Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi doku tipleme laboratuvarı'na başvuran bireylerin insan lökosit antijen (HLA) allellerinin ve haplotiplerinin frekansları
Allele and haplotype frequencies of human leukocyte antigen (HLA) of individuals applied to tissue typing laboratory in Tepecik Education and Research Hospital
- Tez No: 420113
- Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM PİRİM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İzmir Katip Çelebi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Bu çalışmada 2011-2015 yılları arasında Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Doku Tipleme Laboratuvarı'na başvuran bireylerin HLA allel ve haplotip freksanslarını belirlemeyi amaçladık. Bu amaçla, 2341 bireyin verisi tarandı. Daha sonra bu veri içerisinde aileler tanımlandı (391 aile, 1365 birey) ve haplotipler segregasyon analizi ile saptandı. Haplotiplerdeki HLA allellerine ek olarak, akrabalık ilişkisi bulunmayan 261 bireyin HLA genotipi HLA allel frekanslarının belirlenmesinde kullanıldı. Bireylerin HLA genotiplendirmeleri SSP (Olerup, Sweden), SSO (Lifecodes, United States) ve Sanger SBT (GenDX, Holland) yöntemleri ile gerçekleştirildi. HLA allel ve haplotip frekansları SPSS programı ile, Hardy-Weinberg ve bağlantı dengesizliği analizi ise (relative LD, D') Arlequin programı ile analiz edildi. HLA-A lokusunda A*02 (19,8%), A*24 (15,7%), A*03 (11,2%), HLA-B lokusunda B*35 (18,8%), B*51 (12,4%), B*44 (7,4%), HLA-DRB1 lokusunda DRB1*11 (21,2%), DRB1*04 (15,7%) ve DRB1*15 (10,6%) en sık alleller olarak gözlendi. A*24-B*35-DRB1*11 (1,7%), A*01-B*08-DRB1*03 (1,2%) ve A*03-B*44-DRB1*04 (1,1%) ise en sık haplotipler olarak saptandı. Aileler üç ayrı grupta analiz edildiler: (i)anne ile babanın ve en az bir çocuğun bulunduğu aileler, (ii) Anne ve babadan yalnızca biri ile en az bir çocuğun bulunduğu aileler, (iii) anne ve babanın olmadığı fakat en az iki çocuğun bulunduğu aileler. Bu üç grup analiz edildiğinde benzer sonuçlar bulundu. Ayrıca, sonuçlarımızı Türkiye'de yapılan diğer popülasyon çalışmaları ile karşılaştırdık ve benzer sonuçlar gözlemledik.
Özet (Çeviri)
In this study, we aimed to identify HLA allele and haplotype frequencies of individuals who were tested in Tepecik Education and Research Hospital Tissue Typing Laboratory between 2011 and 2015. For this purpose, the data of 2,341 individuals were screened. Then the families were defined (391 families, 1365 members) and the haplotypes were determined by segregation. In addition to HLA alleles in haplotypes, HLA genotypes of 261 individuals were used for calculating of HLA allele frequencies. HLA genotyping of individuals were performed by using SSP (Olerup, Sweden), SSO (Lifecodes, United States) and Sanger SBT (GenDX, Holland) methods. The allele and haplotype frequencies were calculated by using SPSS, and Hardy-Weinberg Equilibrium and relative LD (D') were evaluated by Arlequin. A*02 (19,8%), A*24 (15,7%), A*03 (11,2%) in HLA-A locus, B*35 (18,8%), B*51 (12,4%), B*44 (7,4%) in HLA-B locus and DRB1*11 (21,2%), DRB1*04 (15,7%) and DRB1*15 (10,6%) in HLA-DRB1 locus were observed as the most frequent alleles. A*24-B*35-DRB1*11 (1,7%), A*01-B*08-DRB1*03 (1,2%) and A*03-B*44-DRB1*04 (1,1%) were observed as the most frequent haplotypes. Families were divided into three groups: (i) families with both parents and one or more children, (ii) families with one parent and one or more children, and (iii) families with no parents but having two or more children. When we analyzed the haplotypes of these three groups, we found similar results. We also compared our results with other studies that included Turkish populations and obtained similar results.
Benzer Tezler
- HLA-B51 pozitif behçet hastalarında HLA-B*51 allellerinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
SİNEM TOPÇU
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Genetikİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TÜLAY KILIÇASLAN AYNA
- Çölyak hastalığında themis ve RUNX3 genlerinin ekspresyonlarının incelenmesi
The investigation of themis and RUNX3 gene expressions in celiac disease
MUSTAFA KURTULUŞ
Doktora
Türkçe
2022
Tıbbi Biyolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM PİRİM
- Tubal ektopik gebelik sebebiyle medikal tedavi uygulanan hastalarda ektopik odağın doku elastografisi ile değerlendirilmesi ve tedavi etkinliğini öngörmedeki yeri
Evaluation of the tubal ectopic pregnancy mass with tissue elastography in patients treated with medical therapy and assessment of its predictivity in terms of therapeutic efficacity
ARDA BATUHAN KARADUMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Kadın Hastalıkları ve DoğumSağlık BakanlığıKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AZRA ARICI YURTKUL
- Acil serviste karbonmonoksit zehirlenmesi tanısı konan hastalarda kan laktat seviyesinin prognostik önemi
Başlık çevirisi yok
BURCU URSAVAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
İlk ve Acil YardımSağlık Bilimleri ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERSİN AKSAY
- İnflamatuar nazal polip tanılı hastaların tedavi duyarlılığında lokal 'serum amiloid a'nın rolü
The role of local 'serum amiloid a' in the treatment sensitivity of patients diagnosed with inflammatory nasal polyp
HAKAN TUHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Kulak Burun ve BoğazSağlık Bilimleri ÜniversitesiKulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜLEYMAN EMRE KARAKURT