Deneysel sepsis modellerinde gerçek zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile etkenlerin saptanması
Using real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) for detection of agents in the eprimental sepsis models
- Tez No: 260766
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE KALKANCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Bakteri, Gerçek zamanlı PZR, Mantar, Sepsis, SYBR green, TaqMan, Moleküller, Bacteria, Fungi, Sepsis, Real-Time PCR, SYBR green, TaqMan, Molecules
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Sepsis, tedavide ciddi problemler oluşturan ve yüksek mortaliteye neden olan bir hastalıktır. Sepsisin erken tanısı için araştırma yapmak hızlı tanısı için değerlidir. Sepsisin erken ve çabuk tanısını için PZR yöntemi kullanılmaktadır.Çalışmamızda, enfeksiyon etkenlerini tek tek veya polimikrobiyal şeklinde saptamak için gerçek zamanlı PZR kullanılmıştır.Bu çalışmada toplam 14 tavşan kullanılmış ve A, B, C ve sağlıklı kontrol grubu S olarak dört gruba ayrılmıştır. C. albicans ATCC 10231 ve A. fumigatus ATCC 204305 A grubu tavşanlara, E. coli ATCC 10536 ve S. aureus ATCC 6538 B grubu tavşanlara, kulak veni yolu ile enjekte edilmiştir. C grubu tavşanlara ise eşit oranlarda mantar ve bakteri süspansiyonları enjekte edilmiştir. Sağlıklı kontrollere ise hiçbir mikroorganizma enjekte edilmemiştir.Kan ve doku örnekleri kültüre edilmiş ve tüm çalışma gruplarında pozitif bulunmuştur. Tavşanların kan ve doku örneklerinden DNA'lar elde edilmiştir.Özgül primer ve problar kullanarak, fungal ve bakteriyel sepsisin varlığı PZR yöntemi ile doğrulanmıştır.Ayrıca SYBR green ve erime eğirisi (Melting curve) kullanılarak çok hedefli PZR yöntemi gerçekleştirilmiştir.Örneklerin çoğunda patojenler saptanmış, kontrol gruplarında ise negatif bulunmuştur.sepsisin tanısında kullanılan moleküler yöntemler, kan kültürü ile kıyaslandığında daha hızlı sonuç verebilen, özgüllük ve duyarlılığı yüksek testlerdir.
Özet (Çeviri)
Sepsis is a disease that cause serious problems in the treatment and thus it has high mortality rates. Early diagnosis of sepsis is worth of research, in order to provide rapid diagnosis. PCR methodology is used for early and prompt diagnosis of sepsis.In our study, Real-Time PCR was used for the detection of infectious agents individually or in polymicrobial form.In this study 14 rabbits were used and divided into four groups, as; A, B, C and healthy control groups. C. albicans ATCC 10231 and A. fumigatus ATCC 204305 were injected into A group rabbits, while E. coli ATCC 10536 and S. aureus ATCC 6538 were injected into B group rabbits. Injections were performed by the ear ven. Equal proportion of fungi and bacteria suspension was injected into C group of rabbits. None of the microorganism injected into healthy controls.Blood and tissue samples were cultured and were found positive in all working groups. DNA samples were extracted from blood and tissue samples of the rabbits.Using specific primers and probes, the presence of fungal and bacterial sepsis was confirmed by TaqMan PCR. An additional multiplex PCR assay was performed using SYBR green and melting curve analysis.Pathogens were detected in most of the samples, while control groups were found negative.Molecular methods that used in the diagnosis of sepsis when compared with blood culture, can be provide more rapid results, specificity and sensitivity of these tests are high.
Benzer Tezler
- Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study
Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma
DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU
- Deneysel sepsis modellerinde Morus Nigra (Kara Dut)'nın sepsis tedavisi ve mortalitesindeki etkisi
Effect of Morus Nigra (Black Mulberry) on sepsis treatment and mortality in experimental sepsis models
MURAT ALİ ŞEN
- Deneysel sepsis modelinde Pentoksifillin'in myeloperoksidaz, nitrik oksid ve tümör nekroz faktör salınımı üzerine etkilerinin incelenmesi
The Effects of pentoxifylline on myeloperoxidase, nitric oxide and tumor necrosis factor release in experimental sepsis model
HİLAL ERSÖZ KOÇDOR
- Deneysel sepsis modelinde hidroksiürenin proinflamatuar sitokin ve doku histopatolojileri üzerine etkileri
The effects of hydroxyurea on proinflammatory cytokine and tissue histopathology in experimental sepsis model
GÖKÇEN KÜLTÜROĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Anestezi ve ReanimasyonSağlık Bilimleri ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. JÜLİDE ERGİL
- Deneysel sepsis modelinde kök hücre uygulamasının immünomodülatuvar etkileri
Immunomodulator effects of stem cell application in experimental sepsis model
LEYLA TOPÇU SARICA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Anestezi ve ReanimasyonMarmara ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL HAKKI CİNEL