Geri Dön

Dynamic alternative polyadenylation (APA) events in mammary gland development

Meme dokusu gelişimi sırasında dinamik alternatif poliadenilasyon (APA) olayları

  1. Tez No: 442172
  2. Yazar: GÜLTEN TUNCEL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

Meme dokusu bireyin yaş, hormon seviyelerindeki değişim ve üreme durumuna göre sürekli değişim halinde olan dinamik bir organdır. Meme dokusunun kapsamlı büyüme, yenilenme ve yeniden şekillenme yetisi, meme kanserinde deregüle olan moleküler mekanizmaları daha iyi anlayabilmek için özel ilgi görmektedir. Bu durumda, farklı uzunluklarda mesajcı RNA (mRNA) izoformlarının sentezlenmesine yol açan alternatif poliadenilasyon (APA) mekanizmasının meme dokusu gelişimi sırasında farklı şekillerde regüle olabileceği hipotezini öne sürdük. 3'UTR (transle olmayan bölge) izoformlarında varyasyona sebep olarak değişmiş protein seviyeleri ve/veya fonksiyonlarına neden olabilen APA'nın farklı doku ve değişim aşamalarına özel regüle edildiği bilinmektedir. Biz bu çalışmada in silico ve in vitro yaklaşımları kombinatoryal şekilde kullanarak meme gelişiminin hamilelik, emzirme ve geri çekilme süreçlerinde dinamik APA olaylarını tanımladık. Değişen 3'UTR izoformlarını doğrulayan deneysel çalışma sonuçlarımız da gerçekten meme dokusu gelişimi, APA ve meme kanseri arasındaki olası bağlantıyı gösterebilecek gelecek çalışmalar için ön veri sağlamıştır.

Özet (Çeviri)

Mammary gland is a dynamic organ that undergoes dramatic changes in response to age, circulating hormone levels and reproductive status. The extensive growth, regeneration and remodelling abilities of the mammary gland is of specific interest to better understand the molecular mechanisms deregulated in breast cancers. To this end, we hypothesized alternative polyadenylation (APA) as a mechanism that generates mRNA isoforms with different lengths, to be dynamically regulated at different stages of mammary development. APA is known to be regulated in a tissue and developmental stage specific manner and is linked to mRNA 3'UTR isoform variability, which may result in altered protein levels and/or functions. We used a combinatorial in silico and in vitro approach and delineated a dynamic pattern of APA in gestation, lactation and involution stages. Experimental confirmation of 3'UTR isoforms indeed provided preliminary data for future studies to provide a possible link between mammary tissue development, APA and breast cancer.

Benzer Tezler

  1. Characterization of sorting nexin 3 (SNX3) function

    Sorting nexin 3 (SNX3)'ün görevinin karakterizasyonu

    MERVE ÖYKEN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN

  2. Unravelling transcriptome 3'end diversity in an estrogen-responsive breast cancer cell line model

    Östrojene cevap veren bir meme kanseri hücre hattı modelinde transkriptomun 3' ucu çeşitliliğini aydınlatmak

    DİDEM NAZ DÖKEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN

  3. Dynamic alternative splicing events in the dorsolateral prefrontal cortex during adolescence-young adulthood period and implications for schizophrenia

    Ergenlik-erken yetişkinlik döneminde dorsolateral prefrontal kortekste gerçekleşen dinamik alternatif gen kırpılma olayları ve şizofreni ile ilgili çıkarımlar

    KÜBRA ÇELİKBAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Nörobilim Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TIMOTHEA TOULOPOULOU

  4. Acil tıp alanında serbest, açık erişimli tıp eğitiminin (FOAM) yeri

    The role of free, open access medical education (FOAM) in the field of emergency medicine

    ORHAN UTKU TÜRKER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Acil TıpOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Acil Tıp Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİH ÇALIŞKAN

  5. An ecological perspective towards translanguaging and teacher education in a preschool context

    Okul öncesi eğitimde dil alaşımına ve öğretmen eğitimine ekolojik yaklaşım

    ELİF AYDIN YAZICI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Eğitim ve ÖğretimBahçeşehir Üniversitesi

    Eğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. KENAN DİKİLİTAŞ