Ege Üniversitesi Hastanesi yeni doğan yoğun bakım ünitesinden izole edilen potansiyel patojen Aspergillus fumigatus Fresen.'nin bir virulans faktörü olan proteaz enzim aktivitelerinin araştırılması ve karakterizasyonu
Investigation and characterization of protease enzyme activities that is one of the virulence factors of potential pathogen Aspergillus fumigatus Fresen. isolated from hospital neonatal intensive care unıt at Ege University
- Tez No: 420512
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALEV UZTAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Microbiology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 106
Özet
Bu çalışmada, bir yenidoğan yoğun bakım ünitesinin havasal florasından izole edilmiş potansiyel patojen fungal türlerden biri olan Aspergillus fumigatus adlı küfün moleküler tanılanması ve virülans faktörlerinden biri olan proteaz enziminin belirlenip karakterize edilmesi amaçlanmıştır. Morfolojik olarak klasik yöntemlerle tanımlanmış bu türe ait 29 farklı A.fumigatus izolatının iki farklı ülkede ve iki farklı araştırma merkezinde hem klasik DNA izolasyon yöntemleri kullanılarak, hem de standart kit prosedüründen yararlanılarak moleküler tanılaması yapılmıştır. Sekans işlemi sonucunda elde edilen baz dizileri NCBI gen bankasına yollanıp, sonuçları alınmıştır. Bu sonuçlar doğrultusunda, suşların %99,9 Aspergillus fumigatus olduğu kanıtlanmıştır. Proteaz taraması için içeriğinde Skim-milk bulunan besiyerleri kullanılmış ve bu suşların sütteki kazeini parçalamasından yararlanılmıştır. Kazeini parçalayıp, açık zon oluşturmaları sayesinde, enzim aktivitesi olduğu tespit edilmiştir. En iyi aktivitenin hangi Aspergillus fumigatus izolatına ait olduğunu belirlemek için ise; (Solid State Fermentation) SSF'de üretim yapılarak 3., 5. ve 7. günlerde alınan sıvılardan spektrofotometrik yöntemlerle ölçüm yapılmış ve en yüksek aktiviteye sahip olan izolat belirlenmiştir. eAP27 kodunu taşıyan bu suş için fermantasyon şartları optimize edildi. Optimum fermantasyon şartları 37ºC ve 5 gündür. Bu suşun optimum çalışma koşulları incelendiğinde ise; inkübasyon pH: 7,5-8; en iyi aktivite gözlenen substrat: Casein olarak bulunmuş ve inhibitör maddeler ile metal iyonlarının enzim üretimi üzerinde etkileri olduğu gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
This study aimed to identify Aspergillus fumigatus, one of the widely pathogen fungal species with molecular diagnosis methods and characterize protease enzymes, which is the virulence factors of Aspergillus fumigatus is isolated from airborne flora in intensive care units. This species morphologically defined by using conventional methods. Molecular identification of these 29 different isolates of Aspergillus fumigatus, is completed by both conventional DNA isolation methods and molecular diagnostic kit utilizing standard procedures in two different countries and in two different research center. The sequences obtained from the Sequence PCR processing, are send to NCBI gene bank and the results were received. These results have proved that, our all species are 99.9% Aspergillus fumigatus. Skim-milk media is used for scanning protease enzymes, and it is benefited fragmentation of casein molecules in the milk media of these strains. With the fragmentation casein molecules, it was appeared a clear zone and this has been a proof for enzyme activity. To determine which Aspergillus fumigatus isolate has the best enzyme activity is used Solid State Fermentation (SSF), fermentation liquid as a enzyme was collected on 3th, 5th and 7th and measurements were scanned with spectrophotometric methods. This isolate has been tagging as a eAP27 and optimized fermentation conditions for this strain. The optimum fermentation conditions are 37ºC and 5 days. When these strain investigated for optimum process conditions; incubation pH 7.5-8; the substrat is observed for best activity: Casein; and it has been shown that the inhibitory agents and the metal ions are effective on enzyme production.
Benzer Tezler
- Doğumsal kalp hastalığı olan yenidoğanlarda erken dönem prognozun retrospektif değerlendirilmesi
Early period prognosis in newborns with congenital heart disease retrospective evaluation
MÜŞERREF KASAP
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZGE ALTUN KÖROĞLU
- Hastane enfeksiyonları,etken patojenler ve antibiyotiklere direnç
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA ÖZÇETİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. FADIL VARDAR
- Yenidoğan konvülziyonlarında biyokimyasal belirteçler ve amplitüd entegre EEG'nin tanısal ve erken prognostik önemi
The diagnostic and early prognostic value of biochemical markers and amplitude integrated EEG in neonatal convulsions
MAHİR TANRIVERDİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
NörolojiEge ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİLGÜN KÜLTÜRSAY
- Yenidoğan yoğun bakım ünitesinde bebeği yatan annelerin yenidoğan bakımına yönelik bilgi düzeyleri
Information levels about newborn care of the mother of the babies lining at the newborn ıntensive care
SERAP KAYNAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
HemşirelikAfyon Kocatepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Hemşireliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NİHAL SUNAL
- Prematür bebeklerde kanguru bakımının annenin emzirme durumuna ve bebeğin büyüme-gelişmesi üzerine etkisi
The i̇mpact of kangaroo care on mother's breastfeedi̇ng status and baby's growth and developmenti̇n premature infants
EMİNE SERAP SARICAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge ÜniversitesiEbelik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NAZAN TUNA ORAN