Cancer testis gene expression as a biomarker of one-carbon metabolic activity, drug sensitivity and phenotypic heterogeneity in non-small cell lung cancer and malignant melanoma
Küçük hücre dışı akciğer kanseri ve malin melanom'da tek-karbon metabolik yolağı aktivitesi, ilaç hassasiyeti ve fenotipik heterojenite'nin biyo-belirteci olarak kanser-testis gen ifadesi
- Tez No: 436345
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİ OSMAY GÜRE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Moleküler Tıp, Onkoloji, Molecular Medicine, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 223
Özet
X kromozomu üzerinde bulunan kanser-testis (KT-X) genlerinin ifadesi tümörlerle sınırlı olup, normal yetişkin dokularında çok düşüktür veya hiç görülmez. KT-X gen ifadesi tümör heterojenitesine katkıda bulunan faktörlerden biridir ve küçük hücre dışı akciğer kanseri (KHDAK) ve malin melanom gibi birçok farklı kanser türünde değişen oranlarda görülmektedir. KT-X gene ifadesinin regülasyonu promotor bölge metilasyonu ile kuvvetlice ilişkilendirilmiş, buna karşın, promotor hipometilasyonunun neden olduğu tümörlerde sonradan ortaya çıkan KT-X geni ifade artışının altında yatan mekanizmalar henüz aydınlatılamamıştır. KT-X geni ifadesi gösteren tümörler, yüksek tümör evresi, büyük tümörler ve agresiflik ile ilişkilendirilmekle birlikte, KT-X pozitif ve KT-X negatif tümörlerdeki değişken ilaç hassasiyeti araştırılmamıştır. Bu tez çalışmasında, tek-karbon yolağı enzim polimorfizmlerinin KT-X geni ifadesi ile ilişkisi araştırılmıştır. Ayrıca, tümörlerde KT-X geni ifadesi ile birlikte farklı faktörlerin belirlediği değişik fenotipik alt gruplara karşı etkili olabilecek ilaçların belirlenebilmesi için birçok araç ve yöntem test edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Expression of cancer-testis (CT) genes on X chromosome (CT-X) is restricted to tumors, with very low or no expression in normal adult tissues. CT-X gene expression is one of the factors contributing to tumor heterogeneity and is variably observed in various types of cancers including non-small cell lung cancer (NSCLC) and malignant melanoma. Regulation of CT-X gene expression has been strongly linked to DNA methylation of promoter regions, however, mechanisms leading to re-expression of these genes in tumors, driven by promoter hypomethylation, is remained unsolved. Although tumors expressing CT-X genes are shown to be associated with higher tumor stage, larger tumors and aggressiveness, differential drug sensitivity of CT-X positive and negative tumors have not been investigated. In this thesis, we aimed to find the association between one-carbon pathway polymorphisms and CT-X gene expression. Moreover, we tested various tools and methods to find effective drugs for tumors in different phenotypic subgroups determined by CT-X gene expression or by other factors.
Benzer Tezler
- Cancer-testis gene expression as a biomarker of the genetic variation in the one carbon metabolic pathway
Bir karbon metabolik yolundaki genetik farklılıkların belirleyicisi olarak kanser-testis gen ifadesi
AHMET RASİM BARUTÇU
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ALİ OSMAY GÜRE
- RNF152 geninin oral kavite malin tümörlü ve premalin lezyonlu hastalarda epigenetik biyomarker potansiyelinin incelenmesi
Investigation of the epigenetic biomarker potential of the RNF152 gene in patients with oral cavity malignant tumors and premalignant lesions. İstanbul University
MADONA GJONA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA DEMOKAN
- Using gene expression profiles of cancer patients with image-based deep learning approach to develop methods for classification and prediction of cancer while revealing critical genes
Kanser hastalarının gen ifade verileri kullanılarak kanserde kritik genlerin tanımlanması, kanser sınıflandırılması ve tahmini için görüntü-tabanlı derin öprenme yaklaşımı
BÜŞRA NUR DARENDELİ KİRAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALPER YILMAZ
- Baş ve boyun kanserlerinde kök hücre izolasyonu karakterizasyonu ve microarray analizi ile gen ekspresyon profillerinin belirlenmesi
Head and neck cancer stem-cell isolation, characterization and microarray analysis of their gene expression profiles
ELİF NİHAN ÇETİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
GenetikTurgut Özal ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURADİYE ACAR
- Meme kanserli hastaların kan ve tükürük örneklerinde cullin7 seviyesinin araştırılması
Investigation of cullin7 level in blood and saliva samples of patients with breast cancer
CEREN TİLGEN YASASEVER
Doktora
Türkçe
2022
Biyokimyaİstanbul ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HADİYE DERYA DURANYILDIZ