İmprinting defekti ile giden beckwith-wiedemann ve silver-russell sendromlarında metilasyon spesifik analiz yöntemlerinin rutin tanıda kullanılması
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 445306
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HAKAN ULUCAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Cerrahpaşa Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 109
Özet
Beckwith-Wiedemann sendromu ve Silver-Russell sendromu büyüme hızı açısından birbirinin zıt bulguları ile karakterize olan sendromlardır. BWS'nin başlıca bulguları pre-post natal makrozomi, dil büyüklüğü, kulakta çizgilenme veya pitler, visseromegali, hemihiperplazi ve artmış embriyonel tümör riskidir. SRS ise pre-post natal gelişim geriliği ile karakterizedir. BWS ve SRS'nin çoğunluğu kromozom 11p15.5 deki epigenetik değişiklikler ile ilişkilidir. Fetal ve post-natal büyümede rol oynayan iki adet farklı metile bölge (FMB) H19-FMB ve LIT1-FMB bu bölgede yer almaktadır. Ayrıca SRS hastalarının %10 unda kromozom 7'de maternal UPD görülmektedir. BWS hastalarının ancak %80 i, SRS hastalarının %50 si moleküler ve sitogenetik testlerle tanı almaktadır. Genetik tanı amacı ile etkin olan Metilasyon Spesifik-Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MS-MLPA) az sayıda laboratuarda kullanılmaktadır. Son çalışmalarda BWS ve SRS hastaları için metilasyon spesifik pirosekanslama (MS-Pirosekanslama) yapılmış ve BWS için genetik tanı koyma yüzdesinin % 95, SRS için genetik tanı koyma yüzdesinin %70'e yükseldiği gösterilmiştir. Çalışmamızda hastalarımızın genomik DNA örneklerinden MS-MLPA analizi yapıldı ve BWS klinik tanılı hastalarımızın %80'ine, SRS hastalarımızın ise %33.3'üne genetik tanı konuldu. Aynı gDNA'ler MS-Pirosekanslama yöntemi ile analiz edildi ve genetik tanı koyma yüzdesi BWS hastalarımızda %90'a yükseldi. SRS hastalarımızda ise, ikisinde sonuç doğrulandı, bir hastamızda MS-MLPA ile gösterdiğimiz metilasyon değişikliğinin yanlış olduğu ortaya konuldu ve yanlış pozitif sonuç düzeltilerek SRS hastalarımızın %22.2'sinin genetik tanısı doğrulandı. Bu çalışmada BWS ve SRS klinik tanılı hastalar için MS-Pirosekanslama yönteminin MS-MLPA'ya göre üstün olduğunu ortaya koymak ve rutin genetik laboratuarlarında kullanılabilirliğini göstermek, genotip-fenotip ilişkisinden yola çıkarak prognoz hakkında bilgi vermek ve hastalar ile ailelerine daha sağlıklı genetik danışma hizmeti vermek amaçlanmıştır.
Özet (Çeviri)
The syndromes of Beckwith-Wiedemann (BWS) and Silver-Russell (SRS) are characterized by opposite clinical findings. Main features of BWS are pre-postnatal macrosomia, macrogglossia, ear crease and/or pits, visceromegaly, abdominal wall defects, hemihyperplasia and increased risk for embryonal tumors. In contrast to these findings, SRS is characterized by prenatal and postnatal growth retardation. BWS and SRS are both associated with epigenetic alterations of chromosome 11p15.5. H19-DMR ve LIT1-DMR are two differntially metilated regions(DMR) which have crucial role in fetal and post natal development, exist in this region. Only 80% of BWS and 50% of SRS patients can be genetically diagnosed. Methylation-spesific Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification (MS-MLPA) is been used efficiently in a few laboratory. In current study, we utilized MS-MLPA in genomic DNAs of the our BWS and SRS patients. 80% of our BWS and 33.3 % of SRS patients were diagnosed genetically. Later we performed MS-Pyrosequencing in the same gDNAs and 90% of our BWS and 33 % of SRS patients were diagnosed genetically. In conclusion, we observed that the diagnostic value of Methylation Spesific-Pyrosequencing comparing with MS-MLPA was better and we demonsrated the MS-Pyrosequencing availability as routine genetic test as routine studies. In addition these process provide us giving appropriate genetic counselling to our patients.
Benzer Tezler
- Kıkırdak defekti ile seyreden kompozit defekt rekonstrüksiyonunda prelamine kondrokapsüler doku modeli oluşturulması: Deneysel çalışma
Creating a prelaminated chondrocapsular tissue model in composite defect reconstruction accompanied by cartilage tissue deficiency: an experimental study
YUSUF ALPER AYTAÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiKocaeli ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMRAH KAĞAN YAŞAR
- İndüksiyon ısıtma ile mikro ve nano desenlerin polimer yüzeylere baskılanması
Imprinting micro and nano patterns on polymer surfaces with induction heating
HAVVA DEMİRCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Kimya MühendisliğiGebze Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGÜN YÜCEL
- Bazı fenolik maddelerin silikajel üzerinde oluşturulacak polimerlerle baskılanması ve polimerlerin karakterizasyonu
Imprinting of some phenolic compounds by polymers formed on silicagel and polymeric characterization
NİLÜFER GÜNDOĞDU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Polimer Bilim ve TeknolojisiFırat ÜniversitesiKimya Bölümü
PROF. DR. MEHMET COŞKUN
- Üniversitelerde iz bırakma ve kurumsallaşma
Imprinting and institutionalization at universities
İNCİ ÖZTÜRK FİDAN
Doktora
Türkçe
2018
Eğitim ve ÖğretimAnkara ÜniversitesiEğitim Yönetimi ve Politikası Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ BALCI
- Bakteri ayrılması için moleküler baskılama temelli kriyojel membranlar
Molecular imprinting based cryogen membranes for bacteria separation
BURCU AKBULUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HANDAN YAVUZ ALAGÖZ