Geri Dön

Human papillomavirus genotiplerinin pyrosequencing metodu ile tespiti

Detection of human papillomavirus genotypes BY pyrosequencing method

  1. Tez No: 445381
  2. Yazar: SERAP ÖZEN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FÜGEN YARKIN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Clinical Microbiology and Infectious Diseases
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 120

Özet

Human papillomavirus (HPV) servikal kanserin başlıca sebebidir. Bu çalışmanın amacı Çukurova Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Jinekoloji bölümüne başvuran kadınlarda HPV genotiplerinin pyrosequencing metodu ile tespitidir. Servikal sitoloji örnekleri 20-65 yaş arasındaki 1145 kadından toplanmıştır. HPV genotiplemesi için pyrosequencing metoduna dayanan HPV Sign PQ genotipleme testi (Diatech Pharmacogenetics, Italy) kullanılmıştır. Pyrosequencing PyroMark Q24 cihazında (Qiagen) yapılmıştır. HPV enfeksiyonunun prevalansı toplam 1145 kadında %20 (229) idi. Tek HPV enfeksiyonu ve çoklu HPV enfeksiyonu sırasıyla, çalışma grubunun %11.8'inde (136) ve %8.2'sinde (93) bulunmuştur. En baskın HPV genotipi HPV 16 (%9.4) olup bunu HPV 18 (%4.8) HPV 56 (%4), HPV 51 (%2.5), HPV 33 (%2.2), HPV 39 (%1.9), HPV 31 (%1.7), HPV 35 (%1.7), HPV 58 (%1.1), HPV 59 (%0.9), HPV 68 (%0.5), HPV 45 (%0.4), HPV 66 (%0.4) ve HPV 52 (%0.2 ) izlemiştir. Bu çalışmada en yaygın HPV tipleri olarak bulunan HPV 16 ve HPV 18 profilaktik HPV aşılarının hedefidir. Yeni jenerasyon dizi analizi metodu olan pyrosequencing test ile HPV genotiplerinin tanısı servikal kanser için risk altındaki kadınların tespitine katkı sağlayacaktır.

Özet (Çeviri)

Human papillomavirus (HPV) is the major cause of cervical cancer. The aim of this study was to detect HPV genotypes by pyrosequencing method among women attending the Department of Gynecology, Faculty of Medicine, Çukurova University. Cervical cytology samples were collected from 1145 women aged 20-65 years old. HPV Sign PQ genotyping test (Diatech Pharmacogenetics, Italy) based on pyrosequencing method was used for HPV genotyping. Pyrosequencing was performed on PyroMark Q24 instrument (Qiagen). The prevalence of HPV infection was 20% (229) in total 1145 women. Single HPV infection and multiple HPV infection was found in 11.8% (136) and 8.2% (93) of the study population, respectively. HPV 16 was the most prevalent HPV genotype (9.4%), followed by HPV 18 (4.8%), HPV 56 (4%), HPV 51 (2.5%), HPV 33 (2.2%), HPV 39 (1.9%), HPV 31 (1.7%), HPV 35 (1.7%), HPV 58 (1.1%), HPV 59 (0.9%), HPV 68 (0.5%), HPV 45 (0.4%), HPV 66 (0.4%) and HPV 52 (0.2%). HPV 16 and HPV 18 found as the most common HPV types in this study are targeted by prophylactic HPV vaccines. The diagnosis of HPV genotypes by pyrosequencing test which is a new generation sequencing method would contribute to identify women at risk for cervical cancer.

Benzer Tezler

  1. Uterin servikal kanser örneklerinde pyrosequencıng yöntemi ile human papillomavirus (HPV) genotiplerinin belirlenmesi

    Detection of human papillomavirus (HPV) genotypes by pyrosequencing method in uterine cervical cancer samples

    MESUT BELHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    DOÇ. DR. YASEMİN BULUT

  2. Servikal smear örneklerinde yüksek riskli human papillomavirüs genotiplerinin dağılımı ve ASC-US, LSIL, HSIL sonuçlarının değerlendirilmesi

    Distribution of high-risk human papillomavirus genotypes in cervical smear samples and evaluation of ASC-US, LSIL, HSIL results

    EYLÜL BEREN TANIK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYFER BAKIR

    UZMAN TUĞBA TAŞKIN TÜRKMENOĞLU

  3. Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Jinekoloji Bölümü'ne başvuran kadınlarda human papillomavirus genotiplerinin dağılımının araştırılması

    The investigation of human papillomavirus genotypes among women attending the Department of Gynecology, Faculty of Medicine, Çukurova University

    BUKET ŞEFLEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FÜGEN YARKIN

  4. Bölgemizde servikal kanser ve prekanseröz lezyonları olan kadınlarda onkojenik human papillomavirus genotiplerinin prevalansının belirlenmesi

    The detection of prevalence of oncogenic human papillomavirus genotypes among women with cervical cancer and precancerous lesions in our region

    DENİZ YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FÜGEN YARKIN

  5. Servı̇ks kanserı̇ tanılı hastaların parafı̇n bloklarından real tı̇me PCR yöntemı̇ ı̇le human papı̇llomavı̇rus(HPV) genotı̇plerı̇nı̇n araştırılması

    Investigation of human papillomavirus (HPV) genotypes from paraffin blocks of reverse time PCR methods in patients with cervical cancer

    HALİL ÖZTÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Kadın Hastalıkları ve DoğumGaziantep Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZCAN BALAT

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEYHUN SUCU