Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen cytomegalovirüs (CMV) suşlarında gansiklovir direncinin araştırılması

Investigation of ganciclovir resistance in the cytomegalovirus (CMV) strains isolated from clinical samples

PDF İndir

  1. Tez No: 393917
  2. Yazar: SAFİYE DELİCE
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SELMA GÖKAHMETOĞLU
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Cytomegalovirus, gansiklovir, antiviral direnç, dizi analizi, Cytomegalovirus, ganciclovir, antiviral resistance, sequence analysis
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Amaç: Tüm dünyada yaygın olarak görülen sitomegalovirüs (CMV), Herpesviridae ailesine ait bir virüstür. CMV immün sistemi normal kişilerde genellikle asemptomatik hastalık oluştururken, konjenital enfeksiyonu olan, solid organ ve kemik iliği nakli yapılanlar ve kazanılmış immün yetmezlik sendromlu (AIDS) olgular gibi immün sistemi baskılanmış hastalarda ciddi mortalite ve morbidite nedeni olmaktadır. Gansiklovir tedavisi CMV'ye bağlı enfeksiyonlarda tedavide ilk tercihtir ve bu tedavi CMV'ye bağlı hastalık ve ölümü belirgin bir şekilde azaltmaktadır. Gansiklovir tedavisine direnç, artan bir oranda bildirilmektedir. Bu çalışmada, gansiklovir tedavisi görmekte olan hastalarda gansiklovir direncinin dizi analizi yöntemiyle araştırılması amaçlandı. Materyal ve Metod: Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nin poliklinik ve servislerinde takip edilen hastalara ait kan örneklerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) sonucuna göre CMV DNA viral yükü 1000 kopya/ml ve üzerinde olanlar çalışmaya alındı. Çalışmaya alınan 30 hastada CMV antiviral ilaç direncine yol açan mutasyonların saptanması için UL97 gen bölgesinde 420-664 kodonlarını, UL54 gen bölgesinde 261-588 ve 740-987 kodonlarını kapsayan gen bölgelerinin DNA dizi analizi (ABI 310 GeneticAnalyzer) yapıldı. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 30 hastanın birinde (%3.3) CMV UL97 gen bölgesinde M460V mutasyonu, birinde (%3.3) UL54 gen bölgesinde L802M mutasyonu saptandı. Çalışmaya dahil edilen hastaların 16'sında 9 varyant sekans (P887S, S897L, D898N, D605E, T922M, S470N, M827I, V355A, D898G) bulundu. Bu sekansların 5'i (P887S, S897L, D898N, D605E, V355A) daha önce yapılmış olan çalışmalarda tespit edilmişti. İlk defa bu çalışmada dört yeni polimorfik sekans (T922M, S470N, M827I, D898G) saptandı. Sonuç: Sonuç olarak çalışmaya dahil edilen hastalardan birinde (%3.3) CMV UL97 gen bölgesinde M460V mutasyonu, birinde (%3.3) UL54 gen bölgesinde L802M mutasyonu saptandı. CMV antiviral ilaç direncinin belirlenmesinin antiviral tedavinin planlanmasında klinisyene yardımcı olabilir. Saptanan polimorfik sekansların ilaç direncindeki rolünün belirlenmesi için daha ileri çalışmaların planlanması gerektiği kanaatine varıldı.

Özet (Çeviri)

Aim: Cytomegalovirus (CMV), common in all over the world, is a virus belonging to the family Herpesviridae. Although CMV cause generally asymptomatic virulence in healthy people that have normally immune system, it may cause serious mortality and morbidity in patients that have supressed immune system as congenital infections, solid organ and bone marrow transplantation and acquired immuno deficiency syndrome (AIDS) patients. Ganciclovir treatment is the first choice in the treatment of infections due to CMV and decreases remarkably morbidity and mortality related to CMV. Ganciclovir therapy resistance is reported at an increasing rate. In this study it was aimed to investigate increased ganciclovir resistance by the sequence analysis method in patients receiving ganciclovir treatment. Materials and Methods: The patients' blood samples, followed by the outpatient clinics and wards in Erciyes University Medical Faculty Hospital were included in this study in case of having CMV DNA viral load of 1000 copies/mL or above according to polymerase chain reaction (PCR) results. In the 30 patients included in this study, DNA sequence analysis (ABI 310 GeneticAnalyzer) was performed including 261 to 588 bp and 740 to 987 bp regions codons in UL54 gene and 420-664 region codons in UL97 gene, in order to detect mutations leading to CMV antiviral drug resistance. Results: In one of the 30 patients included in this study, M460V mutation in CMV UL97 gene region was detected and in an other patient L802M mutation in UL54 gene region was found. With 16 of the patients included in the study 9 sequence variants (P887S, S897L, D898N, D605E, T922M, S470N, M827I, V355A, D898G) were found. Five of these sequences had been identified in earlier studies that were established. For the first time in this study, four new polymorphic sequences are determined (T922M, S470N, M827I, D898G). Conclusion: As a result, with one of the patients included in the study M460V mutation is detected on CMV UL97 gene region, and with an another, L802M mutations is detected on UL54 gene region. Determination of CMV antiviral drug resistance, would help clinicians in planning antiviral therapy. It is arrived to the conclusion that further studies should be planned to determine the role of detected polymorphic sequences in drug resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    855813

    Klinik örneklerden izole edilen cytomegalovırus (CMV) suşlarında antiviral ilaç direnci araştırılması

    Investigation of antiviral drug resistance in cytomegalovirus (CMV) strains isolated from clinical samples

    PINAR GÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL AYDOĞAN

  2. Tez No

    272696

    Klinik örneklerden izole edilen Cytomegalovırus (CMV) suşlarının genotiplerinin araştırılması

    Investigation of genotypes of Cytomegalovirus (CMV) strains isolated in clinical samples.

    AYTEKİN KILINÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELMA GÖKAHMETOĞLU

  3. Tez No

    858683

    Cytomegalovırus enfeksiyonlarında genotip ve antiviral ilaç direncinin klinik ile ilişkisi

    Clinical relationship of genotype and antiviral drug resistance in cytomegalovirus infections

    GİZEM AKATMACI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi BiyolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜNEŞ ÖZÇOLPAN

  4. Tez No

    83959

    Klinik örneklerden izole edilen pesudomonas aeruginosa suşlarının SDS-page protein profilleri, antibiyotik duyarlılıkları, biyokimyasal ve piyosin tiplendirimi

    SDS-page protein profiles, antibotic sensitivity, biocehimical and pycin typing of pseudomonas aeruginosa strains isolated from various clinical specime

    BELGİN ALTINOK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    BiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Eğitimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CUMHUR ÇÖKMÜŞ

  5. Tez No

    86805

    Klinik örneklerden izole edilen kandidaların tiplendirilmesi ve antifungal ajanlara duyarlılıkları

    The Identification and antifungal sensitivity of candida strains that are isolated from clinical specimens

    SELMA GÖLLER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAN YULUĞ

Geri Dön