Doğu ve Güneydoğu Anadolu bölgelerinde doğadan izole edilen serbest yaşayan acanthamoeba türlerin tanısında mikroskobi, kültür ve moleküler yöntemlerin karşılaştırılması
The comparison of microscopy, culture and molecular methods used in diagnosis of free-living acanthamoeba species isolated from environment in east and south east regions
- Tez No: 445378
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL SONER KOLTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Parazitoloji, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 53
Özet
Acanthamoeba türlerinin doğal çevrede serbest halde bulunmasından dolayı, insanların bu parazitle enfekte olma riski büyüktür. Acanthamoeba türleri granülomatöz amibik ensefalit (GAE), kutanöz acanthamoebiasis, Acanthamoeba keratiti oluştururken, AIDS'li hastalarda enfeksiyonun çeşitli organlara yayılmasına bağlı olarak kronik sinüzit, otit, kutanöz lezyonlar, sinüs lezyonları, deri ülserleri gibi hastalıklar meydana getirirler. Bu çalışmada Türkiye'nin Doğu ve Güneydoğu bölgelerinde bulunan Diyarbakır, Batman, Mardin, Siirt, Bitlis ve Van illerindeki yüzme havuzlarından, kaplıca sularından, hamamlardan, sulama kanalından, park ve bahçelerden alınan toplam 65 su ve toprak örneğinin 6 tanesi mikroskobik inceleme yöntemi ile, 11 tanesi kültür yöntemi ile ve 15 tanesi konvansiyonel PCR ve real time PCR yöntemi ile Acanthamoeba spp. pozitif bulundu. Çalışmada Acanthamoeba spp. laboratuvar tanı yöntemlerinden kültür metodu; mikroskobi, konvansiyonel PCR ve real time PCR yöntemleri ile karşılaştırıldı. Kültür yönteminin mikroskobi, konvansiyonel PCR ve real time PCR yöntemlerine göre duyarlılığı sırası ile %100, %73,33, %73,33 ve özgüllüğü sırası ile %91,53, %100, %100 olarak saptandı. İncelenmesi yapılan ve Acanthamoeba spp. tanısı alan 15 örneğin kist yapılarını ve moleküler analizlerini değerlendirdiğimizde 4 (%26,67) Acanthamoeba castellanii, 3 (%20) Acanthamoeba polyphaga ve 8 tanesinin (%53,33) Acanthamoeba palestinensis olduğu belirlendi. Çalışmamız Güneydoğu Anadolu bölgesinde yapılan Acanthamoeba spp. ile ilgili ilk saha çalışması olup Acanthamoeba keratiti için doğal çevrede risk oluşturan türler tanımlandı.
Özet (Çeviri)
Due to the presence of Acanthamoeba species in the natural environment, people at risk of becoming infected with this parasite. Acanthamoeba species occur such as granulomatous amoebic encephalitis (GAE), cutaneous acanthamoebiasis, Acanthamoeba keratitis, AIDS, chronic sinusitis due to spread to various organs of the infection in patients with otitis, cutaneous lesions, sinus lesions,and skin ulcers. In this study, It was collected 65 water and soil samples from the environment in East and South East Anatolia regions located in Diyarbakir, Batman, Mardin, Siirt, Bitlis and Van provinces in Turkey of the swimming pool in the thermal springs, the baths, the irrigation canals, parks and the gardens. Six, 11 and 15 Acanthamoeba species found by microscopic examination, culture and conventional PCR and real time PCR methods, respectively. The sensitivity and specificity of culture methods were compared with microscopy, conventional PCR and real time PCR method for Acanthamoeba spp.; The sensitivity was found as 100%, 73,33%, 73,33% and specificity was found as 91,53%, 100% and 100%, respectively. When the investigation made and positively found by culture and molecular analysis 15 samples were evaluated in 4 (%26,67) Acanthamoeba castellanii, in 3 (%20) with Acanthamoeba polyphaga and in 8 (%53,33) with Acanthamoeba palestinensis. This is the first field study was conducted in South-East Anatolia on Acanthamoeba spp. at the molecular level and the positive samples were genotyped from the natural environment that pose a risk for Acanthamoeba keratitis.
Benzer Tezler
- Analysis of Triticum monococcum ssp. boeoticum accessions distributed over Turkey using AFLP markers and assessment of polymorphism levels of newly isolated SSR markers
Türkiye'de dağılım gösteren Triticum monococcum ssp. boeoticum alttürlerinin AFLP belirleyicisi kullanılarak genetik ilişkilendirilmesi ve yeni izole edilmiş SSR belirleyicilerinin polimorfizm seviyelerinin belirlenmesi
ELİF UZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MAHİNUR AKKAYA
PROF.DR. MERAL YÜCEL
- Göç ve kent: 1989'dan günümüze göç eden insanların kent adaptasyonu Diyarbakır örneği
Migration and urban: Urban adaptation of people who migrate, Diyarbakır model
YILMAZ CAN
- 1974-1999 yılları arasında Türkiye'deki tamamlanmış intiharların coğrafi yerleşim birimlerine ve cinsiyete göre dağılımı
The distribution of completed suicides in Turkey between 1974-1999 according to geographical residential units and gender
KAMİL ALPTEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
PsikiyatriAnkara ÜniversitesiDisiplinlerarası Sosyal Psikiyatri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIK SAYIL
- Atmosferik engellemenin türkiye üzerine etkileri: Klimatolojik analiz
Influences of atmospheric blocking over turkey: Climatological analysis
BAHTİYAR EFE
Doktora
İngilizce
2019
Meteorolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMeteoroloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ DENİZ
- Türk tütününde kadmiyumun nicel olarak saptanması
Başlık çevirisi yok
NİLGÜN OTO
Yüksek Lisans
Türkçe
1989
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SUNA DURU