Sepsis tanısında moleküler yöntemlerin konvansiyonel yöntemler ile karşılaştırılması
Comparison with conventional methods in molecular methods in the sepsis diagnosis
- Tez No: 424813
- Danışmanlar: PROF. DR. SERKAN ÖNCÜ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Clinical Microbiology and Infectious Diseases
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 67
Özet
Sepsis Tanısında Moleküler Yöntemlerin Konvansiyonel Yöntemlerle Karşılaştırılması Sepsis, birçok sistemi tutan, özellikle hemodinamik değişikliklere yol açabilen, şok, organ fonksiyon bozukluğu ve yetmezliğine kadar gidebilen öldürücü bir enfeksiyon hastalığıdır. Tüm tıbbi gelişmelere karşın sepsis halen yüksek mortalite ile seyreden bir klinik tablodur.Erken tanı ve tedavi prognozu olumlu yönde belirleyen en önemli etmendir. Etkeni belirleme konusunda günümüzde en sık kullanılan test kan kültürüdür; ancaketkinliği istenilen düzeylerde değildir. Moleküler tetkikler bu konuda geleceği olan uygulamalardır. Bu çalışmada moleküler yöntemlerden polimeraz zincir reaksiyonuyönteminin, sepsis tanısındaki etkinliğinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmamıza sepsis tanısı konulan 116 hasta dahil edilip, toplamda 232 kan örneği incelenmiştir. Hastaların 74 (%64)'ü erkek, 42 (%36)'si kadın idi. Hastaların yaşları 17- 90 (60,74 ±16.263) arasında değişmekte idi. Çalışmamızda sepsis ataklarındaetken mikroorganizmayı saptama oranı kan kültürü ile %47,4 iken PCR ile pozitif sonuç alınamadı. Tüm hastalardan alınan toplam 232 şişe kan kültürünün 90 (%38,79)'ında üreme saptanmıştır. Kan kültüründe üreyen mikroorganizmaların dağılımı yapıldığında en çok Gram pozitif bakteri üremesi (n:49, %54,44) saptanmış olup, bunları Gram negatif bakteriler (n:32, %35,56) ve Candida spp.(n:9, %9)türleri izlemiştir. En fazla üreyen mikroorganizmalar sırasıyla KNS (%43,3), E.coli(%10) ve Candida spp. (%10) idi. Çalışmamızda hiç bir örnekte PCR pozitifliğine rastlanmamasının nedeni olarak, daha önce yapılmış diğer çalışmalardan farklı bir PCR yöntemi olan klasik PCR yönteminin kullanılmış olmasını düşünmekteyiz. Çalışmamızda kullanılan klasik PCR yöntemi ile örneklerden 16S rRNA geninin çoğaltılamaması ise yeterli bakteri DNAsı bulunmamasına bağlı olabilir. Amplikonlardan nested PCR ile 16S rRNA geninin daha küçük fragmanlarının elde edilebilmesi mümkün olabilir ya da daha önceki çalışmalarda kullanılan Multipleks real time PCR temelli yöntemlerle PCR çalışılması uygun olacaktır
Özet (Çeviri)
Comparison With Conventional Methods In Molecular Methods In The Sepsis Diagnosis Sepsis is a multisystem disease, typically leading to hemodynamic changes, shock, organ dysfunction and organ failure and can be life threatening.Despite all medical advances, sepsis is still a clinical entity associated with high mortality.Early diagnosis and treatment is the most important factor in determining prognosis in a positive way. The most widely used test to identify the etiology is blood culture; but efficiency is not at the desired level.Molecular tests are the future applications in this regard.In this study, the efficacy of the molecular polymerase chain reaction was investigated in comparison to blood culture for to identify the causative microorganism of sepsis. 116 patients diagnosed as sepsis were included in the study and a total number of 232 blood samples were examined. 74 of the patients were male(64%) and the other 42 were female(36%).Age of the patients ranged between 17 to 90 ( 60.74 ± 16,26).While the ratio of blood culture positivity was 47.4%, there was no positive results with PCR. A total of 232 blood cultures were collected and positivity was detected in 90 (38.79%) bottles. Gram positive isolates were the most isolated microorganisms followed by Gram negative bacteria and Candida spp. The most commonly isolated microorganisms were coagulase negative staphylococci (43.3%), E.coli (10%) and Candida spp. (10%). The negative results of PCR detected in the study is thought to be the the result of the used PCR method. The low DNA levels in samples is the probabl reason for the negative results of classical PCR. Nested PCR or multiplex real time PCR methods which may detect small fragments of 16S rRNA would be more suitable for molecular detection of microorgansims.
Benzer Tezler
- Sepsis etkenlerinin saptanmasında, kültür yöntemine göre real ?time PZR ( polimeraz zincir reaksiyon)?nin tanı değerinin araştırılması
Research on diagnostic value of real-time PCR (polymerase chain reaction) in comparison with culture method to detect agents for sepsis özlem ögüç şanli
ÖZLEM ÖGÜÇ ŞANLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHMUT BAYKAN
- Sepsis tanısında yeni moleküler yöntemlerin kullanılması
Examination of new molecular methods in sepsis diagnosis
BURCU YERTUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN ZER
- Gram pozitif bakteri üremesi saptanan kan kültürlerinde genotiplendirme ile idendifikasyon ve direnç tayini
Identification and resistant gene detection with genotyping in blood cultures with gram positive bacteria growth
ZİYA ERDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiDüzce ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CİHADİYE ELİF ÖZTÜRK
- Neonatal sepsis tanılı hastalardan alınan kültür materyallerinde mikroorganizmaların genetik profillenmesi
Genetic profiling of microorganisms in culture materials from patients with neonatal sepsis
BURCU KESMEZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıÇukurova ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEJAT NARLI
- Deneysel sepsis modellerinde gerçek zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile etkenlerin saptanması
Using real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) for detection of agents in the eprimental sepsis models
ALİ A. FOUAD
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE KALKANCI