Türkiye'de yayılış gösteren Dryomys nitedula (Pallas, 1779) Türünün (Rodentia:Gliridae) NADH dehidrojenaz 1 (ND1) mitokondriyal gen bölgesindeki genetik varyasyonlarının belirlenmesi
Determining the levels of genetic variation inferred from mitochondrial gene NADH dehydrogenase 1 (ND1) in Dryomys nitedula (Pallas, 1779) (Rodentia:Gliridae) from Turkey
- Tez No: 424003
- Danışmanlar: DOÇ. DR. TEOMAN KANKILIÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Zooloji, Biotechnology, Genetics, Zoology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Niğde Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 109
Özet
Bu çalışmada Dryomys cinsi Orman yediuyurunun moleküler filogenisi mitokondriyal DNA'nın NADH dehidrojenaz I gen bölgesi kullanılarak çalışılmış ve iki alternatif hipotez test edilmiştir: (i) Dryomys nitedula türü alttür içermez ve Türkiye'de geniş bir yayılışa sahiptir; alternatif olarak (ii) D. nitedula kompleks bir türdür ve çok sayıda alttüre sahiptir. Sekans dizilerinin Maksimum likelihood, Neighbour joining ve Network filogenetik analizleri yapılmıştır. Mitokondriyal veriler Türkiye'de D. nitedula türü içinde pek çok alttür olduğunu desteklemiştir. Mitokondriyal veriler, Trakya populasyonu Anadolu populasyonu arasında gen akışının olmadığını ve her iki grubun yüksek düzeyde farklılaştığını destekleyen Allozim analizi verileriyle uygun bulunmuştur. Bu tez çalışma sonuçları Türkiye'de Trakya'da D. n. wingei ve Batı Anadolu'da D. n. phrygius olmak üzere iki alttür bulunduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
We present a molecular phylogeny of forest dormouse belonging to the genus Dryomys, based on partial sequences of mitochondrially encoded NADH dehydrogenase I gene (NDI) to examine two alternative hypotheses: (i) Dryomys nitedula is a single subspecies, widely distributed species in Turkey, or (ii) D. nitedula is a species complex and have a lot of subspecies. We conduct phylogenetic analyses of sequence data using neighbor joining, maximum likelihood, and network analysis. The mtDNA data supported the hypothesis of several subspecies within D. nitedula in Turkey. The mtDNA data divided Thrace populations from Anatolian populations, consistent with high differentiation and lack of gene flow between Thrace and Anatolian forest dormouse populations as suggested by allozyme data. The current results show two well-supported subspecies (D. n. wingei from Thrace and D. n. phrygius from Western Anatolia) within the species D. nitedula.
Benzer Tezler
- Türkiye'de yayılış gösteren Dryomys nitedula (Pallas, 1779) türünün (Rodentia:Gliridae) nükleer gen beta-fibrinojen (BFIBR) ile genetik varyasyonlarının belirlenmesi
Determining the levels of genetic variation inferred from nuclear gene beta-fibrinogen (BFIBR) in Dryomys nitedula (Pallas, 1779) species (Rodentia:Gliridae) from Turkey
BURCU AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyoteknolojiNiğde ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TEOMAN KANKILIÇ
- Türkiye'de yayılış gösteren dryomys nitedula ve dryomys laniger türlerinde (mammalıa: rodentıa) mitokondriyal 12s rrna geninde nükleotit dizi varyasyonları
Nucleotide sequence variation of the mitochondrial 12s rrna gene in dryomys nitedula and dryomys laniger (mammalia: rodentia) from Turkey
DERYA ALTUNBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyoteknolojiNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TEOMAN KANKILIÇ
- Türkiye'de yayılış gösteren Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) ve Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) zehirlerinin karşılaştırmalı proteomik karakterizasyonu, koagülasyon üzerindeki etkilerinin ve sitotoksisitelerinin belirlenmesi
Comparative proteomic characterization of the venom of Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) and Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) distributed in Turkey and determination of their effects on coagulation and cytotoxicity
NAŞİT İĞCİ
Doktora
Türkçe
2015
BiyokimyaAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA DUYGU ÖZEL DEMİRALP
PROF. DR. BAYRAM GÖÇMEN
- Türkiye'de yayılış gösteren su sıçanı Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populasyonlarının MtDNA (Sitokrom B ve kontrol bölgesi) varyasyonları
MtDNA (Cytochrome B and control region) variations of water vole Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populations distributed in Turkey
PERİNÇEK SEÇKİNOZAN ŞEKER
- Türkiye'de yayılış gösteren Ramalina (Ach.) cinsine ait bazı türlerin morfo-anatomik karakterleri ve multilokus moleküler sekans analizleri ile modern revizyonu
Modern revision of the genus Ramalina (Ach.) in Turkey using morpho-anatomical characters and multilocus molecular sequence analyses
BETÜL PATAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET GÖKHAN HALICI