Staphylococcus aureus suşlarında metisilin direncinin klasik yöntemler ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Detecting of methicillin resistance of staphylococcus aureus isolates by classical and molecular methods
- Tez No: 420233
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET AYYILDIZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Kromojenik agar, mecA, MRSA, oksasilin, sefoksitin, Agar, Metisilin, Staphylococcus aureus, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Cefoxitin, chromogenic agar, mecA, MRSA, oxacillin, Agar, Methicillin, Staphylococcus aureus, Drug resistance, Drug resistance-microbial
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Staphylococcus aureus Suşlarında Metisilin Direncinin Klasik Yöntemler ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması Amaç: Bu çalışmanın amacı, S. aureus suşlarında metisilin direncinin belirlenmesinde kullanılan çeşitli klasik yöntemlerle genotipik bir yöntem olan mecA geni varlığının kıyaslanmasıdır. Materyal ve Metot: Çalışmaya çeşitli klinik örneklerden izole edilen 86 metisiline dirençli ve 30 metisiline duyarlı S. aureus suşu dahil edildi. Suşların metisilin dirençleri oksasilin ve sefoksitin disk difüzyon testi ile belirlendi. MRSA kromojenik agarda üreme görüntüleri değerlendirildi. Polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırılan mecA gen varlığı altın standart test olarak kabul edildi ve diğer sonuçların sensitivite, spesifite, pozitif ve negatif prediktif değerleri buna göre hesaplandı. Bulgular: MRSA olarak tanımlanmış 86 suştan 8 tanesinde mecA geni bulunamadı. mecA geni bulunmayan 8 MRSA suşundan 1 tanesi sefoksitine duyarlı iken 7 tanesinin dirençli olduğu saptandı. Bu suşların tümü oksasiline dirençli idi. MRSA kromojenik agar ile yapılan çalışmada ilk 24 saatlik inkübasyondan sonra MRSA suşlarından 41' inde üreme olurken. 48 saatlik inkübasyon sonrasında bu sayı 45 oldu. Üreyen suşlardan 2 tanesinin mecA genine sahip olmadığı tespit edildi. Sensitivite, spesifite, PPD ve NPD yüzdeleri sefoksitin disk difüzyon testi için sırasıyla 98.7, 81.6, 91.7, 39.7; oksasilin disk difüzyon testi için sırasıyla 100, 78.9, 90.7, 38.5; MRSA kromojenik agar 24. saatlik değerlendirme için sırasıyla 45.8, 63.2, 70.2, 33.3; 48. saatlik değerlendirme için sırasıyla 51.4, 63.2, 72.5, 33.3 idi. Sonuç: MRSA sorununun yüksek olduğu hastanelerde gerekli önlemlerin alınabilmesi açısından mecA araştırılması en doğru sonuca ulaşmada önemlidir. Sefoksitin ve oksasilin disk difüzyon yöntemleri sonuçları birbirine yakın bulunduğundan sefoksitin diski olmadığı durumlarda oksasilinin de bir alternatif olabileceği düşünmekteyiz. MRSA saptanması için kromojenik agarın kullanılması durumunda ise ihtiyatlı davranılması uygun olacaktır.
Özet (Çeviri)
Detecting of Methicillin Resistance of Staphylococcus aureus Isolates by Classical and Molecular Methods Aim: This study was planned to detect methicillin resistance in S. aureus strains by conventional phenotypic methods and polymerase chain reaction for mecA gene and to compare the results of these tests for their sensitivity and specificity. Material and Method: Eighty six methicillin resistant and 30 methicillin sevsitive S. aureus from various clinical samples were included to this study. Methicillin resistance of the isolates was detected by oxacillin and cefoxitin disc diffusion method. The presence of colongy on MRSA agar medium was evaluated. The presence of the mecA gene, investigated by polymerase chain reaction, is considered to be the gold standard test and other results of sensitivity, specificity, positive and negative predictive values were calculated accordingly. Results: The mecA gene was not found in 8 out of 86 isolates that were defined as MRSA. Out of these 8 isolates, 1 was susceptible to cefoxitin and the other 7 were resistant to cefoxitin. All of these isolates were resistant to oxacillin. In the study done with MRSA chromogenic agar, after the first 24 hours of incubation,growing occurred in 41 of the MRSA isolates. 48 hours later, this number became 45. It was detected that 2 of the isolates did not have the mecA gene. The percentage of sensitivity, specificity, PPD and NPD for the cefoxitin disc diffusion test were respectively 98.7, 81.6, 91.7, 39.7; for the oxacillin disc diffusion test respectively 100, 78.9, 90.7, 38.5 respectively; for the 24-hour evaluation MRSA chromogenic agar respectively 45.8, 63.2, 70.2, 33.3; for the 48-hour evaluation respectively 51.4, 63.2, 72.5, 33.3. Conclusion: Investigation of mecA is crucial for taking the necessary precautions in hospitals in which the MRSA problem is common. The results for cefoxitin and oxacillin disc diffusion method were found close to each other, hence we think oxacillin can be an alternative in situations that cefoxitin disc is not present. It is advised that the chromogenic agar is used carefully.
Benzer Tezler
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında antibiyotik direnç genleri ve panton-valentine lökosidin varlığının araştırılması
Investigation of antibiotic resistance genes and the presence of pantone valentine leukocidin in Staphylococcus aureus strains isolated from various clinical specimens
ESMA KARATAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FAHRİYE EKŞİ
- İzmir pazarlarında satılan taze köy peynirlerinin bazı nitelikleri ve özellikle zehirlenmeye neden olan bakteri içerikleri üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
NURSEL VAPURCU
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN YAYGIN
- İdrar kültürlerinden izole edilen coag (-) staphylococcus (s. epidrmidis ve s. saprophyticus)'ların idrar yolu enfeksiyonlarındaki yeri
The Place of coag (-) staphylococcus to the urinary tract infectron which are isolated from the urine cultures
SUMRU ÇITAK(KORMAN)
- Bazı baharat ve ekstraktlarının gıda zehirlenmesi yapan bakteriler üzerine antimikrobiyal etkileri
Başlık çevirisi yok
ŞAHİKA AKTUĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET KARAPINAR
- Kadın genital bölgesi vajen ve serviks mikrobiyal flora dağılımı ve enfeksiyon etkeni patojen mikroorganizmaların tanımı
The Distrubition of microbial flora of vagina nd cervix in women genital tract and description of pathooen microorganism which are infection agent
NİHAL YÜCEL