus become crucial to identify and isolate novel and target-specific lipases, as well as optimizing existing ones for acquisition of desired functionality. The aim of this study is to generate mutant lipase libraries using directed evolution and to screen for a candidate biocatalyst. There are two lipases of interest, the mesophilic Aspergillus niger lipase (ANL) and the thermophilic Bacillus thermocatenulatus lipase (BTL), which were shuffled in order to obtain a mutant library that would have the desired features such as increased thermostability, pH stability and a broader range of substrate specificity.
Benzer Tezler
- Structure function relationship of plant ADP-glucose pyrophosphorylase
Bitki ADP-glikoz pirofosforilaz enziminin yapı işlev ilişkisi
AYŞE BENGİSU SEFEROĞLU
Doktora
İngilizce
2014
BiyokimyaKoç ÜniversitesiKimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM HALİL KAVAKLI
- Development of novel anticounterfeiting technologies using heavy metal free nanoparticles
Sahteciliğe karşı ağır metal içermeyen nanotanecikler kullanarak yeni teknolojilerin geliştirilmesi
DİDEM TAŞCIOĞLU
Doktora
İngilizce
2021
Mühendislik Bilimleriİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERDAR ÖZÇELİK
PROF. DR. MUSTAFA MUAMMER DEMİR
- Aksolotl kol rejenerasyonu alanında mikrobiyota ve transkriptom verisinin madenciliği vasıtasıyla yeni aday biyobelirteçlerin keşfi
Discovery of novel candidate biomarkers in the field of axolotl limb regeneration through mining of axolotl microbiota and transcriptome data
MUHAMMED MUSTAFA ÖGDÜR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Biyoistatistikİstanbul Medipol ÜniversitesiSağlık Sistemleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ KIVANÇ KÖK
- Development and application of novel machine learning approaches for RNA-seq data classification
RNA dizileme verilerinin siniflandirilmasinda yeni makine öğrenimi yaklaşimlarinin geliştirilmesi ve uygulanmasi
GÖKMEN ZARARSIZ
Doktora
İngilizce
2015
BiyoistatistikHacettepe ÜniversitesiBiyoistatistik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERDEM KARABULUT
DOÇ. DR. AHMET ÖZTÜRK
- FPGA tababanlı, PCI ara yüzlü, gerçek zamanlı rasgele sayı üreteci sistemi tasarımı ve uygulamaları
FPGA based real time statistical test system with PCI for random number genarator design and applications
MURAT ERAT
Doktora
Türkçe
2008
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolErciyes ÜniversitesiElektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KENAN DANIŞMAN