Tay-Sachs hastalığında heksozaminidaz A a-ALTBİRİM geninin 'Single Stranded Conformational Polymorphism' yöntemi ile incelenmesi
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 40948
- Danışmanlar: PROF.DR. GÖNENÇ CİLİV
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 1994
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 84
Özet
İnfantil Tay-Sachs hastalığı, Heksozaminidaz A (Hex A) genindeki mutasyonlar sonucu oluşur. Bu mutasyonlar Hex A aktivitesinin tam kaybına yol açar. Bugüne kadar Hex A geninde 40'dan fazla mutasyon tanımlanmıştır. Bazı mutasyonlar, Ashkenazi-Musevileri ya da Fransız- Kanadalılar gibi belirli topluluklarda yüksek sıklıkta bulunurken, bazıları da farklı toplumlarda görülmektedir. Bu çalışmada, infantil Tay-Sachs hastalığının tipik klinik ve enzimolojik bulguları bulunan 5 bebek ve 2 anne-baba Hex A geni yönünden incelendi. Hex A geninin 14 adet eksonu ve yan dizileri radyoaktif PCR (polimeraz zincir reaksiyonu) ile çoğaltıldıktan sonra“single stranded conformational polymorphism (SSCP)”yöntemi ile incelendi. Tek zincir konfcrmasycn değişikliklerini germek için denaturan ajan kullanılmayan poliakrilamid jet elektroforezinin ardından otoradyografi yapıldı. Otoradyografi sonucu iki hastada ekson 5'te, bir hastada da ekson 11 'de farklı bir görüntü elde edilmesi üzerine bu iki eksonun“Sanger dideoksi zincir sonlanması”yöntemi ile DNA dizi analizi yapıldı. Ekson 5'te farklı bir görüntü elde edilen üçüncü hastanın DNA dizi analizi yapılamadı. DNA dizi analizi yapılan hastalardan birinde intron 5 donor kesim bölgesinde yeni bir nokta mutasyonu (IVS 5+1 G->A) saptandı. Hasta bu mutasyon yönünden homozigot bulundu. Birinci dereceden akraba olan anne ve babada yapılan aynı çalışmalar, bu mutasyon yönünden anne ve babanın heterozigot olduğunu gösterdi. Bu mutasyon literatürde ilk defa tanımlanmış oldu. Diğer hastada ekson 11 'de C1177-»T değişimi sonucu, Arg393 kodonunun (CGA), dur kodonu olan TGA'ya dönüştüğü görüldü. Hasta bu mutasyon açısından heterozigot bulundu. Bu mutasyon daha önce literatürde tanımlanmıştır. Amacımız toplumumuzda Tay-Sachs hastalığının DNA düzeyinde incelenmesi için bir başlangıç yapmaktır. Elde edilen sonuçlar Türkiye'de Tay-Sachs hastalığına neden olan mutasyonların çeşitli olabileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Infantile Tay-Sachs disease is caused by mutations in the Hexosaminidase A (Hex A) gene. These mutations result in the complete absence of Hex A activity. More than 40 distinct mutations have been identified so far concerning the Hex A gene. Some mutations are found in high frequency in specific population groups such as Ash kenazi- Jews or French-Canadians, while others are present in diverse populations. Clinically and enzymatically diagnosed 5 infantile Tay-Sachs patients and 2 parents were investigated for the Hex A gene. Radioactive polymerase chain reaction (PCR) amplified products of all 14 Hex A exons and their flanking sequences were analysed by single- stranded conformational polymorphism (SSCP) protocol. Autoradiography was done after non-denaturing polyacrylamide gel electrophoresis to detect altered single-strand conformations. Different band migration pattern was found for two patients in the exon 5 and for another patient in the exon 1 1. Following a positive SSCP finding in the exon 5 and exon 1 1 PCR products, we sequenced the exons and the surrounding DNA region by“Sanger dideoxy chain termination”method. DNA sequence analysis of one of the patients who had different band pattern in exon 5 was not done. A new point mutation (IVS 5+1 G-»A) in the intron 5 donor splice site was identified in one of the patients. This proband is homozygous and the parents, who are first cousins, are heterozygotes in respect of the mentioned mutation. This mutation was reported for the first time. Other patient's exon 11 had C1177->T substitution that resulted in change of Arg393 codon (CGA) to TGA which is a stop codon. This patient was found heterozygote for this mutation. This second mutation had been reported by Akli et al in 1991. This study is the first step for investigation of Tay-Sachs disease at DNA level in Turkey. The results of this study indicated that the mutations which cause Tay-Sachs disease may be heterogeneous in Turkish population.
Benzer Tezler
- Heksozaminidaz enzimi alfa-altbirim genindeki 12 bazçiftlik delesyon mutasyonunun heksozaminidaz enzimi beta-altbirim geninde in vitro mutagenez ile oluşturulması ve proteine etkilerinin araştırılması
Reproducing the 12 bp deletion mutation of alpha-subunit gene of hexosaminidase into the beta-subunit gene of hexosaminidase by in vitro mutagenesis and analysing its effects on protein
İNCİLAY SİNİCİ
- Investigating the biological role of sialidase NEU4 ve GM3 synthase enzymes in a mouse model of tay-sachs disease
Sialidaz NEU4 ve GM3 sentaz enzimlerinin tay-sachs fare modellerinde biyolojik rolünün araştırılması
TALHA BARNAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VOLKAN SEYRANTEPE
- Investigation of the effects of antiinflammatory in the tissues of GM2 gangliosidosis mouse model
GM2 gangliosidoz fare modelinin dokularında anti-inflamatuar tedavisinin etkisinin araştırılması
NURSELİN ATEŞ
Doktora
İngilizce
2023
Moleküler Tıpİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VOLKAN SEYRANTEPE
- Brain lipid profiling of triply mouse model with the deficiencies of sialidase Neu1, Neu4 and ß-Hexosaminidase a enzymes
Sialidaz Neu1 ve Neu4 ile ß-Hekzosaminidaz a enzim eksikliği olan fare modelinde beyin lipid profilinin çikarilmasi
ZEHRA KEVSER PEKMEZCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VOLKAN SEYRANTEPE
- Investigating the biological role of sialidase NEU4 and GalNAc-T enzymes in a mouse model of Tay-Sachs disease
Tay-Sachs hastalığı fare modelinde sıalıdaz NEU4 ve GalNAc-T enzimlerinin biyolojik rolünün araştırılması
EDANUR ATEŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VOLKAN SEYRANTEPE
