Investigation of SNP (rs10889677) located at the miRNA binding site of the IL23r gene in patients with polycystic ovary syndrome
Polikistik yumurtalık sendromlu hastalarda IL23r geninin miRNA bağlanma yeri SNP'sinin (rs10889677) araştırılması
- Tez No: 436302
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 65
Özet
IL-23reseptörü (IL-23R), T hücrelerinin T-yardımcı 17 fenotip hücrelere dönüşmesi için kılavuzluk rölü üstlenmektedir. IL-23R tek nükleotid polimorfizmi (SNP), Crohn hastalığı ve romatizmal artrit dahil olmak üzere birçok otoimün hastalıkları ile ilişkili bulunmuştur.miRNA'lar birçok fizyolojik ve patolojik süreçte mRNA'nın 3' translasyona uğramayan bölgesine (UTR) bağlanarak gen ekspresyonu seviyesini düzenlemekte rol oynar. Mevcut çalışmada, IL23R (rs10889677) geninin 3'UTR bölgesindeki miRNA bağlanma bölgesinde gözlenen tek nükleotid polimorfizmi (SNP) ile bir otoimmün hastalığı olan Polikistik Yumurtalık Sendromu (PCOS) arasında bir ilişki olup olmadığını araştırılmıştır. Bunun için 42 PCOS hastası ve 37 PCOS hastası olmayan (kontrol) sağlıklı kadın birey kullanıldı. Hastaların ortalama yaş oranı 24.22 ± 5.22 ve kontrollerin ortalama yaş oranı ise 24.73 ± 6.16 idi. Androjen hormonlar da dahil olmak üzere bir grup hormonun (Age, Body mass index, Luteinizing hormone, Estradiol,Testosterone,Dehydroepiandrosterone, Thyroid-Stimulating Hormone, Follicle-stimulating hormone) kan seviyeleri ölçüldü. Aynı bireylerin tüm kanlarından DNA izolasyonu yapıldı ve bu genomik DNAlar kullanılarak rs10889677 polimorfizmi üzerinden genotipleme gerçekleştirildi. Sonuç olarak,, AA, CA ve CC, genotipleri için görece olasılıklar oranı (OR) sırasıyla 1.06, 0.72, and 1.65olarak bulunmuştur. Her ne kadar genotipler ve gruplar arasında yapılan ki-kare testi istatiksel olarak anlamlı bir ilişki vermediyse de (p=0.07), OR değerleri CC genotipinin PCOS hastalığı için bir meyil oluşturabildiğini düşündürmektedir.
Özet (Çeviri)
IL-23andits receptor (IL-23R) guide T cells toward the T-helper 17 phenotype. IL-23R single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been associated with several autoimmune diseases, including Crohn's disease and rheumatoid arthritis.miRNAs play a role in a variety of physiological and pathological processes to regulate the levels of gene expression through their binding to 3' Untranslated Region (UTR) of mRNAs. In the present study, it has been investigated whether there is a relationship between the SNP (rs10889677) observed in the gene of miRNA binding site of IL23R mRNA and Polycystic Ovary Syndrome (PCOS), which is an autoimmune disease. Study included 42 PCOS patients and 37 female individuals with no diagnosis of PCOS. Mean age of patients was 24.73±6.16 and it was 24.22±5.22 for control. Different hormones including certain androgen hormones (Age, Body mass index, Luteinizing hormone, Estradiol,Testosterone,Dehydroepiandrosterone, Thyroid-Stimulating Hormone, Follicle-stimulating hormone) were evaluated. DNAs were isolated from the whole bloods of the same individuals, and by using these genomic DNAs, genotyping was performed through the rs10889677 polymorphism. As a result, odds ratios (OR) for AA, CA and CC genotypes, were found to be 1.06, 0.72, and 1.65, respectively. Although no statistically significant association has been determined for the study groups and the genotypes through chi-square test (p=0.07), OR values suggested a tendency for CC to cause a slight susceptibility for the disease.
Benzer Tezler
- Investigation of SNP (rs10889677) located at the miR-let-7e and let-7f binding site of the IL23R gene in coronary artery patients
Koroner arter hastalarına IL23R geninin miR-let-7e ve let-7f baĝlanma bölgesınde bulunan SNP (rs10889677) 'nın araştıfılması
THAMR OMER MUHAMAD MUHAMAD
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyomühendislikKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY
- İntrakraniyal anevrizma ile ilişkili gen polimorfizmlerinin Türk hastalarda incelenmesi
Investigation of gene polymorphisms associated with intracranial aneurysm in Turkish patients
AYŞEGÜL ERDEMİR
Doktora
Türkçe
2014
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK TURGUT BALIK
- Bor stresine maruz kalmış buğday bitkisine eksojen nitrik oksit (NO) ilavesinin fizyolojik etkilerinin incelenmesi
Investigation of physiologic effects of exogenous nitric oxide (NO) application on wheat exposed to boron stress
HAFİZE DİLEK TEPE
- Konya bölgesi tip 2 diabetes mellitus hastalarında calpain-10 geninin hastalık ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of association between type 2 diabetes mellitus and the gene for calpain-10 in konya region
HÜLYA ÖZDEMİR
Doktora
Türkçe
2012
Tıbbi BiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. A. BÜLENT TURHAN
- Prostat kanseri ile ilişkili olduğu düşünülen bazı gen polimorfizmlerinin Türk hastalarda incelenmesi
Investigation of some gene polymorphisms thought to be associated with prostate cancer in Turkish patients
EBRU ÖZKAN
Doktora
Türkçe
2014
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK TURGUT BALIK