Tohumluk patates yumrularında patates iğ yumru viroidi (Potato spindle tuber viroid)' nin saptanması
Detection of Potato spindle tuber viroid in seed potato
- Tez No: 408989
- Danışmanlar: PROF. DR. HAYRETTİN OCAKVERDİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mustafa Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 42
Özet
Farklı patates çeşitlerinde (Agria, Marfona, Hermes, Russet burbank, Granola) ve ayrıca üreticilerin kendi ürettikleri tohumluk yumrularda Patates iğ yumru viroidi (PSTVd)'nin varlığını Reverse Transkripsiyon-Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR) yöntemi kullanılarak saptamak amacıyla bu çalışma yürütülmüştür. Yapılan bu çalışmada iki farklı ekstraksiyon yöntemi ile toplam 398 yumru ekstrakte edilmiştir.“Silica capture”yöntemi ile yapılan ekstraksiyonlarda nanodrop spektrofotometre ile yapılan ölçümlerde ekstraktın içinde RNA miktarının çok az ve kalitesiz olduğu gözlenirken, LiCl yöntemi ile yapılan ekstraksiyonlarda elde edilen RNA'ların çok iyi kalitede olmamasına rağmen PCR yapılabilecek düzeyde ve kalitede RNA miktarının olduğu saptanmıştır. Ekstrakte edilen RNA'ların PSTVd'ine karşı testlemelerinde iki farklı primer çifti (PSTVd1/PSTVd2 ve 3H1/2H1) kullanılmıştır. PCR ürünleri %1-1,5 agaroz jelde elektroforez işlemi ile görsel hale getirilmiştir. Her iki primer çifti ile yapılan RT-PCR testleri sonucunda testlenen tüm yumrular negatif olarak saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
This study was conducted to detect Potato spindle tuber viroid (PSTVd) by Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) method in different potato cultivars (Agria, Marfona, Hermes, Russet burbank, Granola) and also in seed tuber producing by growers. In this study total 398 tuber was extracted by using two different extraction methods. RNA amount was measured by nanodrop spectrophotometer. According to“Silica capture”extraction method, RNA quantity has low quality and was not enough. In LiCl extraction method, although RNA's havent a good quality but RNA quantity has found enough and quality for making PCR. Extracted RNA's were tested for PSTVd with two different primer (PSTVd1/PSTVd2 and 3H1/2H1) pairs. PCR product were visualized by 1-1.5% agarose gel. According to RT-PCR analysis made with two primers, all tested tubers were found PSTVd free.
Benzer Tezler
- Kastamonu ili patates depolarında görülen bakteriyel hastalıkların belirlenmesi
Determination of bacterial diseases in potato storage in Kastamonu province
ÖZGE ÇALIŞKAN PİRCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN MURAT AKSOY
- Phytophthora infestans'ın farklı klonal soylarının ve sıcaklığın yumruda hastalığın gelişimine etkisi
Effect of different clonal lineages of Phytophthorainfestans and temperature on tuber disease development
AYSUN ÇAVUŞOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ERHAN GÖRE
- Ön-sürgünlendirilmiş tohumluk patates (solanum tuberosum l.) yumrularının dikim pozisyonlarının verim ve verim unsurları üzerine etkileri
The effects of planting positions on yield and yield components of pre shooting seed potato tubers
MURAT KAMİL ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
ZiraatAtatürk ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMALETTİN KARA
- Tohumluk patates (Solanum tuberosum L.) yumrularının farklı tarihlerde ön-sürgünlendirilmesi ve dikiminin patatesin verim ve verim unsurları üzerine etkileri
Effects on pre-spoouting and planting time yield and yield characteristics in different times of tuber potatoes (Solanum tuberosum L.)
FERESHTEH IMANPARAST
- Ön-sürgülendirme tarihlerinin ve dikim metotlarının patatesin (Solanum tuberosum L. ) verim, verim unsurları ve bazı kalite özellikleri üzerine etkileri
The Effects of pre-shooting dates and planting methods on yield and yield components and some quality traits of potato (Solanum tuberosum L. )
ZÜHAL KAVURMACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
ZiraatAtatürk ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMALETTİN KARA