Zom koyunlarının rapd-pcr metodu ile moleküler genetik analizi
Molecular genetic analysis with rapd-pcr method of zom sheep
- Tez No: 390612
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET BİNGÖL, YRD. DOÇ. DR. SELAHADDİN KİRAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Veteriner Hekimliği, Ziraat, Biotechnology, Veterinary Medicine, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 70
Özet
Bu çalışmada 2012-2014 yılları arasında Diyarbakır İli Karacadağ yöresinde, farklı sürülerde bulunan 18 baş zom koyunundan alınan kan örnekleri kullanılmıştır. Harran Üniversitesi Ziraat Fakültesi Hayvansal Biyoteknoloji Labaratuvarı'nda izole edilen DNA örnekleri 8 adet RAPD primeri ile kullanılarak işlenmiş ve RAPD-PCR bantları elde edilmiştir. Agaroz- Jel fotoğrafları incelenmiş ve elde edilen bantlar ile bantların var (1) ve yok (0) olmasına göre oluşturulan veri matrisi, PopGen32 paket programı kullanılarak, değerlendirilmiştir. Çalışmada 300-3000 bç aralığında 899 adet bant elde edilmiştir. Kullanılan 8 adet primer ile toplamda 54 lokus tespit edilmiş olup, bu lokusların 15'i polimorfik 39'u monomorfik bulunmuş, polimorfizm oranı ise % 27.8 olarak hesaplanmıştır. OPA-19 primeri ile tüm lokuslar polimorfik bulunurken, OPE-02 ve OPE-06 primerlerinde ise polimorfizm tespit edilememiştir. Genetik uzaklık, en yüksek 3 – 6 (0.189) nolu örnekler arasında, en düşük ise 4 - 5 (0.019) nolu örnekler arasında tespit edilmiştir. Genetik benzerlik değeri en az 3 - 6 nolu örnekler arasında (0.811), en çok ise 4 - 5 nolu örnekler arasında (0.981) bulunmuştur. Ortalama heterozigotluk 0.1253 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak RAPD-PCR yöntemiyle Zom koyunlarında polimorfizm, genetik benzerlik, genetik uzaklık ve heterozigotluk gibi bazı genetik parametreler hesaplanarak DNA seviyesinde tanımlayıcı ön bilgiler elde edilmiş, bireylerin heterojen bir yapıda olduğu ve bu genetik çeşitliliğin ıslah amaçlı kullanım potansiyeline sahip olduğu söylenebilir.
Özet (Çeviri)
In this research, blood samples taken from 18 heads of Zom sheep in different flocks in Karacadağ province of Diyarbakır between 2012-2014 were used. DNA samples, isolated in the Animal Biotechnology Laboratory at Harran at the Faculty of Agriculture, University of Harran, were processed using 8 RAPD primers and RAPD-PCR fragments were obtained. Agarose-Gel photographs were examined, and the resulting tapes and the data matrix generated according to be existing tapes (1) or none existing tape (0) were evaluated by popgen32 package program. 899 fragments were obtained in the range of 300-3000 bp in the study. Of the 54 loci identified using 8 primers, 15 and 39 loci were found as polymorphic and monomorphic, respectively. Polymorphism rate was calculated as 27.8%. All loci were found as polymophic when using OPE-19 primers whereas no polymorphism was detected at any loci when using OPE-02 or OPE-06 primers. Genetic distance was determined as the highest (0.189) among the samples 3-6, and the smallest (0.019) between the samples 4 and 5. Average heterozygosity was found as 0.1253. Genetic polymorphism and some genetic parameters, such as polymorphism, genetic similarity and distance, and heterozygotes were determined by using the RAPD methods in Zom Sheep, and some descriptive information has been obtained at the DNA level. Therefore, it can be said that genetic diversity detected among the individuals has the potential to be used for animal improvement.
Benzer Tezler
- Karacadağ bölgesi zom koyunlarının mitokondiriyal ND4( NADH dehidrogenaz altunite 4) geninin moleküler genetik analizi
Molecular genetic analysis of mitochondirial ND4( NADH dehydrogenase subuni̇te 4) gene of zom sheep in karacadag regi̇on
EMİNE ESER
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZoolojiHarran ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SELAHADDİN KİRAZ
- Karacadağ bölgesi zom koyunlarının mitokondriyal ND1 (nadh dehidrogenaz altunite 1) ve ND2 (NADH dehidrogenaz altunite 2) genlerinin moleküler genetik analizi''
Karacadağ Bölgesi Zom Koyunlarının Mitokondriyal ND1 (Nadh Dehidrogenaz Altunite 1) ve ND2 (NADH Dehidrogenaz Altunite 2) Genlerinin Moleküler Genetik Analizi''
ZAHİDE TEKEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatHarran ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SELAHADDİN KİRAZ
- Farklı yetiştirici koşullarında akkaraman varyetesi zom koyunlarının kırkım sonu canlı ağırlığı ve kirli yapağı verimi
Live weight after shearing and greasy wool yield of zom ewes of akkaraman breed in different raising conditions
TAHSİN KARAKOÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TURGUT AYGÜN
- Halk elinde yetiştirilen karacadağ zom koyununun süt bileşimi ve süt verim özellikleri
The milk yield and milk components of karacadağ zom sheep in farmer conditions
NALAN AKÇA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Veteriner HekimliğiSiirt ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GALİP BAKIR
PROF. DR. HASAN ÜLKER
- Şanlıurfa ilinde yetiştirilen zom koyunlarında kalpastatin (CAST) gen polimorfizmi
Genetic polymorphism of calpastatin gene (CAST) in zom sheep breed raised in şanliurfa province
MEHMET DURMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Veteriner HekimliğiHarran ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞÜKRÜ GÜRLER